RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358813.4

CCL20-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 800 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-201ENST00000358813 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 KERAO60938 352 aa5.48□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 JRKO75564 520 aa5.48□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 GCATO75600 419 aa5.48□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 NFATC1O95644 943 aa5.48□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 PNPP00491 289 aa5.48□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 PENKP01210 267 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 CHRNA1P02708 482 aa5.48□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 KLRC2P26717 231 aa5.48□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 TMOD1P28289 359 aa5.48□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 KIF5BP33176 963 aa5.48□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 RYKP34925 604 aa5.48□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 IDUAP35475 653 aa5.48□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 CYP4F2P78329 520 aa5.48□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 BLOC1S1P78537 153 aa5.48□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 SLC14A1Q13336 389 aa5.48□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 ZNF273Q14593 569 aa5.48□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 CBWD6Q4V339 395 aa5.48□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 CBWD3Q5JTY5 395 aa5.48□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 GLRA4Q5JXX5 417 aa5.48□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 RAB12Q6IQ22 244 aa5.48□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa5.48□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 LINC00696Q6ZRV3 163 aa5.48□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 SLC24A5Q71RS6 500 aa5.48□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 CATSPER4Q7RTX7 472 aa5.48□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 IGFN1Q86VF2 1251 aa5.48□□□□□ -1.53
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CCL20-201ENST00000358813 ZNF619Q8N2I2 560 aa5.48□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 OR4N2Q8NGD1 307 aa5.48□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 ASB10Q8WXI3 467 aa5.48□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 PIBF1Q8WXW3 757 aa5.48□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 LENG9Q96B70 501 aa5.48□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 SLITRK1Q96PX8 696 aa5.48□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 NUDCD1Q96RS6 583 aa5.48□□□□□ -1.53
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CCL20-201ENST00000358813 MXRA8Q9BRK3 442 aa5.48□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 GPR88Q9GZN0 384 aa5.48□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 TMEM117Q9H0C3 514 aa5.48□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 POMKQ9H5K3 350 aa5.48□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa5.48□□□□□ -1.53
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CCL20-201ENST00000358813 SPG21Q9NZD8 308 aa5.48□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 STK39Q9UEW8 545 aa5.48□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 IL17BQ9UHF5 180 aa5.48□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 TMCC3Q9ULS5 477 aa5.48□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 ZNF148Q9UQR1 794 aa5.48□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 CEPT1Q9Y6K0 416 aa5.48□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 R4GN57 208 aa5.48□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 PTPRSQ13332 1948 aa5.48□□□□□ -1.53
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CCL20-201ENST00000358813 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 A0A0A0MQY5 61 aa5.47□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 A0A1W2PR77 199 aa5.47□□□□□ -1.53
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CCL20-201ENST00000358813 CXorf65A6NEN9 183 aa5.47□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 HIP1O00291 1037 aa5.47□□□□□ -1.53
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CCL20-201ENST00000358813 CXCL14O95715 111 aa5.47□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 BCL10O95999 233 aa5.47□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 LCKP06239 509 aa5.47□□□□□ -1.53
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CCL20-201ENST00000358813 SNHG28P0DPA3 235 aa5.47□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 GJA1P17302 382 aa5.47□□□□□ -1.53
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CCL20-201ENST00000358813 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 GRIK3Q13003 919 aa5.47□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 MEP1BQ16820 701 aa5.47□□□□□ -1.53
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CCL20-201ENST00000358813 LRIF1Q5T3J3 769 aa5.47□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 NAPRTQ6XQN6 538 aa5.47□□□□□ -1.53
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CCL20-201ENST00000358813 SPATA19Q7Z5L4 167 aa5.47□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 MRGPREQ86SM8 312 aa5.47□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 METTL13Q8N6R0 699 aa5.47□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa5.47□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 PROKR1Q8TCW9 393 aa5.47□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 ATP8B4Q8TF62 1192 aa5.47□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
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