RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348161.8

TOM1L1-201, Transcript of target of myb1 like 1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TOM1L1, Length 1,895 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1L1-201ENST00000348161 GALNT15Q8N3T1 639 aa14.95□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 OR5AR1Q8NGP9 310 aa14.95□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 GIMAP7Q8NHV1 300 aa14.95□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 LCN9Q8WX39 176 aa14.95□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 GPR22Q99680 433 aa14.95□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 MCMBPQ9BTE3 642 aa14.95□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 HGH1Q9BTY7 390 aa14.95□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa14.95□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 GPAMQ9HCL2 828 aa14.95□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 PCNX2A6NKB5 2137 aa14.95□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 ZBTB14O43829 449 aa14.95□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 KRT38O76015 456 aa14.95□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 JUPP14923 745 aa14.95□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 TAS2R39P59534 338 aa14.95□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 RAB42Q8N4Z0 105 aa14.95□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa14.95□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 SLC44A1Q8WWI5 657 aa14.95□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 NCSTNQ92542 709 aa14.95□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 PAFAH2Q99487 392 aa14.95□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 OLFM1Q99784 485 aa14.95□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 DPYSL5Q9BPU6 564 aa14.95□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 MATN4O95460 622 aa14.94□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 CATP04040 527 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 MPC1LP0DKB6 136 aa14.94□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 TYRP1P17643 537 aa14.94□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 CD1CP29017 333 aa14.94□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 SERPINB9P50453 376 aa14.94□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 MROH9Q5TGP6 573 aa14.94□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 NKAIN2Q5VXU1 208 aa14.94□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 ARMC6Q6NXE6 501 aa14.94□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 RAPH1Q70E73 1250 aa14.94□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 TMPRSS12Q86WS5 348 aa14.94□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa14.94□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 CNPY4Q8N129 248 aa14.94□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 OR4E2Q8NGC2 313 aa14.94□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 RAD51AP1Q96B01 352 aa14.94□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 SRMSQ9H3Y6 488 aa14.94□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 RDH14Q9HBH5 336 aa14.94□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 POPDC3Q9HBV1 291 aa14.94□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 RAB21Q9UL25 225 aa14.94□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 CLCA2Q9UQC9 943 aa14.94□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 A0A1W2PQM1 296 aa14.93□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 PROS1P07225 676 aa14.93□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP14.93□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 PRKAA1Q13131 559 aa14.93□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 HES3Q5TGS1 186 aa14.93□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 PLXDC1Q8IUK5 500 aa14.93□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 OR52E1Q8NGJ3 308 aa14.93□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 LINGO1Q96FE5 620 aa14.93□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 NFS1Q9Y697 457 aa14.93□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 KRT37O76014 449 aa14.93□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 C1orf105O95561 183 aa14.93□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 MT-CO3P00414 261 aa14.93□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 CNTFP26441 200 aa14.93□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 CRABP2P29373 138 aa14.93□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 RAB10P61026 200 aa14.93□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 SQSTM1Q13501 440 aa14.93□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 AMIGO1Q86WK6 493 aa14.93□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 OOSP2Q86WS3 158 aa14.93□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa14.93□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 ASB11Q8WXH4 323 aa14.93□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 DEPDC7Q96QD5 511 aa14.93□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 CAB39LQ9H9S4 337 aa14.93□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 HRASLS2Q9NWW9 162 aa14.93□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa14.93□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 ZNF180Q9UJW8 692 aa14.93□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 FAM221BA6H8Z2 402 aa14.92□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa14.92□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 ERLIN1O75477 346 aa14.92□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 SHMT2P34897 504 aa14.92□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 FOXC1Q12948 553 aa14.92□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 TMEM71Q6P5X7 295 aa14.92□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 CYHR1Q6ZMK1 362 aa14.92□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 CEP97Q8IW35 865 aa14.92□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 MCOLN3Q8TDD5 553 aa14.92□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 CAVIN3Q969G5 261 aa14.92□□□□□ -0.02
TOM1L1-201ENST00000348161 ZDHHC12Q96GR4 267 aa14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms