RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000339365.2

SEC24C-201, Transcript of SEC24 homolog C, COPII coat complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SEC24C, Length 4,513 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24C-201ENST00000339365 CPA2P48052 419 aa10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 ARHGAP8P85298 464 aa10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 PRMT9Q6P2P2 845 aa10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 USP53Q70EK8 1073 aa10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 OR6C4Q8NGE1 309 aa10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 BRINP2Q9C0B6 783 aa10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 COPG2Q9UBF2 871 aa10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 FETUBQ9UGM5 382 aa10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 PLLPQ9Y342 182 aa10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 PLXNB2O15031 1838 aa10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 MRASO14807 208 aa10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 TRIM24O15164 1050 aa10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 TIMP2P16035 220 aa10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 BPIP17213 487 aa10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 HRH2P25021 359 aa10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 SRP54P61011 504 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 HHEXQ03014 270 aa10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 SLC13A2Q13183 592 aa10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 ARHGAP40Q5TG30 622 aa10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 AGTRAPQ6RW13 159 aa10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 TRPV3Q8NET8 790 aa10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 EXD2Q9NVH0 621 aa10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 DLEC1Q9Y238 1755 aa10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 ERN1O75460 977 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 BPGMP07738 259 aa10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 ACRV1P26436 265 aa10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 FNTBP49356 437 aa10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 ARF5P84085 180 aa10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 NIPAL1Q6NVV3 410 aa10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 TP53INP2Q8IXH6 220 aa10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 GLIS1Q8NBF1 620 aa10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 OR2A12Q8NGT7 310 aa10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 SIGLEC10Q96LC7 697 aa10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 SYT11Q9BT88 431 aa10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 RASSF4Q9H2L5 321 aa10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 MARK1Q9P0L2 795 aa10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 CROTQ9UKG9 612 aa10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 ATAD5Q96QE3 1844 aa10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 GPR89AB7ZAQ6 455 aa10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 UBXN7O94888 489 aa10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 AHSGP02765 367 aa10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 GPR89BP0CG08 455 aa10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 RRM2P31350 389 aa10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 SLC26A3P40879 764 aa10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 MASP1P48740 699 aa10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 TFF2Q03403 129 aa10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 C2orf80Q0P641 193 aa10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 TRAF7Q6Q0C0 670 aa10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 CNTD1Q8N815 330 aa10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 WDR48Q8TAF3 677 aa10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 PYCR2Q96C36 320 aa10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 TSSK3Q96PN8 268 aa10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 FBXW2Q9UKT8 454 aa10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 FZD4Q9ULV1 537 aa10.59□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
SEC24C-201ENST00000339365 ZNF682O95780 498 aa10.58□□□□□ -0.72
SEC24C-201ENST00000339365 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
SEC24C-201ENST00000339365 LINC00032P0C843 101 aa10.58□□□□□ -0.72
SEC24C-201ENST00000339365 BDKRB1P46663 353 aa10.58□□□□□ -0.72
SEC24C-201ENST00000339365 CLDN2P57739 230 aa10.58□□□□□ -0.72
SEC24C-201ENST00000339365 CYP4F3Q08477 520 aa10.58□□□□□ -0.72
SEC24C-201ENST00000339365 MED21Q13503 144 aa10.58□□□□□ -0.72
SEC24C-201ENST00000339365 TMEM31Q5JXX7 168 aa10.58□□□□□ -0.72
SEC24C-201ENST00000339365 CPTPQ5TA50 214 aa10.58□□□□□ -0.72
SEC24C-201ENST00000339365 SYCE2Q6PIF2 218 aa10.58□□□□□ -0.72
SEC24C-201ENST00000339365 RANBP10Q6VN20 620 aa10.58□□□□□ -0.72
SEC24C-201ENST00000339365 ZYG11AQ6WRX3 759 aa10.58□□□□□ -0.72
SEC24C-201ENST00000339365 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
SEC24C-201ENST00000339365 NT5C3BQ969T7 300 aa10.58□□□□□ -0.72
SEC24C-201ENST00000339365 DTD2Q96FN9 168 aa10.58□□□□□ -0.72
SEC24C-201ENST00000339365 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa10.58□□□□□ -0.72
SEC24C-201ENST00000339365 DHRS7Q9Y394 339 aa10.58□□□□□ -0.72
SEC24C-201ENST00000339365 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa10.58□□□□□ -0.72
SEC24C-201ENST00000339365 ATP6AP2O75787 350 aa10.58□□□□□ -0.72
SEC24C-201ENST00000339365 IL9P15248 144 aa10.58□□□□□ -0.72
SEC24C-201ENST00000339365 CCR2P41597 374 aa10.58□□□□□ -0.72
SEC24C-201ENST00000339365 SLC14A2Q15849 920 aa10.58□□□□□ -0.72
SEC24C-201ENST00000339365 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa10.58□□□□□ -0.72
SEC24C-201ENST00000339365 TDRPQ86YL5 185 aa10.58□□□□□ -0.72
SEC24C-201ENST00000339365 KIAA1958Q8N8K9 716 aa10.58□□□□□ -0.72
SEC24C-201ENST00000339365 VPS33AQ96AX1 596 aa10.58□□□□□ -0.72
SEC24C-201ENST00000339365 KCNH6Q9H252 994 aa10.58□□□□□ -0.72
SEC24C-201ENST00000339365 HCN3Q9P1Z3 774 aa10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms