RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329276.9

NOP56-201, Transcript of NOP56 ribonucleoprotein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOP56, Length 2,400 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56-201ENST00000329276 U3KQV3 271 aa18.96■□□□□ 0.63
NOP56-201ENST00000329276 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
NOP56-201ENST00000329276 LDB2O43679 373 aa18.96■□□□□ 0.63
NOP56-201ENST00000329276 MITFO75030 526 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
NOP56-201ENST00000329276 CCR1P32246 355 aa18.96■□□□□ 0.63
NOP56-201ENST00000329276 DGKQP52824 942 aa18.96■□□□□ 0.63
NOP56-201ENST00000329276 TYSND1Q2T9J0 566 aa18.96■□□□□ 0.63
NOP56-201ENST00000329276 SPANXN2Q5MJ10 180 aa18.96■□□□□ 0.63
NOP56-201ENST00000329276 GALNT5Q7Z7M9 940 aa18.96■□□□□ 0.63
NOP56-201ENST00000329276 FATE1Q969F0 183 aa18.96■□□□□ 0.63
NOP56-201ENST00000329276 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
NOP56-201ENST00000329276 TRIM62Q9BVG3 475 aa18.96■□□□□ 0.63
NOP56-201ENST00000329276 TAS2R13Q9NYV9 303 aa18.96■□□□□ 0.63
NOP56-201ENST00000329276 EHD3Q9NZN3 535 aa18.96■□□□□ 0.63
NOP56-201ENST00000329276 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
NOP56-201ENST00000329276 CCL22O00626 93 aa18.95■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 PGLSO95336 258 aa18.95■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 CRYZL1O95825 349 aa18.95■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 TRAPPC2P0DI81 140 aa18.95■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 TRAPPC2BP0DI82 140 aa18.95■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 KIAA0040Q15053 153 aa18.95■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa18.95■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 GALNT12Q8IXK2 581 aa18.95■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa18.95■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 SETD6Q8TBK2 473 aa18.95■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 GTF2H4Q92759 462 aa18.95■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 NCLNQ969V3 563 aa18.95■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 PYCR2Q96C36 320 aa18.95■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 PYURFQ96I23 114 aa18.95■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 ITCHQ96J02 903 aa18.95■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 TBATAQ96M53 351 aa18.95■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 HACL1Q9UJ83 578 aa18.95■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 SATB2Q9UPW6 733 aa18.95■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 MCM3APO60318 1980 aa18.95■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 ASB14A6NK59 587 aa18.95■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 FAM220BPB1ANY3 271 aa18.95■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 PEX10O60683 326 aa18.95■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 SEC22BO75396 215 aa18.95■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 DBTP11182 482 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 MAGP20916 626 aa18.95■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 KRT20P35900 424 aa18.95■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 LIPAP38571 399 aa18.95■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 CD86P42081 329 aa18.95■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 MFSD10Q14728 455 aa18.95■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 STARD3Q14849 445 aa18.95■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP18.95■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 TSNQ15631 228 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 IQCF2Q8IXL9 164 aa18.95■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 ZMIZ2Q8NF64 920 aa18.95■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 MAU2Q9Y6X3 613 aa18.95■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 DSCR3O14972 297 aa18.94■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 STC1P52823 247 aa18.94■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 MAPKAPK3Q16644 382 aa18.94■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 XKR4Q5GH76 650 aa18.94■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 ATG9BQ674R7 924 aa18.94■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 SAMD7Q7Z3H4 446 aa18.94■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 HORMAD1Q86X24 394 aa18.94■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 TMCO6Q96DC7 493 aa18.94■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 CRTAC1Q9NQ79 661 aa18.94■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa18.94■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 OR4F21O95013 312 aa18.94■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 IGLV3-25P01717 112 aa18.94■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 AKAP5P24588 427 aa18.94■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 MAGEA11P43364 429 aa18.94■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 ELP6Q0PNE2 266 aa18.94■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 C19orf57Q0VDD7 668 aa18.94■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 SIRPB2Q5JXA9 342 aa18.94■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa18.94■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 WSCD1Q658N2 575 aa18.94■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 PAQR3Q6TCH7 311 aa18.94■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 AHSA2Q719I0 299 aa18.94■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 SNX20Q7Z614 316 aa18.94■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 CDYL2Q8N8U2 506 aa18.94■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 DNAJB8Q8NHS0 232 aa18.94■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 TMEM246Q9BRR3 403 aa18.94■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 RHNO1Q9BSD3 238 aa18.94■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 CATSPERZQ9NTU4 200 aa18.94■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 RNF19AQ9NV58 838 aa18.94■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 GALPQ9UBC7 116 aa18.94■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa18.94■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 WDR90Q96KV7 1748 aa18.94■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 RHOBTB1O94844 696 aa18.93■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 SERPINA1P01009 418 aa18.93■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 CYP4B1P13584 511 aa18.93■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 DAPP51397 102 aa18.93■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 SYT16Q17RD7 645 aa18.93■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 FBXO43Q4G163 708 aa18.93■□□□□ 0.62
NOP56-201ENST00000329276 RUNDC3AQ59EK9 446 aa18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72 ms