RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299608.6

TMX3-201, Transcript of thioredoxin related transmembrane protein 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMX3, Length 4,927 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3-201ENST00000299608 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP10.48□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 PRPS2P11908 318 aa10.48□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 ZNF30P17039 623 aa10.48□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 BDKRB1P46663 353 aa10.48□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 PREPP48147 710 aa10.48□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 LIPEQ05469 1076 aa10.48□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 IRF5Q13568 498 aa10.48□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 SLC9A4Q6AI14 798 aa10.48□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 HIPK1Q86Z02 1210 aa10.48□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 PARP8Q8N3A8 854 aa10.48□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 IGSF8Q969P0 613 aa10.48□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 ZIC5Q96T25 663 aa10.48□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 FEM1AQ9BSK4 669 aa10.48□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 MCM8Q9UJA3 840 aa10.48□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 GRID2O43424 1007 aa10.47□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 CCR8P51685 355 aa10.47□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 RASGRP3Q8IV61 690 aa10.47□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 DEPDC4Q8N2C3 294 aa10.47□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 OR10A6Q8NH74 314 aa10.47□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 LMO3Q8TAP4 145 aa10.47□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 GPR151Q8TDV0 419 aa10.47□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 CRISPLD1Q9H336 500 aa10.47□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 VRTNQ9H8Y1 702 aa10.47□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 ERGIC3Q9Y282 383 aa10.47□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 KERAO60938 352 aa10.47□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 ECI2O75521 394 aa10.47□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 GGT5P36269 586 aa10.47□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 MTX3Q5HYI7 312 aa10.47□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 PDZK1Q5T2W1 519 aa10.47□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 METTL21CQ5VZV1 264 aa10.47□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 COX18Q8N8Q8 333 aa10.47□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 OR10H5Q8NGA6 315 aa10.47□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa10.47□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa10.47□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 PCDH7O60245 1069 aa10.47□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 STC2O76061 302 aa10.47□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 ANPEPP15144 967 aa10.47□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 PNLIPRP1P54315 467 aa10.47□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 C11orf88Q6PI97 169 aa10.47□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 GALNT5Q7Z7M9 940 aa10.47□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 PEX5LQ8IYB4 626 aa10.47□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 BANPQ8N9N5 519 aa10.47□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 LPGAT1Q92604 370 aa10.47□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 Q96MT0 163 aa10.47□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 NUAK2Q9H093 628 aa10.47□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 CA14Q9ULX7 337 aa10.47□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa10.47□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 TPST2O60704 377 aa10.47□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 RANBP1P43487 201 aa10.47□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 RAB8AP61006 207 aa10.47□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 PCDH1Q08174 1060 aa10.47□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 TRIQKQ629K1 86 aa10.47□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 FAM91A1Q658Y4 838 aa10.47□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 SLC8B1Q6J4K2 584 aa10.47□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 SMPDL3AQ92484 453 aa10.47□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 EFCAB11Q9BUY7 163 aa10.47□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 LGALS13Q9UHV8 139 aa10.47□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 C15orf41Q9Y2V0 281 aa10.47□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 REM1O75628 298 aa10.46□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 IL7RP16871 459 aa10.46□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 CTSKP43235 329 aa10.46□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 DEFB103AP81534 67 aa10.46□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 NFKB2Q00653 900 aa10.46□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 LGALS3BPQ08380 585 aa10.46□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 C1orf61Q13536 156 aa10.46□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 PTCHD4Q6ZW05 846 aa10.46□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa10.46□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 PROSER1Q86XN7 944 aa10.46□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 TDRPQ86YL5 185 aa10.46□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 OVCA2Q8WZ82 227 aa10.46□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 YIPF4Q9BSR8 244 aa10.46□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa10.46□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 HCN3Q9P1Z3 774 aa10.46□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 NUMA1Q14980 2115 aa10.46□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa10.46□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 EFCAB10A6NFE3 127 aa10.46□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 MAGEB17A8MXT2 336 aa10.46□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 IFNW1P05000 195 aa10.46□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 IL12BP29460 328 aa10.46□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 TM4SF4P48230 202 aa10.46□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 KRT77Q7Z794 578 aa10.46□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 PIGKQ92643 395 aa10.46□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 ALG2Q9H553 416 aa10.46□□□□□ -0.73
TMX3-201ENST00000299608 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms