RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282074.6

SPC25-201, Transcript of SPC25, NDC80 kinetochore complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPC25, Length 1,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC25-201ENST00000282074 AP1M1Q9BXS5 423 aa11.61□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 SRMSQ9H3Y6 488 aa11.61□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 EPS8L2Q9H6S3 715 aa11.61□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 BPIFA1Q9NP55 256 aa11.61□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 IL26Q9NPH9 171 aa11.61□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 OLAHQ9NV23 265 aa11.61□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 IP6K2Q9UHH9 426 aa11.61□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 CSAG2Q9Y5P2 127 aa11.61□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa11.61□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 MRFAP1Q9Y605 127 aa11.61□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 CSMD2Q7Z408 3487 aa11.61□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 PCNX1Q96RV3 2341 aa11.6□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 PCSK5Q92824 1860 aa11.6□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 MGAT4DA6NG13 374 aa11.6□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 KCNK1O00180 336 aa11.6□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 CBSLP0DN79 551 aa11.6□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 ST6GAL1P15907 406 aa11.6□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 CBSP35520 551 aa11.6□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 HMGCLP35914 325 aa11.6□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 CTSCP53634 463 aa11.6□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 DPYSL3Q14195 570 aa11.6□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 BRD3Q15059 726 aa11.6□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 PDK2Q15119 407 aa11.6□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 PPP2R5EQ16537 467 aa11.6□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 PCSK7Q16549 785 aa11.6□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 FNBP1LQ5T0N5 605 aa11.6□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa11.6□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 RHBDD2Q6NTF9 364 aa11.6□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 IGFL2Q6UWQ7 119 aa11.6□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 SPNS3Q6ZMD2 512 aa11.6□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa11.6□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 MRGPRGQ86SM5 289 aa11.6□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 CNTD1Q8N815 330 aa11.6□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 DDHD1Q8NEL9 900 aa11.6□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 ACVR1CQ8NER5 493 aa11.6□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 PROKR1Q8TCW9 393 aa11.6□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 LRRN4Q8WUT4 740 aa11.6□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 CPLX3Q8WVH0 158 aa11.6□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 ZNF670Q9BS34 389 aa11.6□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 PITPNM3Q9BZ71 974 aa11.6□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 HAUS4Q9H6D7 363 aa11.6□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 TACC2O95359 2948 aa11.59□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP11.59□□□□□ -0.555e-13■□□□□ 11.3
SPC25-201ENST00000282074 UGT1A9O60656 530 aa11.59□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 OR2B3O76000 313 aa11.59□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP11.59□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 NDST3O95803 873 aa11.59□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 UGT1A6P19224 532 aa11.59□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 MSH3P20585 1137 aa11.59□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 CAPN3P20807 821 aa11.59□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 UGT1A1P22309 533 aa11.59□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 UGT1A4P22310 534 aa11.59□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 SSTR2P30874 369 aa11.59□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 GBE1Q04446 702 aa11.59□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 ITGA9Q13797 1035 aa11.59□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 ASIC2Q16515 512 aa11.59□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa11.59□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 C1orf189Q5VU69 101 aa11.59□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 RPTNQ6XPR3 784 aa11.59□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 HOOK3Q86VS8 718 aa11.59□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 OR2L2Q8NH16 312 aa11.59□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 VPS50Q96JG6 964 aa11.59□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 CCM2Q9BSQ5 444 aa11.59□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 SLC25A51Q9H1U9 297 aa11.59□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 TRABDQ9H4I3 376 aa11.59□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 UGT1A7Q9HAW7 530 aa11.59□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 UGT1A10Q9HAW8 530 aa11.59□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 UGT1A8Q9HAW9 530 aa11.59□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 TXLNGQ9NUQ3 528 aa11.59□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 ANKRD12Q6UB98 2062 aa11.58□□□□□ -0.56
SPC25-201ENST00000282074 CCDC88CQ9P219 2028 aa11.58□□□□□ -0.56
SPC25-201ENST00000282074 CCDC151A5D8V7 595 aa11.58□□□□□ -0.56
SPC25-201ENST00000282074 C2orf74A8MZ97 194 aa11.58□□□□□ -0.56
SPC25-201ENST00000282074 MYO1FO00160 1098 aa11.58□□□□□ -0.56
SPC25-201ENST00000282074 MASP2O00187 686 aa11.58□□□□□ -0.56
SPC25-201ENST00000282074 AURKAO14965 403 aa11.58□□□□□ -0.56
SPC25-201ENST00000282074 MCM3P25205 808 aa11.58□□□□□ -0.56
SPC25-201ENST00000282074 AKT1P31749 480 aa11.58□□□□□ -0.56
SPC25-201ENST00000282074 SPAM1P38567 509 aa11.58□□□□□ -0.56
SPC25-201ENST00000282074 ARSEP51690 589 aa11.58□□□□□ -0.56
SPC25-201ENST00000282074 GNG11P61952 73 aa11.58□□□□□ -0.56
SPC25-201ENST00000282074 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
SPC25-201ENST00000282074 ZBTB17Q13105 803 aa11.58□□□□□ -0.56
SPC25-201ENST00000282074 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
SPC25-201ENST00000282074 SLC14A2Q15849 920 aa11.58□□□□□ -0.56
SPC25-201ENST00000282074 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa11.58□□□□□ -0.56
SPC25-201ENST00000282074 GPRC6AQ5T6X5 926 aa11.58□□□□□ -0.56
SPC25-201ENST00000282074 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms