RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273317.4

LIMD1-201, Transcript of LIM domains containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LIMD1, Length 11,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-201ENST00000273317 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 FIBCD1Q8N539 461 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 ZNF527Q8NB42 609 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 OR10G6Q8NH81 332 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 LPGAT1Q92604 370 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 TSSK3Q96PN8 268 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 TAPBPLQ9BX59 468 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 EQTNQ9NQ60 294 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 ABCG2Q9UNQ0 655 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 MYO7AQ13402 2215 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 XKP51811 444 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 IL17AQ16552 155 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 IDNKQ5T6J7 187 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 CPT1BQ92523 772 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 SLC35G5Q96KT7 338 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 IFT27Q9BW83 186 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 TCF7L1Q9HCS4 588 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 TMEM9Q9P0T7 183 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 MAU2Q9Y6X3 613 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 EPHB6O15197 1021 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 PRLP01236 227 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 PSKH1P11801 424 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 TRIM36Q9NQ86 728 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 SPTBP11277 2137 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 WNT10BO00744 389 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 SLC7A4O43246 635 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 GLUD1P00367 558 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 VARSP26640 1264 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 ADCYAP1R1P41586 468 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 CASP7P55210 303 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 C2orf80Q0P641 193 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 SLC1A5Q15758 541 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 DACT2Q5SW24 774 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 FITM2Q8N6M3 262 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 DMRTB1Q96MA1 342 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 TMED5Q9Y3A6 229 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 A0A1W2PQH9 124 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 NFATC1O95644 943 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 C8BP07358 591 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 APLP1P51693 650 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 ERVK-8P63133 956 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 SYCE2Q6PIF2 218 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 ZNF227Q86WZ6 799 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 PRRG4Q9BZD6 226 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 TNKS2Q9H2K2 1166 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 NUP50Q9UKX7 468 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 TLR5O60602 858 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 CCR8P51685 355 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 INHBEP58166 350 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 EFR3AQ14156 821 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 SPERTQ8NA61 448 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 LRTOMTQ8WZ04 291 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 TESCQ96BS2 214 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 ATP6AP2O75787 350 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 YES1P07947 543 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 AVPR1BP47901 424 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 MAN2A2P49641 1150 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 DCDC1P59894 354 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 CYP1B1Q16678 543 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 CACUL1Q86Y37 369 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 TIGD4Q8IY51 512 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 NIPA2Q8N8Q9 360 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 XAGE5Q8WWM1 108 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 HCN3Q9P1Z3 774 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 DAPL1A0PJW8 107 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 POP4O95707 220 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 AKT2P31751 481 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 SEMA5AQ13591 1074 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 SF1Q15637 639 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 ELMO3Q96BJ8 720 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 MARCH7Q9H992 704 aa7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 CACNA1CQ13936 2221 aa7.84□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 PIRTP0C851 137 aa7.84□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 CTNNB1P35222 781 aa7.84□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 CLCN2P51788 898 aa7.84□□□□□ -1.15
LIMD1-201ENST00000273317 CRISP3P54108 245 aa7.84□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms