RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 DGKBQ9Y6T7 804 aa21.72■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 M0QX08 132 aa21.71■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC28A1O00337 649 aa21.71■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 RAD51BO15315 384 aa21.71■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 HS6ST1O60243 411 aa21.71■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 XYLBO75191 536 aa21.71■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 GABARAPO95166 117 aa21.71■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 ATG9BQ674R7 924 aa21.71■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 DPY30Q9C005 99 aa21.71■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 CLMPQ9H6B4 373 aa21.71■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 TAPBPO15533 448 aa21.71■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 COQ9O75208 318 aa21.71■■□□□ 1.07
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HTATSF1-201ENST00000218364 PGRP06401 933 aa21.71■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 ACOX1Q15067 660 aa21.71■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 TRIM16LQ309B1 348 aa21.71■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 LDLRAP1Q5SW96 308 aa21.71■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 GLB1LQ6UWU2 654 aa21.71■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 TAS2R42Q7RTR8 314 aa21.71■■□□□ 1.07
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HTATSF1-201ENST00000218364 FRS2Q8WU20 508 aa21.71■■□□□ 1.07
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HTATSF1-201ENST00000218364 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa21.71■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM220BPB1ANY3 271 aa21.7■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 SYN3O14994 580 aa21.7■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 TLR5O60602 858 aa21.7■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 CREG1O75629 220 aa21.7■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 ITGAMP11215 1152 aa21.7■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 ACVR2AP27037 513 aa21.7■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 CDK5R2Q13319 367 aa21.7■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 CTXN3Q4LDR2 81 aa21.7■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 SPANXN4Q5MJ08 99 aa21.7■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 HIPK1Q86Z02 1210 aa21.7■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 CHPFQ8IZ52 775 aa21.7■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 EFHBQ8N7U6 833 aa21.7■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 FAR1Q8WVX9 515 aa21.7■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 TBCDQ9BTW9 1192 aa21.7■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 INVSQ9Y283 1065 aa21.7■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 RAD23AP54725 363 aa21.7■■□□□ 1.06
HTATSF1-201ENST00000218364 TRIM46Q7Z4K8 759 aa21.7■■□□□ 1.06
HTATSF1-201ENST00000218364 ARL10Q8N8L6 244 aa21.7■■□□□ 1.06
HTATSF1-201ENST00000218364 DNAJB8Q8NHS0 232 aa21.7■■□□□ 1.06
HTATSF1-201ENST00000218364 SPATA17Q96L03 361 aa21.7■■□□□ 1.06
HTATSF1-201ENST00000218364 CEP295NLQ96MC4 621 aa21.7■■□□□ 1.06
HTATSF1-201ENST00000218364 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
HTATSF1-201ENST00000218364 ELOVL2Q9NXB9 296 aa21.7■■□□□ 1.06
HTATSF1-201ENST00000218364 GIN1Q9NXP7 522 aa21.7■■□□□ 1.06
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa21.7■■□□□ 1.06
HTATSF1-201ENST00000218364 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
HTATSF1-201ENST00000218364 WDR47O94967 919 aa21.7■■□□□ 1.06
HTATSF1-201ENST00000218364 PRKACGP22612 351 aa21.7■■□□□ 1.06
HTATSF1-201ENST00000218364 NR4A1P22736 598 aa21.7■■□□□ 1.06
HTATSF1-201ENST00000218364 OR1G1P47890 313 aa21.7■■□□□ 1.06
HTATSF1-201ENST00000218364 GZMMP51124 257 aa21.7■■□□□ 1.06
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HTATSF1-201ENST00000218364 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP21.7■■□□□ 1.06
HTATSF1-201ENST00000218364 WDR37Q9Y2I8 494 aa21.7■■□□□ 1.06
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HTATSF1-201ENST00000218364 PTGES3LE9PB15 166 aa21.69■■□□□ 1.06
HTATSF1-201ENST00000218364 GNPDA1P46926 289 aa21.69■■□□□ 1.06
HTATSF1-201ENST00000218364 HSPA7P48741 367 aa21.69■■□□□ 1.06
HTATSF1-201ENST00000218364 LIX1Q8N485 282 aa21.69■■□□□ 1.06
HTATSF1-201ENST00000218364 S100ZQ8WXG8 99 aa21.69■■□□□ 1.06
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
HTATSF1-201ENST00000218364 MTRRQ9UBK8 725 aa21.69■■□□□ 1.06
HTATSF1-201ENST00000218364 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
HTATSF1-201ENST00000218364 OARD1Q9Y530 152 aa21.69■■□□□ 1.06
HTATSF1-201ENST00000218364 ILVBLA1L0T0 632 aa21.69■■□□□ 1.06
HTATSF1-201ENST00000218364 AXIN1O15169 862 aa21.69■■□□□ 1.06
HTATSF1-201ENST00000218364 PTPRRQ15256 657 aa21.69■■□□□ 1.06
HTATSF1-201ENST00000218364 CLLU1OSQ5K130 101 aa21.69■■□□□ 1.06
HTATSF1-201ENST00000218364 CACHD1Q5VU97 1274 aa21.69■■□□□ 1.06
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HTATSF1-201ENST00000218364 DAPK2Q9UIK4 370 aa21.69■■□□□ 1.06
HTATSF1-201ENST00000218364 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
HTATSF1-201ENST00000218364 GREB1Q4ZG55 1949 aa21.68■■□□□ 1.06
HTATSF1-201ENST00000218364 KRBA1A5PL33 1030 aa21.68■■□□□ 1.06
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC22A1O15245 554 aa21.68■■□□□ 1.06
HTATSF1-201ENST00000218364 E2F6O75461 281 aa21.68■■□□□ 1.06
HTATSF1-201ENST00000218364 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
HTATSF1-201ENST00000218364 MINDY2Q8NBR6 621 aa21.68■■□□□ 1.06
HTATSF1-201ENST00000218364 TAMM41Q96BW9 452 aa21.68■■□□□ 1.06
HTATSF1-201ENST00000218364 TBC1D20Q96BZ9 403 aa21.68■■□□□ 1.06
HTATSF1-201ENST00000218364 IL17CQ9P0M4 197 aa21.68■■□□□ 1.06
HTATSF1-201ENST00000218364 OR6C75A6NL08 312 aa21.68■■□□□ 1.06
HTATSF1-201ENST00000218364 BCKDKO14874 412 aa21.68■■□□□ 1.06
HTATSF1-201ENST00000218364 PFKLP17858 780 aa21.68■■□□□ 1.06
HTATSF1-201ENST00000218364 RPS24P62847 133 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
HTATSF1-201ENST00000218364 GTDC1Q4AE62 458 aa21.68■■□□□ 1.06
HTATSF1-201ENST00000218364 LRIF1Q5T3J3 769 aa21.68■■□□□ 1.06
HTATSF1-201ENST00000218364 NETO1Q8TDF5 533 aa21.68■■□□□ 1.06
HTATSF1-201ENST00000218364 B3GALT6Q96L58 329 aa21.68■■□□□ 1.06
HTATSF1-201ENST00000218364 NECTIN3Q9NQS3 549 aa21.68■■□□□ 1.06
HTATSF1-201ENST00000218364 ORC6Q9Y5N6 252 aa21.68■■□□□ 1.06
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