RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027404.11

Ptprn-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptprn, Length 3,554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mocs1Q5RKZ7 636 aa15.8■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1085Q7TR64 313 aa15.8■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 B3galnt2Q8BG28 504 aa15.8■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Atg10Q8R1P4 215 aa15.8■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr348Q8VGK3 313 aa15.8■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1250Q8VGM3 314 aa15.8■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 HnrnpllQ921F4 591 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dhrs1Q99L04 313 aa15.8■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gstt3Q99L20 241 aa15.8■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Atoh8Q99NA2 322 aa15.8■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ndufaf4Q9D1H6 173 aa15.8■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rdh11Q9QYF1 316 aa15.8■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Epb41l1Q9Z2H5 879 aa15.8■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Baz2bA2AUY4 2123 aa15.79■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Esp31A8R0W3 114 aa15.79■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm6569D3YTM9 175 aa15.79■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 2210016F16RikG3X8U3 338 aa15.79■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ppef1O35655 650 aa15.79■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Arl6O88848 186 aa15.79■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 P01668 110 aa15.79■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tekt4Q149S1 447 aa15.79■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 CrxosQ3UL53 246 aa15.79■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ipcef1Q5DU31 406 aa15.79■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Brsk1Q5RJI5 778 aa15.79■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kir3dl2Q673W2 388 aa15.79■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gpr17Q6NS65 339 aa15.79■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Znf513Q6PD29 541 aa15.79■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Maml1Q6T264 1020 aa15.79■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pnpla8Q8K1N1 776 aa15.79■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PolbQ8K409 335 aa15.79■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fam20bQ8VCS3 409 aa15.79■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Taf12Q8VE65 161 aa15.79■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 CatsperzQ9CQP8 194 aa15.79■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 MispQ9D279 648 aa15.79■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn2r35E9Q7U8 861 aa15.79■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kpna6O35345 536 aa15.79■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Orm2P07361 207 aa15.79■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Smpdl3aP70158 445 aa15.79■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 NogP97466 232 aa15.79■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Trappc9Q3U0M1 1148 aa15.79■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zbtb2Q3V3W4 514 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pou4f2Q63934 411 aa15.79■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nudcd1Q6PIP5 582 aa15.79■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 R3hcc1lQ8BJM3 775 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Eme1Q8BJW7 570 aa15.79■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Prdm8Q8BZ97 687 aa15.79■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dpy30Q99LT0 99 aa15.79■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmem9Q9CR23 183 aa15.79■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mcm8Q9CWV1 833 aa15.79■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ccdc81Q9D5W4 654 aa15.79■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Oas1eA0A0J9YV76 386 aa15.79■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 P01669 111 aa15.79■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 CtsdP18242 410 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mxd4Q60948 209 aa15.79■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cdh7Q8BM92 785 aa15.79■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr985Q8VGB4 311 aa15.79■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Msh4Q99MT2 958 aa15.79■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dph2Q9CR25 489 aa15.79■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Q9CZV2 255 aa15.79■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 CutalQ9D1U5 156 aa15.79■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pak1ip1Q9DCE5 382 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gipc2Q9Z2H7 314 aa15.79■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mterf1bB9EJ57 379 aa15.78■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pdzd8B9EJ80 1147 aa15.78■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn2r21K7N6Y7 853 aa15.78■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn2r20L7N2B1 853 aa15.78■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Stx7O70439 261 aa15.78■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 ApoeP08226 311 aa15.78■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ifrd1P19182 449 aa15.78■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Etv4P28322 485 aa15.78■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gpr149Q3UVY1 732 aa15.78■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fam149b1Q6NSV7 578 aa15.78■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Syt14Q7TN84 555 aa15.78■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 4921511C20RikQ8BVT7 469 aa15.78■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Txndc11Q8K2W3 948 aa15.78■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sirt3Q8R104 334 aa15.78■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc29a4Q8R139 528 aa15.78■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 AclyQ91V92 1091 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cryl1Q99KP3 319 aa15.78■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Haus5Q9D786 619 aa15.78■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tor1aQ9ER39 333 aa15.78■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmem8aQ9ESN3 769 aa15.78■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pkp3Q9QY23 797 aa15.78■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1215A3KGY3 312 aa15.78■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zfp992B1ASD8 573 aa15.78■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn2r73D3Z7M3 851 aa15.78■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Spaca6E9Q8Q8 339 aa15.78■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc9a3G3X939 829 aa15.78■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fkbp7O54998 218 aa15.78■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Esr1P19785 599 aa15.78■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ccbe1Q3MI99 408 aa15.78■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ltbp3Q61810 1268 aa15.78■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr169Q7TS53 313 aa15.78■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Phf11aQ8BVM9 293 aa15.78■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zfp991Q8R1N3 573 aa15.78■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 KmoQ91WN4 479 aa15.78■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Npffr2Q924H0 417 aa15.78■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 GhdcQ99J23 532 aa15.78■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 ArhgdiaQ99PT1 204 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rfc5Q9D0F6 339 aa15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 38.5 ms