RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 PITPNM3Q9BZ71 974 aa24.2■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 OR52A5Q9H2C5 316 aa24.2■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 FAM96AQ9H5X1 160 aa24.2■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 SHANK1Q9Y566 2161 aa24.2■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 ESPL1Q14674 2120 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 GSAPA4D1B5 854 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM150CB9EJG8 249 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 CFAP99D6REC4 459 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 BTN3A3O00478 584 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 ST6GAL1P15907 406 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 ITGALP20701 1170 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 CYP2A7P20853 494 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 PSMB4P28070 264 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 ITGA1P56199 1179 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 FAM198BQ6UWH4 519 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 SNX20Q7Z614 316 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 SYTL1Q8IYJ3 562 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 FDCSPQ8NFU4 85 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 ACTL9Q8TC94 416 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 NRTNQ99748 197 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 COG4Q9H9E3 785 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 BTN3A1O00481 513 aa24.18■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 HADHAP40939 763 aa24.18■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 VAV2P52735 878 aa24.18■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 COPS2P61201 443 aa24.18■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 TMPRSS15P98073 1019 aa24.18■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 PRPSAP1Q14558 356 aa24.18■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC181Q5TID7 509 aa24.18■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 DENND5AQ6IQ26 1287 aa24.18■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 LURAP1LQ8IV03 231 aa24.18■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 SERTAD3Q9UJW9 196 aa24.18■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 TFR2Q9UP52 801 aa24.18■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 MAP3K7O43318 606 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 DPM1O60762 260 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 CD151P48509 253 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 LMAN1P49257 510 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 GPR33Q49SQ1 333 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 MED25Q71SY5 747 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 ZBTB2Q8N680 514 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 OR52E1Q8NGJ3 308 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 NUDT9Q9BW91 350 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 MVB12BQ9H7P6 319 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 ARNT2Q9HBZ2 717 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 EFR3BQ9Y2G0 817 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 CCL22O00626 93 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF185O15231 689 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 LDB2O43679 373 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 PDHA2P29803 388 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 NCF4Q15080 339 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 PTCHD3Q3KNS1 767 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 SARM1Q6SZW1 724 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 HPS6Q86YV9 775 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 Q8NA96 180 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 GLIS1Q8NBF1 620 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 PHC3Q8NDX5 983 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 KCNN4O15554 427 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 STK10O94804 968 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 RBP3P10745 1247 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 PVRP15151 417 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 MC4RP32245 332 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 RPA4Q13156 261 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 AMIGO1Q86WK6 493 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC110Q8TBZ0 833 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 SPATA13Q96N96 652 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 TBL1YQ9BQ87 522 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 KLHL25Q9H0H3 589 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 VPS37BQ9H9H4 285 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 MACROD2A1Z1Q3 448 aa24.14■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 A6NL46 340 aa24.14■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 C2orf74A8MZ97 194 aa24.14■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 E7EQ34 232 aa24.14■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 PJA2O43164 708 aa24.14■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF749O43361 778 aa24.14■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 SEMA7AO75326 666 aa24.14■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 ACRV1P26436 265 aa24.14■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
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