RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616074.4

TRAPPC3-208, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,114 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-208ENST00000616074 HEXDCQ8WVB3 486 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC3-208ENST00000616074 CPT1BQ92523 772 aa20.18■□□□□ 0.82
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TRAPPC3-208ENST00000616074 C19orf43Q9BQ61 176 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC3-208ENST00000616074 SLC25A23Q9BV35 468 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC3-208ENST00000616074 ING2Q9H160 280 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC3-208ENST00000616074 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC3-208ENST00000616074 ACSS2Q9NR19 701 aa20.18■□□□□ 0.82
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TRAPPC3-208ENST00000616074 RORAP35398 523 aa20.17■□□□□ 0.82
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TRAPPC3-208ENST00000616074 PGDP52209 483 aa20.17■□□□□ 0.82
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TRAPPC3-208ENST00000616074 TRIM5Q9C035 493 aa20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC3-208ENST00000616074 ARNT2Q9HBZ2 717 aa20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC3-208ENST00000616074 MLXIPLQ9NP71 852 aa20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC3-208ENST00000616074 PCMTD2Q9NV79 361 aa20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa20.17■□□□□ 0.82
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TRAPPC3-208ENST00000616074 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
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TRAPPC3-208ENST00000616074 RAB40ALP0C0E4 278 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC3-208ENST00000616074 GP1BBP13224 206 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC3-208ENST00000616074 ACRV1P26436 265 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC3-208ENST00000616074 PDHA2P29803 388 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC3-208ENST00000616074 UQCRFS1P47985 274 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC3-208ENST00000616074 PREPP48147 710 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC3-208ENST00000616074 LMAN1P49257 510 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC3-208ENST00000616074 GPR33Q49SQ1 333 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC3-208ENST00000616074 NADK2Q4G0N4 442 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC3-208ENST00000616074 SERPINA9Q86WD7 417 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC3-208ENST00000616074 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC3-208ENST00000616074 PHC3Q8NDX5 983 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC3-208ENST00000616074 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC3-208ENST00000616074 PITPNM3Q9BZ71 974 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC3-208ENST00000616074 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
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TRAPPC3-208ENST00000616074 DUSP10Q9Y6W6 482 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC3-208ENST00000616074 SOWAHDA6NJG2 315 aa20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC3-208ENST00000616074 CAPN1P07384 714 aa20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC3-208ENST00000616074 RWDD2BP57060 319 aa20.15■□□□□ 0.82
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TRAPPC3-208ENST00000616074 SYTL1Q8IYJ3 562 aa20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC3-208ENST00000616074 CPT1CQ8TCG5 803 aa20.15■□□□□ 0.82
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TRAPPC3-208ENST00000616074 KLHL25Q9H0H3 589 aa20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC3-208ENST00000616074 XKR8Q9H6D3 395 aa20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC3-208ENST00000616074 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC3-208ENST00000616074 SYTL2Q9HCH5 934 aa20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC3-208ENST00000616074 TCFL5Q9UL49 500 aa20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC3-208ENST00000616074 PCSK5Q92824 1860 aa20.15■□□□□ 0.82
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TRAPPC3-208ENST00000616074 H7C0S8 307 aa20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 TMEM63AO94886 807 aa20.14■□□□□ 0.81
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TRAPPC3-208ENST00000616074 MSL3P1P0C860 447 aa20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 PVRP15151 417 aa20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 CYP2A7P20853 494 aa20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 CD151P48509 253 aa20.14■□□□□ 0.81
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TRAPPC3-208ENST00000616074 KCTD11Q693B1 232 aa20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 TAS2R42Q7RTR8 314 aa20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa20.14■□□□□ 0.81
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TRAPPC3-208ENST00000616074 HGH1Q9BTY7 390 aa20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 MVB12BQ9H7P6 319 aa20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 VPS37BQ9H9H4 285 aa20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 SHANK1Q9Y566 2161 aa20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 BLACEA4D250 179 aa20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 C2orf74A8MZ97 194 aa20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 VPS4BO75351 444 aa20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 CEACAM4O75871 244 aa20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 TPH1P17752 444 aa20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 GNLYP22749 145 aa20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 RPA4Q13156 261 aa20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 PRKG2Q13237 762 aa20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 AMIGO1Q86WK6 493 aa20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 PIANPQ8IYJ0 282 aa20.13■□□□□ 0.81
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