RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613246.4

PTPRJ-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 7,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-207ENST00000613246 FCER2P06734 321 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 MPSTP25325 297 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC44A3Q8N4M1 653 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 SEC61A2Q9H9S3 476 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 VARSP26640 1264 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 ADORA2AP29274 412 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 DSG2Q14126 1118 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 C2orf76Q3KRA6 126 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 PCYOX1Q9UHG3 505 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 CALCAP01258 141 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 FNTBP49356 437 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 PSEN2P49810 448 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC38A3Q99624 504 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 TAS2R3Q9NYW6 316 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 TRIM64CA6NLI5 447 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 CD47Q08722 323 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 CDT1Q9H211 546 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 GNG13Q9P2W3 67 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 CLEC6AQ6EIG7 209 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 LIX1Q8N485 282 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 KCTD7Q96MP8 289 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 HMGXB4Q9UGU5 601 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 HERV-K104P61576 105 aa18.33■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 TUBA1BP68363 451 aa18.33■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 GCNT1Q02742 428 aa18.33■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 TUBA1AQ71U36 451 aa18.33■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa18.33■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 CENPMQ9NSP4 180 aa18.33■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 KCTD5Q9NXV2 234 aa18.33■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC39A1Q9NY26 324 aa18.33■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 RP2O75695 350 aa18.33■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 FGF1P05230 155 aa18.33■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 LAPTM5Q13571 262 aa18.33■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 C3orf33Q6P1S2 294 aa18.33■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 RHPN2P1A8MT19 583 aa18.33■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 TET3O43151 1660 aa18.33■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 DNAJA2O60884 412 aa18.33■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 CREG2Q8IUH2 290 aa18.33■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC25A36Q96CQ1 311 aa18.33■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 SPATA7Q9P0W8 599 aa18.33■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 LCN1P31025 176 aa18.33■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 MED27Q6P2C8 311 aa18.33■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 KLHL36Q8N4N3 616 aa18.33■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 RNF157Q96PX1 679 aa18.33■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 LRRC7Q96NW7 1537 aa18.33■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 RPP14O95059 124 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 PLGLB1Q02325 96 aa18.33■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 PLEKHG6Q3KR16 790 aa18.33■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 PHTF2Q8N3S3 785 aa18.33■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 OR10A6Q8NH74 314 aa18.33■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 PCDH18Q9HCL0 1135 aa18.33■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 C1orf109Q9NX04 203 aa18.33■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 WASF3Q9UPY6 502 aa18.33■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF510Q9Y2H8 683 aa18.33■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 KCNQ2O43526 872 aa18.33■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 TMEM110Q86TL2 294 aa18.33■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 JAGN1Q8N5M9 183 aa18.33■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 MATN2O00339 956 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 TIGD4Q8IY51 512 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 SVOPLQ8N434 492 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 SEC14L1Q92503 715 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF347Q96SE7 839 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 TVP23BQ9NYZ1 205 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 TIMM22Q9Y584 194 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 ARPC2O15144 300 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 HEPACAMQ14CZ8 416 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF558Q96NG5 402 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 OR10A4Q9H209 315 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 E9PAM4 449 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC6A4P31645 630 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 OXR1Q8N573 874 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC37A3Q8NCC5 494 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 THEM6Q8WUY1 208 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 MYO19Q96H55 970 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 RNF38Q9H0F5 515 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 ERVK-7P63135 1459 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 HSBP1L1C9JCN9 74 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 IL33O95760 270 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC35G6P0C7Q6 338 aa18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.6 ms