RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611151.4

RAB18-208, Transcript of RAB18, member RAS oncogene family, human

TSL 5 BASIC

Gene RAB18, Length 4,931 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB18-208	ENST00000611151	EBF3	Q9H4W6	596 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	B3GALT2	O43825	422 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	ZNF30	P17039	623 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	CLCNKA	P51800	687 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	XKR4	Q5GH76	650 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	DCAF12L1	Q5VU92	463 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	HEATR4	Q86WZ0	1026 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	FAM46D	Q8NEK8	389 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	RASSF5	Q8WWW0	418 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	ZBED6CL	Q96FA7	236 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	CIB1	Q99828	191 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	ZNF358	Q9NW07	568 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	CMTM6	Q9NX76	183 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	FADS3	Q9Y5Q0	445 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	HAS3	O00219	553 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	LEFTY2	O00292	366 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	EFNA1	P20827	205 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	MTHFR	P42898	656 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	FOLH1	Q04609	750 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	ZNF33A	Q06730	810 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	MED22	Q15528	200 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	CLPTM1L	Q96KA5	538 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	PDP1	Q9P0J1	537 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	RHAG	Q02094	409 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	DPY19L1	Q2PZI1	675 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	ALKBH2	Q6NS38	261 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	ADCY4	Q8NFM4	1077 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	SLC13A3	Q8WWT9	602 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	EHD3	Q9NZN3	535 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	SLC17A6	Q9P2U8	582 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	SCEL	O95171	688 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	RPL5	P46777	297 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	DHPS	P49366	369 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	RALGPS1	Q5JS13	557 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	EOGT	Q5NDL2	527 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	RPTN	Q6XPR3	784 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	FAM47B	Q8NA70	645 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	TTL	Q8NG68	377 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	GON4L	Q3T8J9	2241 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	KPNA4	O00629	521 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	KDELR3	O43731	214 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	POP7	O75817	140 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	HERVK_113	P63132	956 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	REP15	Q6BDI9	236 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	CLDN19	Q8N6F1	224 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	OR10A6	Q8NH74	314 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	ZHX1-C8orf76	Q96EF9	292 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	ERVK-6	Q9BXR3	956 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	CRNN	Q9UBG3	495 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	COPS7A	Q9UBW8	275 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	TSC22D4	Q9Y3Q8	395 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	TNFRSF11B	O00300	401 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	IMPDH1	P20839	514 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	ALDH4A1	P30038	563 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	AVPR1B	P47901	424 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	HNMT	P50135	292 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	IDH3A	P50213	366 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	MCEMP1	Q8IX19	187 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	SIX5	Q8N196	739 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	ROPN1L	Q96C74	230 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	OTUB2	Q96DC9	234 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	TMEM248	Q9NWD8	314 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	XKRY	O14609	159 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	WBP4	O75554	376 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	FABP3	P05413	133 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	ZNF8	P17098	575 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	IRF9	Q00978	393 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	BNIP1	Q12981	228 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	SLBP	Q14493	270 aa	Known RBP eCLIP	13.54	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	DDI2	Q5TDH0	399 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	CXXC5	Q7LFL8	322 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	GJD3	Q8N144	294 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	USP29	Q9HBJ7	922 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	SPATA2	Q9UM82	520 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151		A0A0G2JN53	185 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	TMEM150C	B9EJG8	249 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	PRAMEF11	O60813	436 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	MMP20	O60882	483 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	UBXN7	O94888	489 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	SIX3	O95343	332 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24

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