RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591600.1

APOC4-201, Transcript of apolipoprotein C4, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene APOC4, Length 348 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-201ENST00000591600 APOL2Q9BQE5 337 aa14.91□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 TLR10Q9BXR5 811 aa14.91□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 OSBPL8Q9BZF1 889 aa14.91□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 TSPY26PQ9H489 355 aa14.91□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 MVB12BQ9H7P6 319 aa14.91□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 COG4Q9H9E3 785 aa14.91□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 VPS37BQ9H9H4 285 aa14.91□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa14.91□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 FAM8A1Q9UBU6 413 aa14.91□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 TCFL5Q9UL49 500 aa14.91□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 VPS4AQ9UN37 437 aa14.91□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 ANKRD12Q6UB98 2062 aa14.91□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 CCDC66A2RUB6 948 aa14.9□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 ARGFXA6NJG6 315 aa14.9□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 PJA2O43164 708 aa14.9□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 MAP3K7O43318 606 aa14.9□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 CAPN1P07384 714 aa14.9□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 PTGIRP43119 386 aa14.9□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 PREPP48147 710 aa14.9□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 CCL11P51671 97 aa14.9□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 ABRQ12979 859 aa14.9□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 OLIG2Q13516 323 aa14.9□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 CPZQ66K79 652 aa14.9□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 LCN10Q6JVE6 187 aa14.9□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa14.9□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 MED25Q71SY5 747 aa14.9□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 EFCAB3Q8N7B9 438 aa14.9□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 OR1L3Q8NH93 324 aa14.9□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 CPT1CQ8TCG5 803 aa14.9□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 NAT14Q8WUY8 206 aa14.9□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 LRRC45Q96CN5 670 aa14.9□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 CLIP3Q96DZ5 547 aa14.9□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 FERD3LQ96RJ6 166 aa14.9□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 PCMTD2Q9NV79 361 aa14.9□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 SERTAD3Q9UJW9 196 aa14.9□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 SNX7Q9UNH6 387 aa14.9□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 ESPL1Q14674 2120 aa14.9□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
APOC4-201ENST00000591600 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
APOC4-201ENST00000591600 BTN3A3O00478 584 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC4-201ENST00000591600 KCNN4O15554 427 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC4-201ENST00000591600 TMEM63AO94886 807 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC4-201ENST00000591600 TJP3O95049 919 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC4-201ENST00000591600 HBQ1P09105 142 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC4-201ENST00000591600 ST6GAL1P15907 406 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC4-201ENST00000591600 CTNNA2P26232 953 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC4-201ENST00000591600 ACRV1P26436 265 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC4-201ENST00000591600 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
APOC4-201ENST00000591600 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC4-201ENST00000591600 KCTD11Q693B1 232 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC4-201ENST00000591600 ZNF449Q6P9G9 518 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC4-201ENST00000591600 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
APOC4-201ENST00000591600 SARM1Q6SZW1 724 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC4-201ENST00000591600 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
APOC4-201ENST00000591600 OR52E1Q8NGJ3 308 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC4-201ENST00000591600 CCDC110Q8TBZ0 833 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC4-201ENST00000591600 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC4-201ENST00000591600 TBL1YQ9BQ87 522 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC4-201ENST00000591600 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC4-201ENST00000591600 FAM96AQ9H5X1 160 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC4-201ENST00000591600 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
APOC4-201ENST00000591600 TFR2Q9UP52 801 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC4-201ENST00000591600 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC4-201ENST00000591600 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC4-201ENST00000591600 ICE1Q9Y2F5 2266 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC4-201ENST00000591600 NUP210LQ5VU65 1888 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC4-201ENST00000591600 GSAPA4D1B5 854 aa14.88□□□□□ -0.03
APOC4-201ENST00000591600 C2orf74A8MZ97 194 aa14.88□□□□□ -0.03
APOC4-201ENST00000591600 TMEM150CB9EJG8 249 aa14.88□□□□□ -0.03
APOC4-201ENST00000591600 BTN3A1O00481 513 aa14.88□□□□□ -0.03
APOC4-201ENST00000591600 AP2A2O94973 939 aa14.88□□□□□ -0.03
APOC4-201ENST00000591600 PSMA3P25788 255 aa14.88□□□□□ -0.03
APOC4-201ENST00000591600 MC4RP32245 332 aa14.88□□□□□ -0.03
APOC4-201ENST00000591600 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
APOC4-201ENST00000591600 CETN2P41208 172 aa14.88□□□□□ -0.03
APOC4-201ENST00000591600 VAV2P52735 878 aa14.88□□□□□ -0.03
APOC4-201ENST00000591600 RWDD2BP57060 319 aa14.88□□□□□ -0.03
APOC4-201ENST00000591600 TMPRSS15P98073 1019 aa14.88□□□□□ -0.03
APOC4-201ENST00000591600 CHAF1BQ13112 559 aa14.88□□□□□ -0.03
APOC4-201ENST00000591600 NADK2Q4G0N4 442 aa14.88□□□□□ -0.03
APOC4-201ENST00000591600 FAM198BQ6UWH4 519 aa14.88□□□□□ -0.03
APOC4-201ENST00000591600 AMIGO1Q86WK6 493 aa14.88□□□□□ -0.03
APOC4-201ENST00000591600 SYTL1Q8IYJ3 562 aa14.88□□□□□ -0.03
APOC4-201ENST00000591600 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa14.88□□□□□ -0.03
APOC4-201ENST00000591600 GLIS1Q8NBF1 620 aa14.88□□□□□ -0.03
APOC4-201ENST00000591600 DHRS4Q9BTZ2 278 aa14.88□□□□□ -0.03
APOC4-201ENST00000591600 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa14.88□□□□□ -0.03
APOC4-201ENST00000591600 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
APOC4-201ENST00000591600 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
APOC4-201ENST00000591600 PCSK5Q92824 1860 aa14.88□□□□□ -0.03
APOC4-201ENST00000591600 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
APOC4-201ENST00000591600 PCM1Q15154 2024 aa14.87□□□□□ -0.03
APOC4-201ENST00000591600 BLACEA4D250 179 aa14.87□□□□□ -0.03
APOC4-201ENST00000591600 BTNL10A8MVZ5 291 aa14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms