RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590509.5

PTPRS-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRS, Length 893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-208ENST00000590509 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
PTPRS-208ENST00000590509 HEY1Q9Y5J3 304 aa15.48■□□□□ 0.07
PTPRS-208ENST00000590509 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
PTPRS-208ENST00000590509 PKDREJQ9NTG1 2253 aa15.48■□□□□ 0.07
PTPRS-208ENST00000590509 MX2P20592 715 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRS-208ENST00000590509 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
PTPRS-208ENST00000590509 AGXTP21549 392 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRS-208ENST00000590509 TSFMP43897 325 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
PTPRS-208ENST00000590509 TDGF1P3P51864 188 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRS-208ENST00000590509 PER3P56645 1201 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRS-208ENST00000590509 ADCY2Q08462 1091 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRS-208ENST00000590509 Q0VFX4 171 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRS-208ENST00000590509 TESK1Q15569 626 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRS-208ENST00000590509 PPP2R5EQ16537 467 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRS-208ENST00000590509 SIRPB2Q5JXA9 342 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRS-208ENST00000590509 LDLRAP1Q5SW96 308 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRS-208ENST00000590509 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
PTPRS-208ENST00000590509 OR52E1Q8NGJ3 308 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRS-208ENST00000590509 PPP4R1Q8TF05 950 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRS-208ENST00000590509 CNDP1Q96KN2 507 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRS-208ENST00000590509 OLFM3Q96PB7 478 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRS-208ENST00000590509 DHRS4Q9BTZ2 278 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRS-208ENST00000590509 TRIM8Q9BZR9 551 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRS-208ENST00000590509 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRS-208ENST00000590509 TMEM63CQ9P1W3 806 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRS-208ENST00000590509 SERTAD3Q9UJW9 196 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRS-208ENST00000590509 FBXL4Q9UKA2 621 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRS-208ENST00000590509 PADI2Q9Y2J8 665 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRS-208ENST00000590509 A0A087X0T9 212 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRS-208ENST00000590509 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRS-208ENST00000590509 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRS-208ENST00000590509 A0A1W2PQJ5 194 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRS-208ENST00000590509 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
PTPRS-208ENST00000590509 PEX12O00623 359 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRS-208ENST00000590509 SOCS6O14544 535 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRS-208ENST00000590509 KLHL18O94889 574 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRS-208ENST00000590509 FAM228BP0C875 321 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRS-208ENST00000590509 KDELR1P24390 212 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRS-208ENST00000590509 CDC16Q13042 620 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRS-208ENST00000590509 GSE1Q14687 1217 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRS-208ENST00000590509 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
PTPRS-208ENST00000590509 CDSNQ15517 529 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRS-208ENST00000590509 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
PTPRS-208ENST00000590509 RHBDD2Q6NTF9 364 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRS-208ENST00000590509 FAM20CQ8IXL6 584 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRS-208ENST00000590509 PARP9Q8IXQ6 854 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRS-208ENST00000590509 CFAP206Q8IYR0 622 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRS-208ENST00000590509 DTWD1Q8N5C7 304 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRS-208ENST00000590509 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRS-208ENST00000590509 ZFPM2Q8WW38 1151 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRS-208ENST00000590509 LCN9Q8WX39 176 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRS-208ENST00000590509 RELTQ969Z4 430 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRS-208ENST00000590509 TAAR6Q96RI8 345 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRS-208ENST00000590509 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
PTPRS-208ENST00000590509 SRMSQ9H3Y6 488 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRS-208ENST00000590509 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRS-208ENST00000590509 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
PTPRS-208ENST00000590509 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRS-208ENST00000590509 ITPR3Q14573 2671 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRS-208ENST00000590509 CCDC66A2RUB6 948 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRS-208ENST00000590509 C19orf84I3L1E1 186 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRS-208ENST00000590509 AGPSO00116 658 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRS-208ENST00000590509 MYO1FO00160 1098 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRS-208ENST00000590509 DIAPH2O60879 1101 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRS-208ENST00000590509 JRKO75564 520 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRS-208ENST00000590509 IPO13O94829 963 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
PTPRS-208ENST00000590509 SLC35G4P0C7Q5 338 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRS-208ENST00000590509 TPBGLP0DKB5 382 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRS-208ENST00000590509 PTPN3P26045 913 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRS-208ENST00000590509 PDHA2P29803 388 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRS-208ENST00000590509 AKT1P31749 480 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRS-208ENST00000590509 WNT3AP56704 352 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRS-208ENST00000590509 PRKAA1Q13131 559 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRS-208ENST00000590509 PRKG2Q13237 762 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRS-208ENST00000590509 ART3Q13508 389 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRS-208ENST00000590509 PDK2Q15119 407 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRS-208ENST00000590509 HADHQ16836 314 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
PTPRS-208ENST00000590509 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
PTPRS-208ENST00000590509 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
PTPRS-208ENST00000590509 ACVR1CQ8NER5 493 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRS-208ENST00000590509 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRS-208ENST00000590509 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRS-208ENST00000590509 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
PTPRS-208ENST00000590509 PTERQ96BW5 349 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRS-208ENST00000590509 CCDC120Q96HB5 630 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRS-208ENST00000590509 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
PTPRS-208ENST00000590509 MRGPRX2Q96LB1 330 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRS-208ENST00000590509 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
PTPRS-208ENST00000590509 IP6K3Q96PC2 410 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRS-208ENST00000590509 FERD3LQ96RJ6 166 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRS-208ENST00000590509 SYTL2Q9HCH5 934 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRS-208ENST00000590509 HAUS2Q9NVX0 235 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRS-208ENST00000590509 SPHK1Q9NYA1 384 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRS-208ENST00000590509 ACTR10Q9NZ32 417 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRS-208ENST00000590509 OR2B3O76000 313 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRS-208ENST00000590509 MSH3P20585 1137 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRS-208ENST00000590509 DCDP81605 110 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
PTPRS-208ENST00000590509 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
PTPRS-208ENST00000590509 OLIG2Q13516 323 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRS-208ENST00000590509 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 92.5 ms