RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-215ENST00000583289 OR6C75A6NL08 312 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 HHLA1C9JL84 531 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 TPP1O14773 563 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 SYN3O14994 580 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 HDAC3O15379 428 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 NVLO15381 856 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 MFSD11O43934 449 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 PSMG1O95456 288 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 CBX6O95503 412 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 HSPA4LO95757 839 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 JCHAINP01591 159 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 IGLV3-25P01717 112 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 FYNP06241 537 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 C2P06681 752 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 STMN1P16949 149 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 FPR1P21462 350 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 CALRP27797 417 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 PSMB4P28070 264 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 CST5P28325 142 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 TKTP29401 623 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 HOXC13P31276 330 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 PBX3P40426 434 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 MLH1P40692 756 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 PSMC4P43686 418 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 GPR3P46089 330 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 MTNR1BP49286 362 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 NDUFV1P49821 464 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 RPL14P50914 215 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 CLCNKBP51801 687 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 HUNKP57058 714 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 DNAJB13P59910 316 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 ACTR3P61158 418 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 STX5Q13190 355 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 MTM1Q13496 603 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 HERC3Q15034 1050 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 ARHGEF6Q15052 776 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 MAPRE2Q15555 327 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 CYP2A13Q16696 494 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 FAM83EQ2M2I3 478 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 RAB6CQ53S08 254 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 ZNF618Q5T7W0 954 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 LIPMQ5VYY2 423 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 RGMBQ6NW40 437 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 ZFP1Q6P2D0 407 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 EPGNQ6UW88 154 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 C16orf89Q6UX73 402 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 RANBP10Q6VN20 620 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 ZYG11AQ6WRX3 759 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 RAPH1Q70E73 1250 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 SLC24A5Q71RS6 500 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 KCNMB4Q86W47 210 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 SLC22A9Q8IVM8 553 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 CNTN4Q8IWV2 1026 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 NUP93Q8N1F7 819 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 PYROXD2Q8N2H3 581 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 MPP5Q8N3R9 675 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 DCLK2Q8N568 766 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 OR52K1Q8NGK4 314 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 OR6Y1Q8NGX8 325 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 ACTRT2Q8TDY3 377 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 CLEC4CQ8WTT0 213 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 DNAJC9Q8WXX5 260 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 ZNF599Q96NL3 588 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 AGAP3Q96P47 875 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 GPR22Q99680 433 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 TBL1YQ9BQ87 522 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 HEPHQ9BQS7 1158 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 AIFM2Q9BRQ8 373 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 RTKNQ9BST9 563 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 CCDC106Q9BWC9 280 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 FSD1LQ9BXM9 530 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 DRC3Q9H069 523 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 RAB6CQ9H0N0 254 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 SLC25A51Q9H1U9 297 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 SMOC2Q9H3U7 446 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 CXorf56Q9H5V9 222 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 LDAHQ9H6V9 325 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 EFCAB1Q9HAE3 211 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 PLAC1Q9HBJ0 212 aa4.52□□□□□ -1.69
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