RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572010.5

SLC12A4-208, Transcript of solute carrier family 12 member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SLC12A4, Length 1,016 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4-208ENST00000572010 GPR83Q9NYM4 423 aa20.62■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 AGAP14A8MT82 685 aa20.61■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 C2orf74A8MZ97 194 aa20.61■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 C9J4A7 227 aa20.61■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 E7EQ34 232 aa20.61■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa20.61■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 SGTAO43765 313 aa20.61■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 STK10O94804 968 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 APOC2P02655 101 aa20.61■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 MSL3P1P0C860 447 aa20.61■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 CTNNA2P26232 953 aa20.61■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 HADHBP55084 474 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 ITGA1P56199 1179 aa20.61■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 XIAPP98170 497 aa20.61■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 BBS12Q6ZW61 710 aa20.61■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 SNX20Q7Z614 316 aa20.61■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 RAB43Q86YS6 212 aa20.61■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 CNGA4Q8IV77 575 aa20.61■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 GPR135Q8IZ08 494 aa20.61■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 NXPE1Q8N323 547 aa20.61■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 NUDT9Q9BW91 350 aa20.61■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 GOLPH3Q9H4A6 298 aa20.61■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 FAM96AQ9H5X1 160 aa20.61■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 MVB12BQ9H7P6 319 aa20.61■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 LUZP4Q9P127 313 aa20.61■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 PADI2Q9Y2J8 665 aa20.61■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 BTN3A3O00478 584 aa20.6■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 ST6GAL1P15907 406 aa20.6■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 ADRA1AP35348 466 aa20.6■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 CD151P48509 253 aa20.6■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 LMAN1P49257 510 aa20.6■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 PTCHD3Q3KNS1 767 aa20.6■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 GPR33Q49SQ1 333 aa20.6■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa20.6■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa20.6■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 FAM69BQ5VUD6 431 aa20.6■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa20.6■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa20.6■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 SARM1Q6SZW1 724 aa20.6■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 AMIGO1Q86WK6 493 aa20.6■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 ZBTB2Q8N680 514 aa20.6■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 GLIS1Q8NBF1 620 aa20.6■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 PHC3Q8NDX5 983 aa20.6■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 OR13C4Q8NGS5 318 aa20.6■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 PNPLA2Q96AD5 504 aa20.6■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 COG4Q9H9E3 785 aa20.6■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 CASS4Q9NQ75 786 aa20.6■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 TCP11X1B4DZS4 312 aa20.59■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 BTN3A1O00481 513 aa20.59■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 ZNF749O43361 778 aa20.59■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 SEMA7AO75326 666 aa20.59■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 CAPN1P07384 714 aa20.59■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 COPS2P61201 443 aa20.59■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 NCF4Q15080 339 aa20.59■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 OR52E1Q8NGJ3 308 aa20.59■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 PRR7Q8TB68 274 aa20.59■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 IP6K3Q96PC2 410 aa20.59■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa20.59■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa20.59■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 C19orf43Q9BQ61 176 aa20.59■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 C17orf62Q9BQA9 187 aa20.59■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 DHRS4Q9BTZ2 278 aa20.59■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 PITPNM3Q9BZ71 974 aa20.59■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 KLHL25Q9H0H3 589 aa20.59■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 OR52A5Q9H2C5 316 aa20.59■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa20.59■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 MACROD2A1Z1Q3 448 aa20.58■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 DDAH2O95865 285 aa20.58■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 PSMB4P28070 264 aa20.58■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 MARCKSL1P49006 195 aa20.58■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 RPA4Q13156 261 aa20.58■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 PRKG2Q13237 762 aa20.58■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 OLIG2Q13516 323 aa20.58■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 ATP1A4Q13733 1029 aa20.58■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 KYNUQ16719 465 aa20.58■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 ZNF789Q5FWF6 425 aa20.58■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 FAM198BQ6UWH4 519 aa20.58■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 TAS2R42Q7RTR8 314 aa20.58■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 GORASP1Q9BQQ3 440 aa20.58■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 ACTR10Q9NZ32 417 aa20.58■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 C5AR2Q9P296 337 aa20.58■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
SLC12A4-208ENST00000572010 KCNN4O15554 427 aa20.57■□□□□ 0.88
SLC12A4-208ENST00000572010 CD63P08962 238 aa20.57■□□□□ 0.88
SLC12A4-208ENST00000572010 OTX2P32243 289 aa20.57■□□□□ 0.88
SLC12A4-208ENST00000572010 MC4RP32245 332 aa20.57■□□□□ 0.88
SLC12A4-208ENST00000572010 RAPSNQ13702 412 aa20.57■□□□□ 0.88
SLC12A4-208ENST00000572010 SSPNQ14714 243 aa20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms