RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557549.5

RBM23-231, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 3

Gene RBM23, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-231	ENST00000557549		E7ESA3	106 aa		12.03	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	HGS	O14964	777 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	TP73	O15350	636 aa		12.03	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	EIF3H	O15372	352 aa	Known RBP eCLIP	12.03	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	NVL	O15381	856 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	OR1I1	O60431	355 aa		12.03	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	PRAMEF10	O60809	474 aa		12.03	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	THRA	P10827	490 aa		12.03	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	RPL21	P46778	160 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	CXADR	P78310	365 aa		12.03	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	CLN3	Q13286	438 aa		12.03	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		12.03	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	DUPD1	Q68J44	220 aa		12.03	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	PTRHD1	Q6GMV3	140 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	ZFAND4	Q86XD8	727 aa		12.03	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		12.03	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		12.03	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	ASZ1	Q8WWH4	475 aa		12.03	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	ELMO1	Q92556	727 aa		12.03	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	LPGAT1	Q92604	370 aa		12.03	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF592	Q92610	1267 aa		12.03	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	PMEPA1	Q969W9	287 aa		12.03	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	MS4A3	Q96HJ5	214 aa		12.03	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	C12orf66	Q96MD2	445 aa		12.03	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	INSM2	Q96T92	566 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	B3GNT4	Q9C0J1	378 aa		12.03	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	WWP1	Q9H0M0	922 aa		12.03	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	MVB12B	Q9H7P6	319 aa		12.03	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	OCIAD1	Q9NX40	245 aa		12.03	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		12.03	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	AKAP7	Q9P0M2	348 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	EPHA6	Q9UF33	1036 aa		12.03	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	SNX24	Q9Y343	169 aa		12.03	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		12.03	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	COMMD10	Q9Y6G5	202 aa		12.03	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	TEX264	Q9Y6I9	313 aa		12.03	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	MGA	Q8IWI9	3026 aa		12.02	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	TOX3	O15405	576 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	KDM1A	O60341	852 aa		12.02	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	GPC4	O75487	556 aa		12.02	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	UBXN7	O94888	489 aa		12.02	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	APOA4	P06727	396 aa		12.02	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	TYRP1	P17643	537 aa		12.02	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	AOAH	P28039	575 aa		12.02	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	ILF2	Q12905	390 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	GPR18	Q14330	331 aa		12.02	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	CRYM	Q14894	314 aa		12.02	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	TMED2	Q15363	201 aa		12.02	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	BBS9	Q3SYG4	887 aa		12.02	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	MSS51	Q4VC12	460 aa		12.02	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	BROX	Q5VW32	411 aa		12.02	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF470	Q6ECI4	717 aa		12.02	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		12.02	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	CENPU	Q71F23	418 aa		12.02	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	ARHGAP22	Q7Z5H3	698 aa		12.02	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	GALNT7	Q86SF2	657 aa		12.02	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		12.02	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		12.02	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	RMDN2	Q96LZ7	410 aa		12.02	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	FAM129A	Q9BZQ8	928 aa		12.02	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		12.02	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	ZMYND15	Q9H091	742 aa		12.02	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	KIR3DX1	Q9H7L2	352 aa		12.02	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	LATS2	Q9NRM7	1088 aa		12.02	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	C20orf96	Q9NUD7	363 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	WDR70	Q9NW82	654 aa		12.02	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	OGFR	Q9NZT2	677 aa		12.02	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	KLHL42	Q9P2K6	505 aa		12.02	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	ZC3H7B	Q9UGR2	993 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	KLHL3	Q9UH77	587 aa		12.02	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	PSMD13	Q9UNM6	376 aa		12.02	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	MN1	Q10571	1320 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	SDK2	Q58EX2	2172 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	EFS	O43281	561 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	SLCO2B1	O94956	709 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	S1PR4	O95977	384 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	AMD1	P17707	334 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	ACADL	P28330	430 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	ATP5D	P30049	168 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	CCR7	P32248	378 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	CSTF2	P33240	577 aa	Known RBP eCLIP	12.01	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	ELK3	P41970	407 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	CAPZB	P47756	277 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	SRSF6	Q13247	344 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	KRT33B	Q14525	404 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	SYTL3	Q4VX76	610 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	PLEKHS1	Q5SXH7	462 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	ARHGAP40	Q5TG30	622 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	STEAP4	Q687X5	459 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	C8orf74	Q6P047	294 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	GPR155	Q7Z3F1	870 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	LDB1	Q86U70	411 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	KCNMB4	Q86W47	210 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	TBC1D21	Q8IYX1	336 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	SLC22A15	Q8IZD6	547 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	CARF	Q8N187	725 aa		12.01	□□□□□ -0.49

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.6 ms