RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556700.5

NUMB-222, Transcript of NUMB, endocytic adaptor protein, human

TSL 4

Gene NUMB, Length 529 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NUMB-222	ENST00000556700	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
NUMB-222	ENST00000556700	HHEX	Q03014	270 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NUMB-222	ENST00000556700	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
NUMB-222	ENST00000556700	PTPRCAP	Q14761	206 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NUMB-222	ENST00000556700	KIR2DS5	Q14953	304 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NUMB-222	ENST00000556700	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
NUMB-222	ENST00000556700	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
NUMB-222	ENST00000556700	PCID2	Q5JVF3	399 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NUMB-222	ENST00000556700	ZNF648	Q5T619	568 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
NUMB-222	ENST00000556700	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NUMB-222	ENST00000556700	LYPLAL1	Q5VWZ2	237 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NUMB-222	ENST00000556700	LRRC8B	Q6P9F7	803 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NUMB-222	ENST00000556700	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NUMB-222	ENST00000556700	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
NUMB-222	ENST00000556700	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
NUMB-222	ENST00000556700	TAS2R42	Q7RTR8	314 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NUMB-222	ENST00000556700	PCGF5	Q86SE9	256 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NUMB-222	ENST00000556700	SLC9B2	Q86UD5	537 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NUMB-222	ENST00000556700	AMZ2	Q86W34	360 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NUMB-222	ENST00000556700	TRIM48	Q8IWZ4	208 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NUMB-222	ENST00000556700	NXPE1	Q8N323	547 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NUMB-222	ENST00000556700	GALNT6	Q8NCL4	622 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NUMB-222	ENST00000556700	CPT1C	Q8TCG5	803 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NUMB-222	ENST00000556700	TRIM44	Q96DX7	344 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
NUMB-222	ENST00000556700	CDKN2AIPNL	Q96HQ2	116 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NUMB-222	ENST00000556700	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NUMB-222	ENST00000556700	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NUMB-222	ENST00000556700	LDHAL6B	Q9BYZ2	381 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
NUMB-222	ENST00000556700	UGT1A7	Q9HAW7	530 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NUMB-222	ENST00000556700	UGT1A10	Q9HAW8	530 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NUMB-222	ENST00000556700	UGT1A8	Q9HAW9	530 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NUMB-222	ENST00000556700	XAB2	Q9HCS7	855 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
NUMB-222	ENST00000556700	CUEDC1	Q9NWM3	386 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
NUMB-222	ENST00000556700	SMARCAL1	Q9NZC9	954 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NUMB-222	ENST00000556700	ASIC3	Q9UHC3	531 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NUMB-222	ENST00000556700	ANAPC5	Q9UJX4	755 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NUMB-222	ENST00000556700	POLH	Q9Y253	713 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NUMB-222	ENST00000556700	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NUMB-222	ENST00000556700	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NUMB-222	ENST00000556700	PCDHB3	Q9Y5E6	796 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NUMB-222	ENST00000556700	MN1	Q10571	1320 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
NUMB-222	ENST00000556700		A1L4Q6	167 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NUMB-222	ENST00000556700	MROH6	A6NGR9	719 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NUMB-222	ENST00000556700	GAPDHS	O14556	408 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
NUMB-222	ENST00000556700	PFDN6	O15212	129 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NUMB-222	ENST00000556700	CREG1	O75629	220 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NUMB-222	ENST00000556700	RFPL1	O75677	317 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NUMB-222	ENST00000556700	SORBS2	O94875	1100 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
NUMB-222	ENST00000556700	CLDN1	O95832	211 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NUMB-222	ENST00000556700	C9	P02748	559 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NUMB-222	ENST00000556700	F3	P13726	295 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NUMB-222	ENST00000556700	PAM	P19021	973 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NUMB-222	ENST00000556700	ACRV1	P26436	265 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NUMB-222	ENST00000556700	EPHA4	P54764	986 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NUMB-222	ENST00000556700	SH3BP2	P78314	561 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NUMB-222	ENST00000556700	XIAP	P98170	497 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NUMB-222	ENST00000556700	ITIH4	Q14624	930 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NUMB-222	ENST00000556700	NADK2	Q4G0N4	442 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NUMB-222	ENST00000556700	BCL7A	Q4VC05	210 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NUMB-222	ENST00000556700	FASTKD1	Q53R41	847 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
NUMB-222	ENST00000556700	TTC27	Q6P3X3	843 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NUMB-222	ENST00000556700	TMEM220	Q6QAJ8	160 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NUMB-222	ENST00000556700	C9orf72	Q96LT7	481 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NUMB-222	ENST00000556700	TSSK1B	Q9BXA7	367 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NUMB-222	ENST00000556700	ULBP3	Q9BZM4	244 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NUMB-222	ENST00000556700	AKIRIN1	Q9H9L7	192 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
NUMB-222	ENST00000556700	MRM3	Q9HC36	420 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
NUMB-222	ENST00000556700	ZDHHC3	Q9NYG2	299 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NUMB-222	ENST00000556700	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NUMB-222	ENST00000556700	KLHL3	Q9UH77	587 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NUMB-222	ENST00000556700	DNAJC16	Q9Y2G8	782 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NUMB-222	ENST00000556700	PCDHGA6	Q9Y5G7	932 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NUMB-222	ENST00000556700	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		11.21	□□□□□ -0.62
NUMB-222	ENST00000556700	CCDC78	A2IDD5	438 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NUMB-222	ENST00000556700	OR2AG2	A6NM03	316 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NUMB-222	ENST00000556700	AGAP14	A8MT82	685 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NUMB-222	ENST00000556700	TCP11X1	B4DZS4	312 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NUMB-222	ENST00000556700	AP2A2	O94973	939 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NUMB-222	ENST00000556700	VIP	P01282	170 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NUMB-222	ENST00000556700	GSTM1	P09488	218 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NUMB-222	ENST00000556700	MLN	P12872	115 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NUMB-222	ENST00000556700	POU3F2	P20265	443 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
NUMB-222	ENST00000556700	PSMA3	P25788	255 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NUMB-222	ENST00000556700	DCT	P40126	519 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NUMB-222	ENST00000556700	GRIA1	P42261	906 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NUMB-222	ENST00000556700	NSG1	P42857	185 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NUMB-222	ENST00000556700	MAGEA6	P43360	314 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NUMB-222	ENST00000556700	GFER	P55789	205 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NUMB-222	ENST00000556700	ETF1	P62495	437 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
NUMB-222	ENST00000556700	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
NUMB-222	ENST00000556700	GSTM4	Q03013	218 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NUMB-222	ENST00000556700	DMPK	Q09013	629 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NUMB-222	ENST00000556700	PTK6	Q13882	451 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NUMB-222	ENST00000556700	KCNJ11	Q14654	390 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NUMB-222	ENST00000556700	EIF2S3L	Q2VIR3	472 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
NUMB-222	ENST00000556700	CCDC38	Q502W7	563 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NUMB-222	ENST00000556700	FNBP1L	Q5T0N5	605 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NUMB-222	ENST00000556700	CASC4	Q6P4E1	433 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NUMB-222	ENST00000556700	CERS6	Q6ZMG9	384 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NUMB-222	ENST00000556700	DET1	Q7L5Y6	550 aa		11.2	□□□□□ -0.62

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