RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551920.1

GCN1-209, Transcript of GCN1, eIF2 alpha kinase activator homolog, humanhuman

TSL 3

Gene GCN1, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCN1-209ENST00000551920 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 SMYD2Q9NRG4 433 aa15.95■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 H3BMM5 538 aa15.94■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 PFDN6O15212 129 aa15.94■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 AHSGP02765 367 aa15.94■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 APOA4P06727 396 aa15.94■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 PROS1P07225 676 aa15.94■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 THRAP10827 490 aa15.94■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 CLCN7P51798 805 aa15.94■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 INHBCP55103 352 aa15.94■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP15.94■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 MGAT5Q09328 741 aa15.94■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 KIAA0408Q6ZU52 694 aa15.94■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 OTOAQ7RTW8 1153 aa15.94■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 GALNT7Q86SF2 657 aa15.94■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 OR4D9Q8NGE8 314 aa15.94■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 ASZ1Q8WWH4 475 aa15.94■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 KCNJ9Q92806 393 aa15.94■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 CCDC74BQ96LY2 380 aa15.94■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 PDP2Q9P2J9 529 aa15.94■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa15.93■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 TRABD2BA6NFA1 517 aa15.93■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 ESPNB1AK53 854 aa15.93■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 AGRPO00253 132 aa15.93■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 TPBGLP0DKB5 382 aa15.93■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 MAGEA4P43358 317 aa15.93■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 LIMK2P53671 638 aa15.93■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 PRKG2Q13237 762 aa15.93■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 C16orf72Q14CZ0 275 aa15.93■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 PLCL1Q15111 1095 aa15.93■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 TMED2Q15363 201 aa15.93■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 PHF19Q5T6S3 580 aa15.93■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa15.93■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 ZBTB2Q8N680 514 aa15.93■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 RCBTB1Q8NDN9 531 aa15.93■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 OR52E1Q8NGJ3 308 aa15.93■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 NCSTNQ92542 709 aa15.93■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 FERD3LQ96RJ6 166 aa15.93■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 ZMYND15Q9H091 742 aa15.93■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 EPB41L1Q9H4G0 881 aa15.93■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 MVB12BQ9H7P6 319 aa15.93■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 FAM114A2Q9NRY5 505 aa15.93■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 SATB2Q9UPW6 733 aa15.93■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 ASF1AQ9Y294 204 aa15.93■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa15.93■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 KRT87PA6NCN2 255 aa15.92■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 ZW10O43264 779 aa15.92■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 CAPNS1P04632 268 aa15.92■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 MPOP05164 745 aa15.92■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 HGFP14210 728 aa15.92■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 CHRM3P20309 590 aa15.92■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 PGGT1BP53609 377 aa15.92■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 CDKN2DP55273 166 aa15.92■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 CUL1Q13616 776 aa15.92■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 ACSBG2Q5FVE4 666 aa15.92■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 C3orf38Q5JPI3 329 aa15.92■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa15.92■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 TMEM71Q6P5X7 295 aa15.92■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 ZNF449Q6P9G9 518 aa15.92■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 ACVR1CQ8NER5 493 aa15.92■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 OR5K2Q8NHB8 316 aa15.92■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 CD200R1Q8TD46 325 aa15.92■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 ZFPM2Q8WW38 1151 aa15.92■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 TMEM74Q96NL1 305 aa15.92■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 GPR21Q99679 349 aa15.92■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 MCMBPQ9BTE3 642 aa15.92■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa15.92■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 LATS2Q9NRM7 1088 aa15.92■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 ZFATQ9P243 1243 aa15.92■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 ICKQ9UPZ9 632 aa15.92■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 NFS1Q9Y697 457 aa15.92■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa15.92■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa15.92■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 ACACBO00763 2458 aa15.92■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 OR5K3A6NET4 321 aa15.91■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 E5RI56 91 aa15.91■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 C9P02748 559 aa15.91■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 RHOXF2BP0C7M4 288 aa15.91■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 NDUFS1P28331 727 aa15.91■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 ATP5DP30049 168 aa15.91■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 GABREP78334 506 aa15.91■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 ABRQ12979 859 aa15.91■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 KRT33BQ14525 404 aa15.91■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 RTP5Q14D33 572 aa15.91■□□□□ 0.14
GCN1-209ENST00000551920 PALM2Q8IXS6 379 aa15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms