RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551253.5

CS-225, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 676 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-225ENST00000551253 KCNF1Q9H3M0 494 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 NT5MQ9NPB1 228 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 PCDH12Q9NPG4 1184 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP6.93□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 COQ3Q9NZJ6 369 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 COQ6Q9Y2Z9 468 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 CFAP69A5D8W1 941 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 HACD1B0YJ81 288 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 TNFRSF10CO14798 259 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 SOCS5O75159 536 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 TJP3O95049 919 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 HLA-DQB2P05538 268 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 PTMAP06454 111 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 TPOP07202 933 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 ANKRD34CP0C6C1 535 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 PYGMP11217 842 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 BRAFP15056 766 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 UGT1A4P22310 534 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 KELP23276 732 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 LIG3P49916 1009 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 AP1B1Q10567 949 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 ZBTB17Q13105 803 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 XRCC4Q13426 336 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 ATP1A4Q13733 1029 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 NOMO1Q15155 1222 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 CHRFAM7AQ494W8 412 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 CFAP58Q5T655 872 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 ERAP2Q6P179 960 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 CAMK1DQ8IU85 385 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 CLEC1AQ8NC01 280 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 TRIM58Q8NG06 486 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 OR56A4Q8NGH8 313 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 LRRN4Q8WUT4 740 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 OR1E3Q8WZA6 343 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 NCSTNQ92542 709 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 NSMCE3Q96MG7 304 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 FCRL4Q96PJ5 515 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 TAAR6Q96RI8 345 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 NOD2Q9HC29 1040 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 LZTFL1Q9NQ48 299 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 TCFL5Q9UL49 500 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 OR1A2Q9Y585 309 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 TMEM202A6NGA9 273 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 KCNK1O00180 336 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 CLDN4O14493 209 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 ZSCAN12O43309 604 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 FZD6O60353 706 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 PGLSO95336 258 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 JCHAINP01591 159 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 PCCBP05166 539 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 FAM157CP0CG43 387 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 PTPN3P26045 913 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 TRIM23P36406 574 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 SH3BP2P78314 561 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 PDE1BQ01064 536 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 DSC2Q02487 901 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 ITKQ08881 620 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 NIPAL4Q0D2K0 466 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 TRAF2Q12933 501 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP6.91□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 SLC14A2Q15849 920 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 TEX44Q53QW1 395 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 ARMC12Q5T9G4 340 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 SEL1L2Q5TEA6 688 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 MEI1Q5TIA1 1274 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 CCDC181Q5TID7 509 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 AADACL2Q6P093 401 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 PRSS57Q6UWY2 283 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 PPP1R3BQ86XI6 285 aa6.91□□□□□ -1.3
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CS-225ENST00000551253 P3H2Q8IVL5 708 aa6.91□□□□□ -1.3
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CS-225ENST00000551253 CNTD1Q8N815 330 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 PLA2G15Q8NCC3 412 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 ARRDC2Q8TBH0 407 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 HAUS1Q96CS2 278 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 CNDP1Q96KN2 507 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-225ENST00000551253 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP6.91□□□□□ -1.32e-6■■□□□ 13.5
CS-225ENST00000551253 VAT1Q99536 393 aa6.91□□□□□ -1.3
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