RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548421.2

BRF1-213, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene BRF1, Length 1,452 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1-213ENST00000548421 AK4P27144 223 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
BRF1-213ENST00000548421 RPL10P27635 214 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
BRF1-213ENST00000548421 ACADLP28330 430 aa28.12■■■□□ 2.09
BRF1-213ENST00000548421 KCNC1P48547 511 aa28.12■■■□□ 2.09
BRF1-213ENST00000548421 SERPINB4P48594 390 aa28.12■■■□□ 2.09
BRF1-213ENST00000548421 PPP1R3AQ16821 1122 aa28.12■■■□□ 2.09
BRF1-213ENST00000548421 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
BRF1-213ENST00000548421 CCL4L1Q8NHW4 92 aa28.12■■■□□ 2.09
BRF1-213ENST00000548421 GPBAR1Q8TDU6 330 aa28.12■■■□□ 2.09
BRF1-213ENST00000548421 GSDMCQ9BYG8 508 aa28.12■■■□□ 2.09
BRF1-213ENST00000548421 WWP1Q9H0M0 922 aa28.12■■■□□ 2.09
BRF1-213ENST00000548421 PSMD13Q9UNM6 376 aa28.12■■■□□ 2.09
BRF1-213ENST00000548421 G3V2L1 256 aa28.11■■■□□ 2.09
BRF1-213ENST00000548421 GFYI3L273 518 aa28.11■■■□□ 2.09
BRF1-213ENST00000548421 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
BRF1-213ENST00000548421 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
BRF1-213ENST00000548421 MYL2P10916 166 aa28.11■■■□□ 2.09
BRF1-213ENST00000548421 CPA3P15088 417 aa28.11■■■□□ 2.09
BRF1-213ENST00000548421 TAC1P20366 129 aa28.11■■■□□ 2.09
BRF1-213ENST00000548421 ACTR1BP42025 376 aa28.11■■■□□ 2.09
BRF1-213ENST00000548421 ACTR1AP61163 376 aa28.11■■■□□ 2.09
BRF1-213ENST00000548421 TCEA2Q15560 299 aa28.11■■■□□ 2.09
BRF1-213ENST00000548421 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
BRF1-213ENST00000548421 ZYG11AQ6WRX3 759 aa28.11■■■□□ 2.09
BRF1-213ENST00000548421 RABEPKQ7Z6M1 372 aa28.11■■■□□ 2.09
BRF1-213ENST00000548421 GPSM1Q86YR5 675 aa28.11■■■□□ 2.09
BRF1-213ENST00000548421 RASGRP3Q8IV61 690 aa28.11■■■□□ 2.09
BRF1-213ENST00000548421 CFAP61Q8NHU2 1237 aa28.11■■■□□ 2.09
BRF1-213ENST00000548421 EXT2Q93063 718 aa28.11■■■□□ 2.09
BRF1-213ENST00000548421 SLC12A9Q9BXP2 914 aa28.11■■■□□ 2.09
BRF1-213ENST00000548421 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa28.11■■■□□ 2.09
BRF1-213ENST00000548421 OARD1Q9Y530 152 aa28.11■■■□□ 2.09
BRF1-213ENST00000548421 VPS13AQ96RL7 3174 aa28.11■■■□□ 2.09
BRF1-213ENST00000548421 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
BRF1-213ENST00000548421 PCLAFQ15004 111 aa28.1■■■□□ 2.09
BRF1-213ENST00000548421 SLC30A9Q6PML9 568 aa28.1■■■□□ 2.09
BRF1-213ENST00000548421 NRROSQ86YC3 692 aa28.1■■■□□ 2.09
BRF1-213ENST00000548421 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
BRF1-213ENST00000548421 DYDC1Q8WWB3 177 aa28.1■■■□□ 2.09
BRF1-213ENST00000548421 DLG3Q92796 817 aa28.1■■■□□ 2.09
BRF1-213ENST00000548421 RMDN2Q96LZ7 410 aa28.1■■■□□ 2.09
BRF1-213ENST00000548421 LRRC61Q9BV99 259 aa28.1■■■□□ 2.09
BRF1-213ENST00000548421 RDH14Q9HBH5 336 aa28.1■■■□□ 2.09
BRF1-213ENST00000548421 PARVBQ9HBI1 364 aa28.1■■■□□ 2.09
BRF1-213ENST00000548421 TMEM131Q92545 1883 aa28.1■■■□□ 2.09
BRF1-213ENST00000548421 PDZK1P1A8MUH7 402 aa28.09■■■□□ 2.09
BRF1-213ENST00000548421 SNX2O60749 519 aa28.09■■■□□ 2.09
BRF1-213ENST00000548421 SMIM24O75264 130 aa28.09■■■□□ 2.09
BRF1-213ENST00000548421 CATP04040 527 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
BRF1-213ENST00000548421 BPGMP07738 259 aa28.09■■■□□ 2.09
BRF1-213ENST00000548421 CYP2A7P20853 494 aa28.09■■■□□ 2.09
BRF1-213ENST00000548421 CTSKP43235 329 aa28.09■■■□□ 2.09
BRF1-213ENST00000548421 IL9RQ01113 521 aa28.09■■■□□ 2.09
BRF1-213ENST00000548421 TGFBIQ15582 683 aa28.09■■■□□ 2.09
BRF1-213ENST00000548421 KIF19Q2TAC6 998 aa28.09■■■□□ 2.09
BRF1-213ENST00000548421 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
BRF1-213ENST00000548421 UNC5DQ6UXZ4 953 aa28.09■■■□□ 2.09
BRF1-213ENST00000548421 TAX1BP1Q86VP1 789 aa28.09■■■□□ 2.09
BRF1-213ENST00000548421 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa28.09■■■□□ 2.09
BRF1-213ENST00000548421 CAAP1Q9H8G2 361 aa28.09■■■□□ 2.09
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BRF1-213ENST00000548421 WDR37Q9Y2I8 494 aa28.09■■■□□ 2.09
BRF1-213ENST00000548421 SUPT3HB4E1H0 165 aa28.08■■■□□ 2.09
BRF1-213ENST00000548421 UBXN8O00124 270 aa28.08■■■□□ 2.09
BRF1-213ENST00000548421 BIRC5O15392 142 aa28.08■■■□□ 2.09
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BRF1-213ENST00000548421 TPBGLP0DKB5 382 aa28.08■■■□□ 2.09
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BRF1-213ENST00000548421 WASH2PQ6VEQ5 465 aa28.08■■■□□ 2.09
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BRF1-213ENST00000548421 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
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BRF1-213ENST00000548421 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
BRF1-213ENST00000548421 CCDC126Q96EE4 140 aa28.08■■■□□ 2.09
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BRF1-213ENST00000548421 SNX11Q9Y5W9 270 aa28.08■■■□□ 2.09
BRF1-213ENST00000548421 ARHGEF33A8MVX0 844 aa28.07■■■□□ 2.08
BRF1-213ENST00000548421 FFAR2O15552 330 aa28.07■■■□□ 2.08
BRF1-213ENST00000548421 DLX3O60479 287 aa28.07■■■□□ 2.08
BRF1-213ENST00000548421 C1orf105O95561 183 aa28.07■■■□□ 2.08
BRF1-213ENST00000548421 ALDH3A1P30838 453 aa28.07■■■□□ 2.08
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