RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544244.5

PTPRO-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRO, Length 3,978 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-210ENST00000544244 RHPN2P1A8MT19 583 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 SLC16A5O15375 505 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 GRK2P25098 689 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 PREPP48147 710 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 CDKN2DP55273 166 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 SP140Q13342 867 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 C1orf61Q13536 156 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 CHI3L2Q15782 390 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 PFKFB4Q16877 469 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 TTMPQ5BVD1 217 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 ACSBG2Q5FVE4 666 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 KDM7AQ6ZMT4 941 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 ADCK2Q7Z695 626 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 SLC9B2Q86UD5 537 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 SYT12Q8IV01 421 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 PNPLA1Q8N8W4 532 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 OR2L2Q8NH16 312 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 CENPTQ96BT3 561 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 TLCD1Q96CP7 247 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 PHF21BQ96EK2 531 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 MED8Q96G25 268 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 WWP1Q9H0M0 922 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 COG4Q9H9E3 785 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 OPTCQ9UBM4 332 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 POLG2Q9UHN1 485 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 PLLPQ9Y342 182 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 A0A1B0GVT2 93 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 B4DGG1 531 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 AGPSO00116 658 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 YKT6O15498 198 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP5.55□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 BCKDHBP21953 392 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 PSMA3P25788 255 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 HMOX2P30519 316 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 TRIM23P36406 574 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 AP1S2P56377 157 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 PHEXP78562 749 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 SLC18A2Q05940 514 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 TSNQ15631 228 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 SULT1C3Q6IMI6 304 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 BANPQ8N9N5 519 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 MDM1Q8TC05 714 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 LCN9Q8WX39 176 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 KIAA1191Q96A73 305 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 OLFM1Q99784 485 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 HGH1Q9BTY7 390 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 MVB12BQ9H7P6 319 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 MANSC1Q9H8J5 431 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 PARVBQ9HBI1 364 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 IRAK4Q9NWZ3 460 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 SLC6A14Q9UN76 642 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 HGSO14964 777 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 LATO43561 262 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 KATNA1O75449 491 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 RFPL1O75677 317 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 CER1O95813 267 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 SERPINE1P05121 402 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 RPL10P27635 214 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 AOAHP28039 575 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 GABRB3P28472 473 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 MDH1P40925 334 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 CBX1P83916 185 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 CTSL3PQ5NE16 218 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 NEK10Q6ZWH5 1172 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 TMEM105Q8N8V8 129 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 NAT14Q8WUY8 206 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 OR1E3Q8WZA6 343 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 CCDC138Q96M89 665 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 SLC38A3Q99624 504 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 PITPNM3Q9BZ71 974 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 P2RY12Q9H244 342 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 FIS1Q9Y3D6 152 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 OBSL1O75147 1896 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 H0Y8X5 98 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 K7ESF4 209 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 BIRC5O15392 142 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 PLIN3O60664 434 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 GPC4O75487 556 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 IPO13O94829 963 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 CCNDBP1O95273 360 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRO-210ENST00000544244 SP9P0CG40 484 aa5.55□□□□□ -1.52
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