RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 MAPK14Q16539 360 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa9.32□□□□□ -0.92
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PTPRB-204ENST00000538708 RGMAQ96B86 450 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 TEPSINQ96N21 525 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 TMEM209Q96SK2 561 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 C16orf70Q9BSU1 422 aa9.32□□□□□ -0.92
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PTPRB-204ENST00000538708 PIGVQ9NUD9 493 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 CCDC162PA2VCL2 907 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 C2orf74A8MZ97 194 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 GABRDO14764 452 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 GRID2O43424 1007 aa9.3□□□□□ -0.92
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