RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533557.5

BBS1-222, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 1,043 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-222	ENST00000533557	FNBP1L	Q5T0N5	605 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	PRAMEF13	Q5VWM6	474 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	RHBDD2	Q6NTF9	364 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	KIRREL2	Q6UWL6	708 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	DAAM2	Q86T65	1068 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	TRIM73	Q86UV7	250 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	MMP21	Q8N119	569 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	ZFPM2	Q8WW38	1151 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	TRIM56	Q9BRZ2	755 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	XKR8	Q9H6D3	395 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	FANCE	Q9HB96	536 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	CBX8	Q9HC52	389 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	SYTL2	Q9HCH5	934 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	RAD18	Q9NS91	495 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	OLAH	Q9NV23	265 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	DNMT3A	Q9Y6K1	912 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	GSAP	A4D1B5	854 aa		11.72	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	MGAT4D	A6NG13	374 aa		11.72	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	CCL21	O00585	134 aa		11.72	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	GZMA	P12544	262 aa		11.72	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	DCD	P81605	110 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	UBXN1	Q04323	297 aa		11.72	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	TLR1	Q15399	786 aa		11.72	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	CYP2A13	Q16696	494 aa		11.72	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	NKAIN1	Q4KMZ8	207 aa		11.72	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	FAM151B	Q6UXP7	276 aa		11.72	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	LINC00696	Q6ZRV3	163 aa		11.72	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	NT5DC3	Q86UY8	548 aa		11.72	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		11.72	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF808	Q8N4W9	903 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		11.72	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	CCNY	Q8ND76	341 aa		11.72	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	PHC3	Q8NDX5	983 aa		11.72	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	DDHD1	Q8NEL9	900 aa		11.72	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		11.72	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	BRSK1	Q8TDC3	778 aa		11.72	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	HDAC11	Q96DB2	347 aa		11.72	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	TTC25	Q96NG3	672 aa		11.72	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	SLC7A5P2	Q9GIP4	190 aa		11.72	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		11.72	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	DEF6	Q9H4E7	631 aa		11.72	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	CHST11	Q9NPF2	352 aa		11.72	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	UBP1	Q9NZI7	540 aa		11.72	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	IL17C	Q9P0M4	197 aa		11.72	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	IFT80	Q9P2H3	777 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		11.72	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	PCM1	Q15154	2024 aa		11.72	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	TRGV8	A0A0C4DH27	118 aa		11.71	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		11.71	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	LRRC53	A6NM62	1247 aa		11.71	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	OR2B3	O76000	313 aa		11.71	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	IGHE	P01854	428 aa		11.71	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	SKIL	P12757	684 aa		11.71	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	HMGCL	P35914	325 aa		11.71	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	CHRNA4	P43681	627 aa		11.71	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	GCGR	P47871	477 aa		11.71	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	TAS2R40	P59535	323 aa		11.71	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	UBE2H	P62256	183 aa		11.71	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	VWA2	Q5GFL6	755 aa		11.71	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	AGAP7P	Q5VUJ5	663 aa		11.71	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	RPUSD3	Q6P087	351 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	FAM180A	Q6UWF9	173 aa		11.71	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	SHISA6	Q6ZSJ9	500 aa		11.71	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	CDH24	Q86UP0	819 aa		11.71	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF655	Q8N720	491 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	BCORP1	Q8N888	145 aa		11.71	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	OR2L2	Q8NH16	312 aa		11.71	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	FLVCR1-AS1	Q8TAF5	88 aa		11.71	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	ZDHHC19	Q8WVZ1	309 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	LCN9	Q8WX39	176 aa		11.71	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	NR4A3	Q92570	626 aa		11.71	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	FAF2	Q96CS3	445 aa		11.71	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	AGAP3	Q96P47	875 aa		11.71	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	AGAP4	Q96P64	663 aa		11.71	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	ISCU	Q9H1K1	167 aa		11.71	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	SRMS	Q9H3Y6	488 aa		11.71	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	PLA2G3	Q9NZ20	509 aa		11.71	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	GPN3	Q9UHW5	284 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		11.71	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	SCIN	Q9Y6U3	715 aa		11.71	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	PRRC2A	P48634	2157 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	KLHL41	O60662	606 aa		11.7	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	PMPCB	O75439	489 aa		11.7	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	NDST3	O95803	873 aa		11.7	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	HBQ1	P09105	142 aa		11.7	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	TPBGL	P0DKB5	382 aa		11.7	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	MMP11	P24347	488 aa		11.7	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	GJC1	P36383	396 aa		11.7	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	CA7	P43166	264 aa		11.7	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	PPID	Q08752	370 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	PRKAA1	Q13131	559 aa		11.7	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF658B	Q4V348	819 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	LDLRAP1	Q5SW96	308 aa		11.7	□□□□□ -0.54

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