RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533059.5

CHID1-222, Transcript of chitinase domain containing 1, human

TSL 3

Gene CHID1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHID1-222	ENST00000533059	ZFC3H1	O60293	1989 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	AKAP13	Q12802	2813 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	MN1	Q10571	1320 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	SLC5A10	A0PJK1	596 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	GSAP	A4D1B5	854 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	OR6C74	A6NCV1	312 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	EFCAB7	A8K855	629 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	DXO	O77932	396 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	PKM	P14618	531 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	ELK3	P41970	407 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	ARL4D	P49703	201 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	CFHR1	Q03591	330 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	PRKG2	Q13237	762 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	CTBP1	Q13363	440 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	TUBB2A	Q13885	445 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	TTLL9	Q3SXZ7	439 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	HSP90AA5P	Q58FG0	334 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	TTC23L	Q6PF05	361 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	ANKMY2	Q8IV38	441 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	13.48	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	PHC3	Q8NDX5	983 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	CFAP61	Q8NHU2	1237 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	LPGAT1	Q92604	370 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	FGF11	Q92914	225 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	FAM136A	Q96C01	138 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	C9orf72	Q96LT7	481 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	PWWP2A	Q96N64	755 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	SLC46A1	Q96NT5	459 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	TUBB2B	Q9BVA1	445 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	HRASLS2	Q9NWW9	162 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	OGFR	Q9NZT2	677 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	WHRN	Q9P202	907 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	POLG2	Q9UHN1	485 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	TSR3	Q9UJK0	312 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	CHD8	Q9HCK8	2581 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	OR5K3	A6NET4	321 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	MATN2	O00339	956 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	NIPSNAP2	O75323	286 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	ERVK-10	P10266	1014 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	LEPR	P48357	1165 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	SEPHS1	P49903	392 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	ADAR	P55265	1226 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	ZNF658B	Q4V348	819 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	MSS51	Q4VC12	460 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	CTSL3P	Q5NE16	218 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	PLEKHS1	Q5SXH7	462 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	XKR5	Q6UX68	686 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	TBC1D21	Q8IYX1	336 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	SLC22A15	Q8IZD6	547 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	RAB42	Q8N4Z0	105 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	ZNF248	Q8NDW4	579 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	OR4E2	Q8NGC2	313 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	OR52E1	Q8NGJ3	308 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	OR5AR1	Q8NGP9	310 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	CERS2	Q96G23	380 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	SLC39A1	Q9NY26	324 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	FBXO5	Q9UKT4	447 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	COL27A1	Q8IZC6	1860 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059		A0A1W2PNU3	283 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	CTAGE15	A4D2H0	777 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	C9	P02748	559 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	CTAGE8	P0CG41	777 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	CCL4	P13236	92 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	POLR2C	P19387	275 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	AOAH	P28039	575 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	SHMT2	P34897	504 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	RAB15	P59190	212 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	MPP1	Q00013	466 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	CAV1	Q03135	178 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	FOXM1	Q08050	763 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	ABR	Q12979	859 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	CAPN12	Q6ZSI9	719 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	CTAGE6	Q86UF2	777 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	AMIGO1	Q86WK6	493 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	CTAGE4	Q8IX94	777 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	ZBTB2	Q8N680	514 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	OR5K2	Q8NHB8	316 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	SNIP1	Q8TAD8	396 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	KCNE4	Q8WWG9	221 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	USP7	Q93009	1102 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	ART4	Q93070	314 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	PRR11	Q96HE9	360 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	CD180	Q99467	661 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	RAB33B	Q9H082	229 aa		13.46	□□□□□ -0.25

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