RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529667.1

SOX9-AS1-208, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 340 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ASB11Q8WXH4 323 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 GLMNQ92990 594 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 FBXL8Q96CD0 374 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 NRBF2Q96F24 287 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SCLYQ96I15 445 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ITCHQ96J02 903 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 LMLNQ96KR4 655 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 NSMCE2Q96MF7 247 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 NPAS2Q99743 824 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 EGFL8Q99944 293 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 DPY30Q9C005 99 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 KCNH6Q9H252 994 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 FAM83DQ9H4H8 585 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 RAD21L1Q9H4I0 556 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 EHD1Q9H4M9 534 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SLC52A3Q9NQ40 469 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ITM2CQ9NQX7 267 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SPHK2Q9NRA0 654 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 WWOXQ9NZC7 414 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CFAP97Q9P2B7 532 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MAP10Q9P2G4 905 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 GALPQ9UBC7 116 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ANAPC2Q9UJX6 822 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 BLOC1S6Q9UL45 172 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 GPR34Q9UPC5 381 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MYRFQ9Y2G1 1151 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 WASF2Q9Y6W5 498 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 A0A096LPI6 279 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 H0YIV9 168 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CDC7O00311 574 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 NR5A2O00482 541 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CLGNO14967 610 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 LSM1O15116 133 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 KDM1AO60341 852 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TSPAN3O60637 253 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ATG13O75143 517 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 NIPSNAP2O75323 286 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PRSS23O95084 383 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 RASAL1O95294 804 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 BMP10O95393 424 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 H6PDO95479 791 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CAPN1P07384 714 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CNPP09543 421 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 LINC00032P0C843 101 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ZCCHC18P0CG32 403 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 IRF1P10914 325 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 GSTM2P28161 218 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PEX2P28328 305 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TEAD1P28347 426 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 BMPR1AP36894 532 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ARFIP1P53367 373 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CDH13P55290 713 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 POLE2P56282 527 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PTSQ03393 145 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 DPTQ07507 201 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TUBA3CQ13748 450 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 E2F2Q14209 437 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 NR6A1Q15406 480 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ATP6AP1Q15904 470 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ZNF805Q5CZA5 627 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PAGE2BQ5JRK9 111 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TBCELQ5QJ74 424 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 LRIF1Q5T3J3 769 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PLPP4Q5VZY2 271 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PPP2R2DQ66LE6 453 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TXNDC8Q6A555 127 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CLEC6AQ6EIG7 209 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 NANOGP8Q6NSW7 305 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CRTC1Q6UUV9 634 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CYP20A1Q6UW02 462 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 UGT2A3Q6UWM9 527 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 Q6ZSR9 355 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 GAREM2Q75VX8 874 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 DPPA4Q7L190 304 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SPRED1Q7Z699 444 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ADHFE1Q8IWW8 467 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CPNE9Q8IYJ1 553 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PROKR1Q8TCW9 393 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 LZICQ8WZA0 190 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TMEM125Q96AQ2 219 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MTERF3Q96E29 417 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 B3GALT6Q96L58 329 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 C3orf30Q96M34 536 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CGREF1Q99674 301 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-208ENST00000529667 BCL7BQ9BQE9 202 aa6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms