RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528462.5

PACSIN3-205, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 2

Gene PACSIN3, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-205ENST00000528462 GPR78Q96P69 363 aa21.51■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 SMC6Q96SB8 1091 aa21.51■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 SMOC1Q9H4F8 434 aa21.51■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 PRDM8Q9NQV8 689 aa21.51■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 WDR37Q9Y2I8 494 aa21.51■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 TMEM131Q92545 1883 aa21.5■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 PDZK1P1A8MUH7 402 aa21.5■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 GFYI3L273 518 aa21.5■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 SYF2O95926 243 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 SLC2A4P14672 509 aa21.5■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 CCT5P48643 541 aa21.5■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 DLG1Q12959 904 aa21.5■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 BNIP3Q12983 259 aa21.5■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 CSHL1Q14406 222 aa21.5■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 CSRP2Q16527 193 aa21.5■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 IYDQ6PHW0 289 aa21.5■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 UNC5DQ6UXZ4 953 aa21.5■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 KCTD4Q8WVF5 259 aa21.5■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 ZBTB9Q96C00 473 aa21.5■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 RMDN2Q96LZ7 410 aa21.5■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 WWP1Q9H0M0 922 aa21.5■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 UCKL1Q9NWZ5 548 aa21.5■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 SDC3O75056 442 aa21.49■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 EML2O95834 649 aa21.49■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 ANXA6P08133 673 aa21.49■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 HALP42357 657 aa21.49■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 SP140Q13342 867 aa21.49■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 CLCA4Q14CN2 919 aa21.49■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 ACAP2Q15057 778 aa21.49■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 ISCA2Q86U28 154 aa21.49■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 C4orf33Q8N1A6 199 aa21.49■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 FAM46DQ8NEK8 389 aa21.49■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 KIAA1191Q96A73 305 aa21.49■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 NXNL1Q96CM4 212 aa21.49■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 FOPNLQ96NB1 174 aa21.49■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 IL21RQ9HBE5 538 aa21.49■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 NCDNQ9UBB6 729 aa21.49■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 PSMD13Q9UNM6 376 aa21.49■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa21.49■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 A0A0G2JNG1 304 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 KIR2DS3K7RE56 304 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 SLC16A5O15375 505 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 SNX2O60749 519 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 GLRA3O75311 464 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 C8GP07360 202 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 GIMD1P0DJR0 217 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 GMPRP36959 345 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 KIR2DS5Q14953 304 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 TCEA2Q15560 299 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 KLC3Q6P597 504 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 OGFOD3Q6PK18 319 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 SFRP1Q8N474 314 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 SPATA6LQ8N4H0 392 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 MINDY1Q8N5J2 469 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 RHEBL1Q8TAI7 183 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 APOPT1Q96IL0 206 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 TSNARE1Q96NA8 513 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 SLC12A9Q9BXP2 914 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 MED4Q9NPJ6 270 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 SEMA4GQ9NTN9 838 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 GRID1Q9ULK0 1009 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 DOLKQ9UPQ8 538 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 COPEO14579 308 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 ZBTB14O43829 449 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 TYROBPO43914 113 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 RPE65Q16518 533 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 TTMPQ5BVD1 217 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 NAGSQ8N159 534 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 DUSP23Q9BVJ7 150 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 NLGN3Q9NZ94 848 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 BTN3A1O00481 513 aa21.47■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 RPN2P04844 631 aa21.47■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
PACSIN3-205ENST00000528462 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
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