RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495802.5

SKAP2-208, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 554 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-208	ENST00000495802	CRYBG2	Q8N1P7	616 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	RFLNB	Q8N5W9	214 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	SLAMF9	Q96A28	289 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	HDAC11	Q96DB2	347 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	ZNF583	Q96ND8	569 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	LMF2	Q9BU23	707 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	ZNF556	Q9HAH1	456 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802		A0A1W2PPI3	338 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	HYKK	A2RU49	373 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	TMEM221	A6NGB7	291 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	CCDC175	P0C221	793 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	CETP	P11597	493 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	AMD1	P17707	334 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	PCGF2	P35227	344 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	MTHFR	P42898	656 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	SLC9A3	P48764	834 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	THOP1	P52888	689 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	DVL1P1	P54792	670 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	TPD52	P55327	224 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	COG2	Q14746	738 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	KIR2DS3	Q14952	304 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	VWC2	Q2TAL6	325 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	FAM198B	Q6UWH4	519 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	LINGO4	Q6UY18	593 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	DGLUCY	Q7Z3D6	616 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	SLFN11	Q7Z7L1	901 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	GPALPP1	Q8IXQ4	340 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	TTC30B	Q8N4P2	665 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	CPSF7	Q8N684	471 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	METTL27	Q8N6F8	245 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	C17orf77	Q96MU5	243 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	SEPHS2	Q99611	448 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	NUP85	Q9BW27	656 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	ACKR4	Q9NPB9	350 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	STK26	Q9P289	416 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	TRIM77	I1YAP6	450 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	MEIS2	O14770	477 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	SYNCRIP	O60506	623 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	FYN	P06241	537 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	F7	P08709	466 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	PTPRCAP	Q14761	206 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	KRT39	Q6A163	491 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	PPFIBP2	Q8ND30	876 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802		Q8NFD4	153 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	ATL1	Q8WXF7	558 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	TCF7L2	Q9NQB0	619 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	DONSON	Q9NYP3	566 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	FAF1	Q9UNN5	650 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	TNFSF12-TNFSF13	A0A0A6YY99	330 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SKAP2-208	ENST00000495802	PRR32	B1ATL7	298 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SKAP2-208	ENST00000495802	ERCC2	P18074	760 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SKAP2-208	ENST00000495802	NR1D1	P20393	614 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SKAP2-208	ENST00000495802	MARK3	P27448	753 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SKAP2-208	ENST00000495802	RPS18	P62269	152 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SKAP2-208	ENST00000495802	TNIP1	Q15025	636 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SKAP2-208	ENST00000495802	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SKAP2-208	ENST00000495802	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SKAP2-208	ENST00000495802	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SKAP2-208	ENST00000495802	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SKAP2-208	ENST00000495802	NFE4	Q86UQ8	179 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SKAP2-208	ENST00000495802	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SKAP2-208	ENST00000495802	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SKAP2-208	ENST00000495802	DMBX1	Q8NFW5	382 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SKAP2-208	ENST00000495802	RNF128	Q8TEB7	428 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SKAP2-208	ENST00000495802	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SKAP2-208	ENST00000495802	SCRN2	Q96FV2	425 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SKAP2-208	ENST00000495802	SFXN2	Q96NB2	322 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SKAP2-208	ENST00000495802	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SKAP2-208	ENST00000495802	SLC25A23	Q9BV35	468 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SKAP2-208	ENST00000495802	VN1R1	Q9GZP7	353 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SKAP2-208	ENST00000495802	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SKAP2-208	ENST00000495802	TAAR2	Q9P1P5	351 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SKAP2-208	ENST00000495802	PADI2	Q9Y2J8	665 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SKAP2-208	ENST00000495802	SCN5A	Q14524	2016 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SKAP2-208	ENST00000495802	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SKAP2-208	ENST00000495802		A0A1W2PRB8	838 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SKAP2-208	ENST00000495802	XPNPEP2	O43895	674 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SKAP2-208	ENST00000495802	RECQL5	O94762	991 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69

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