RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495293.5

RBM39-240, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-240	ENST00000495293	MAP2K7	O14733	419 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	RNASEH1	O60930	286 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	SRGAP2	O75044	1071 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	CLDN11	O75508	207 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	RHOBTB1	O94844	696 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	LUC7L3	O95232	432 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	IGLV3-25	P01717	112 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	PDHA1	P08559	390 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	CISD3	P0C7P0	127 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	ACADM	P11310	421 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	MYF5	P13349	255 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	HOXB2	P14652	356 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	CHRNB2	P17787	502 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	HOXA6	P31267	233 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	ACTN2	P35609	894 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	NBL1	P41271	181 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	PRKCI	P41743	596 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	GRIA3	P42263	894 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	PTPN9	P43378	593 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	CXCR3	P49682	368 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	AIF1	P55008	147 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	CDH4	P55283	916 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	VSNL1	P62760	191 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	POU6F2	P78424	691 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	SULT2A1	Q06520	285 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	PIGF	Q07326	219 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	SLC12A1	Q13621	1099 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	CASP8	Q14790	479 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	CCDC157	Q569K6	752 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	BEND6	Q5SZJ8	279 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	EMC10	Q5UCC4	262 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	ALS2CL	Q60I27	953 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	ANO7	Q6IWH7	933 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	SCYL2	Q6P3W7	929 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	SERPINA13P	Q6UXR4	307 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	CHST9	Q7L1S5	443 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	STRADA	Q7RTN6	431 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	SLFN11	Q7Z7L1	901 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	WDR5B	Q86VZ2	330 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	PDSS2	Q86YH6	399 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	IFT20	Q8IY31	132 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	MCOLN2	Q8IZK6	566 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	EMC1	Q8N766	993 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	IL17RC	Q8NAC3	791 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	FAM46D	Q8NEK8	389 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	FIBIN	Q8TAL6	211 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	FAM172A	Q8WUF8	416 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	RXFP2	Q8WXD0	754 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	KIAA1191	Q96A73	305 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	ZNF653	Q96CK0	615 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	PGAP3	Q96FM1	320 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	SLC35A4	Q96G79	324 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	PIWIL1	Q96J94	861 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	C1orf74	Q96LT6	269 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	CFAP57	Q96MR6	1250 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	HAPLN3	Q96S86	360 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	PCDHB18P	Q96TA0	734 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	NPY6R	Q99463	290 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	CHP1	Q99653	195 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	FUT8	Q9BYC5	575 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	GPR35	Q9HC97	309 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	ABCB8	Q9NUT2	735 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	PNPO	Q9NVS9	261 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	ELOVL2	Q9NXB9	296 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	SIDT1	Q9NXL6	827 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	DONSON	Q9NYP3	566 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	SUN2	Q9UH99	717 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	GGA2	Q9UJY4	613 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	GMEB2	Q9UKD1	530 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	VANGL2	Q9ULK5	521 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293		R4GN57	208 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	MYOF	Q9NZM1	2061 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293		A0A088AWK7	358 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293		A0A1B0GVM2	712 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	PROB1	E7EW31	1015 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	SGK1	O00141	431 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	KPNA5	O15131	536 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	ZNF217	O75362	1048 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	KIAA0754	O94854	1291 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	ATP1A1	P05023	1023 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	RHOC	P08134	193 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	SRPRA	P08240	638 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	DLD	P09622	509 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	PRLR	P16471	622 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	RRM1	P23921	792 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	PSMA2	P25787	234 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	HLA-F	P30511	346 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	OR1E1	P30953	314 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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