RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495123.5

PKP4-216, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 580 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-216ENST00000495123 GALPQ9UBC7 116 aa8.44□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 MED16Q9Y2X0 877 aa8.44□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 BPTFQ12830 3046 aa8.44□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa8.43□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa8.43□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 TRABD2BA6NFA1 517 aa8.43□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 H3BMM5 538 aa8.43□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP8.43□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 ZW10O43264 779 aa8.43□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 DUX1O43812 170 aa8.43□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 PIAS1O75925 651 aa8.43□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 UBXN7O94888 489 aa8.43□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 MPOP05164 745 aa8.43□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 PROS1P07225 676 aa8.43□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 THRAP10827 490 aa8.43□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 AMD1P17707 334 aa8.43□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 CHRM3P20309 590 aa8.43□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 ECHS1P30084 290 aa8.43□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 SSTR1P30872 391 aa8.43□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 CCKBRP32239 447 aa8.43□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 CD151P48509 253 aa8.43□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 GFERP55789 205 aa8.43□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 GPX6P59796 221 aa8.43□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 PPP1CAP62136 330 aa8.43□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 PRKG2Q13237 762 aa8.43□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 SQSTM1Q13501 440 aa8.43□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 PLCL1Q15111 1095 aa8.43□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 C3orf38Q5JPI3 329 aa8.43□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 PHF19Q5T6S3 580 aa8.43□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 TMEM71Q6P5X7 295 aa8.43□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 ZNF449Q6P9G9 518 aa8.43□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 OTOAQ7RTW8 1153 aa8.43□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 CCDC25Q86WR0 208 aa8.43□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 SLC22A15Q8IZD6 547 aa8.43□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 RCBTB1Q8NDN9 531 aa8.43□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 OR4D9Q8NGE8 314 aa8.43□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 OR5AR1Q8NGP9 310 aa8.43□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 GIMAP7Q8NHV1 300 aa8.43□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 PYROXD1Q8WU10 500 aa8.43□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 ASZ1Q8WWH4 475 aa8.43□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 NCSTNQ92542 709 aa8.43□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 C9orf72Q96LT7 481 aa8.43□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 CCDC74BQ96LY2 380 aa8.43□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 FERD3LQ96RJ6 166 aa8.43□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 NDNQ99608 321 aa8.43□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 HGH1Q9BTY7 390 aa8.43□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 TSSK1BQ9BXA7 367 aa8.43□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 ZMYND15Q9H091 742 aa8.43□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa8.43□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 L2HGDHQ9H9P8 463 aa8.43□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 SMYD2Q9NRG4 433 aa8.43□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 MOCS1Q9NZB8 636 aa8.43□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 SLC24A2Q9UI40 661 aa8.43□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 SATB2Q9UPW6 733 aa8.43□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa8.43□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 RP1P56715 2156 aa8.43□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 ASXL3Q9C0F0 2248 aa8.43□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 E5RI56 91 aa8.42□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 SLCO2B1O94956 709 aa8.42□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 C1QAP02745 245 aa8.42□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 AHSGP02765 367 aa8.42□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 APOA4P06727 396 aa8.42□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 TPBGLP0DKB5 382 aa8.42□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 HGFP14210 728 aa8.42□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 NDUFS1P28331 727 aa8.42□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 MAGEA4P43358 317 aa8.42□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 CAPZBP47756 277 aa8.42□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 CLCN7P51798 805 aa8.42□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 LIMK2P53671 638 aa8.42□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP8.42□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 MGAT5Q09328 741 aa8.42□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 ABRQ12979 859 aa8.42□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 CUL1Q13616 776 aa8.42□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 KRT33BQ14525 404 aa8.42□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 GBX1Q14549 363 aa8.42□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 C16orf72Q14CZ0 275 aa8.42□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 TMED2Q15363 201 aa8.42□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 ACSBG2Q5FVE4 666 aa8.42□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 SNAP47Q5SQN1 464 aa8.42□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa8.42□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 FOXR1Q6PIV2 292 aa8.42□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa8.42□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 PALM2Q8IXS6 379 aa8.42□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 ZBTB2Q8N680 514 aa8.42□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 ACVR1CQ8NER5 493 aa8.42□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.2 ms