RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	ACVR1	Q04771	509 aa		16.85	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	KCNJ11	Q14654	390 aa		16.85	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	LINC00303	Q3SY05	128 aa		16.85	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	CASC4	Q6P4E1	433 aa		16.85	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	CERS6	Q6ZMG9	384 aa		16.85	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF605	Q86T29	641 aa		16.85	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	HOOK3	Q86VS8	718 aa		16.85	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	OOSP2	Q86WS3	158 aa		16.85	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	CPT1B	Q92523	772 aa		16.85	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	PMEPA1	Q969W9	287 aa		16.85	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	DNAJC1	Q96KC8	554 aa	Known RBP	16.85	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	C12orf66	Q96MD2	445 aa		16.85	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	TFB2M	Q9H5Q4	396 aa	Known RBP	16.85	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	MVB12B	Q9H7P6	319 aa		16.85	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC24A2	Q9UI40	661 aa		16.85	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	ANAPC5	Q9UJX4	755 aa		16.85	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		16.85	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	SDR42E2	A6NKP2	422 aa		16.84	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	IFRD1	O00458	451 aa	Predicted RBP	16.84	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	DNALI1	O14645	258 aa	Predicted RBP	16.84	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	LIN7A	O14910	233 aa	Predicted RBP	16.84	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	RASSF9	O75901	435 aa		16.84	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	PAM	P19021	973 aa		16.84	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	STAT5A	P42229	794 aa		16.84	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	GRIA1	P42261	906 aa		16.84	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	PTGIR	P43119	386 aa		16.84	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	LEPR	P48357	1165 aa	Known RBP	16.84	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	HSD11B2	P80365	405 aa		16.84	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC38	Q502W7	563 aa		16.84	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	ZRANB3	Q5FWF4	1079 aa		16.84	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		16.84	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	TAS2R42	Q7RTR8	314 aa		16.84	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	VASH2	Q86V25	355 aa		16.84	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	SERPINA9	Q86WD7	417 aa		16.84	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	PPP1R3B	Q86XI6	285 aa		16.84	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	CFAP206	Q8IYR0	622 aa		16.84	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	D2HGDH	Q8N465	521 aa		16.84	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	ACVR1C	Q8NER5	493 aa		16.84	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	ARHGAP9	Q9BRR9	750 aa		16.84	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	WWP1	Q9H0M0	922 aa		16.84	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	OR52A5	Q9H2C5	316 aa		16.84	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	GPN2	Q9H9Y4	310 aa	Predicted RBP	16.84	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	16.84	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	HRASLS2	Q9NWW9	162 aa		16.84	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	16.84	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	KLHL3	Q9UH77	587 aa		16.84	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	PSMD13	Q9UNM6	376 aa		16.84	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	UTP11	Q9Y3A2	253 aa	Known RBP	16.84	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	GCN1	Q92616	2671 aa	Known RBP	16.83	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	EFCAB8	A8MWE9	144 aa		16.83	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	TTI1	O43156	1089 aa		16.83	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	ZBTB11	O95625	1053 aa	Predicted RBP	16.83	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	LIF	P15018	202 aa		16.83	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	MGAT1	P26572	445 aa		16.83	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	LY6D	Q14210	128 aa		16.83	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	PLCL1	Q15111	1095 aa		16.83	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	TBR1	Q16650	682 aa		16.83	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	DNAJC21	Q5F1R6	531 aa	Known RBP	16.83	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		16.83	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	IRGC	Q6NXR0	463 aa		16.83	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	16.83	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	DET1	Q7L5Y6	550 aa		16.83	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	TIPARP	Q7Z3E1	657 aa	Known RBP	16.83	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	SIDT2	Q8NBJ9	832 aa	Known RBP	16.83	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	GPR150	Q8NGU9	434 aa		16.83	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	OR6P1	Q8NGX9	317 aa		16.83	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	SEC14L1	Q92503	715 aa		16.83	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	SNF8	Q96H20	258 aa		16.83	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	OR6C1	Q96RD1	312 aa		16.83	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	RAB17	Q9H0T7	212 aa		16.83	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF106	Q9H2Y7	1883 aa	Known RBP	16.83	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	COG4	Q9H9E3	785 aa		16.83	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	MRM3	Q9HC36	420 aa	Known RBP	16.83	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	APMAP	Q9HDC9	416 aa		16.83	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	LATS2	Q9NRM7	1088 aa		16.83	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	KCND3	Q9UK17	655 aa		16.83	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	BTRC	Q9Y297	605 aa		16.83	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	PCDHGA6	Q9Y5G7	932 aa		16.83	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	GOLGA8M	H3BSY2	632 aa		16.82	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	PFDN6	O15212	129 aa		16.82	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	SPAG6	O75602	509 aa		16.82	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	FTH1	P02794	183 aa		16.82	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	WT1	P19544	449 aa	Predicted RBP	16.82	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	FOXM1	Q08050	763 aa		16.82	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	C2orf54	Q08AI8	447 aa		16.82	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	PRKAA1	Q13131	559 aa		16.82	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	CALCOCO2	Q13137	446 aa		16.82	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	SRSF6	Q13247	344 aa	Known RBP	16.82	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	MORF4L2	Q15014	288 aa		16.82	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	16.82	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		16.82	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	16.82	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	ARMC6	Q6NXE6	501 aa		16.82	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	BORA	Q6PGQ7	559 aa		16.82	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	AFTPH	Q6ULP2	937 aa		16.82	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	16.82	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		16.82	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	EXD3	Q8N9H8	876 aa		16.82	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	RMDN2	Q96LZ7	410 aa		16.82	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	CTRC	Q99895	268 aa		16.82	■□□□□ 0.28

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