RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488923.1

HDLBP-243, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-243ENST00000488923 ZFP64Q9NPA5 681 aa6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 C8orf4Q9NR00 106 aa6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 HEBP1Q9NRV9 189 aa6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 OBP2AQ9NY56 170 aa6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 PLK2Q9NYY3 685 aa6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 TMEM181Q9P2C4 612 aa6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 FBXO10Q9UK96 956 aa6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 ERVW-1Q9UQF0 538 aa6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 MYLKQ15746 1914 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 MAGEA13PA6NCF6 341 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 CCDC154A6NI56 674 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 AQP12BA6NM10 295 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 HIDE1A8MVS5 230 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 H0Y858 1186 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 NR5A2O00482 541 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 ACOT8O14734 319 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 TRIM24O15164 1050 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 MOSPD3O75425 235 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 STK16O75716 305 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 SLC22A3O75751 556 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 ATP6AP2O75787 350 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 OR4F21O95013 312 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 PRAMEF12O95522 483 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 PRNPP04156 253 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 UGT2B4P06133 528 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 C8BP07358 591 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 LINC00032P0C843 101 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 ADH5P11766 374 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 HSD17B1P14061 328 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 ACPPP15309 386 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 EPB42P16452 691 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 GJA1P17302 382 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 MAPK1P28482 360 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 DGKGP49619 791 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 STK19P49842 368 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 PNLIPRP1P54315 467 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 RHDQ02161 417 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 ELP6Q0PNE2 266 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 PRKG2Q13237 762 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 BLMHQ13867 455 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 CEACAM7Q14002 265 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 RCAN2Q14206 197 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 GBX1Q14549 363 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 PDGFRLQ15198 375 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 GGTA1PQ4G0N0 100 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 IZUMO2Q6UXV1 221 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 CYHR1Q6ZMK1 362 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 DSG4Q86SJ6 1040 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 ADIPOR2Q86V24 386 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 SPATA24Q86W54 205 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 AQP12AQ8IXF9 295 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 ICA1LQ8NDH6 482 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 GPR26Q8NDV2 337 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 DDHD1Q8NEL9 900 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 TNIP2Q8NFZ5 429 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 MCOLN3Q8TDD5 553 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 ASZ1Q8WWH4 475 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 PYDC1Q8WXC3 89 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 RHBDF1Q96CC6 855 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 SPDL1Q96EA4 605 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 PPP1R16AQ96I34 528 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 MARK4Q96L34 752 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 C3orf30Q96M34 536 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 KLHL32Q96NJ5 620 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 SMIM14Q96QK8 99 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 SLC30A3Q99726 388 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 SH3GL1Q99961 368 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 C17orf80Q9BSJ5 609 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 SLC12A9Q9BXP2 914 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 GRIP2Q9C0E4 1043 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 TUBB1Q9H4B7 451 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 SLC32A1Q9H598 525 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-243ENST00000488923 IPPKQ9H8X2 491 aa6.5□□□□□ -1.37
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