RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485349.5

SKIV2L-211, Transcript of Ski2 like RNA helicase, humanhuman

TSL 2

Gene SKIV2L, Length 734 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2L-211ENST00000485349 FERD3LQ96RJ6 166 aa16.44■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 OR52A5Q9H2C5 316 aa16.44■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 SRMSQ9H3Y6 488 aa16.44■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 FANCEQ9HB96 536 aa16.44■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 ACSS2Q9NR19 701 aa16.44■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 C1GALT1Q9NS00 363 aa16.44■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 EFR3BQ9Y2G0 817 aa16.44■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 DUSP10Q9Y6W6 482 aa16.44■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 SEC16AO15027 2179 aa16.43■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa16.43■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 SOWAHDA6NJG2 315 aa16.43■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 TMEM150CB9EJG8 249 aa16.43■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 CFAP99D6REC4 459 aa16.43■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 MEN1O00255 615 aa16.43■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 MATN2O00339 956 aa16.43■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 BTN3A3O00478 584 aa16.43■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 ACRV1P26436 265 aa16.43■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 PDHA2P29803 388 aa16.43■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 HADHAP40939 763 aa16.43■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 UQCRFS1P47985 274 aa16.43■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 PREPP48147 710 aa16.43■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 LMAN1P49257 510 aa16.43■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 PGDP52209 483 aa16.43■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 GSDMDP57764 484 aa16.43■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 NADK2Q4G0N4 442 aa16.43■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 OR52E1Q8NGJ3 308 aa16.43■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 OR1L3Q8NH93 324 aa16.43■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa16.43■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 CPT1BQ92523 772 aa16.43■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 ALG3Q92685 438 aa16.43■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 CLIP3Q96DZ5 547 aa16.43■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 HGH1Q9BTY7 390 aa16.43■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 SLC25A23Q9BV35 468 aa16.43■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 PITPNM3Q9BZ71 974 aa16.43■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 TRIM5Q9C035 493 aa16.43■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 ING2Q9H160 280 aa16.43■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 ARNT2Q9HBZ2 717 aa16.43■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 PCMTD2Q9NV79 361 aa16.43■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa16.43■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 SNX7Q9UNH6 387 aa16.43■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 TEX15Q9BXT5 2789 aa16.42■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa16.42■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa16.42■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 PVRP15151 417 aa16.42■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 CCL11P51671 97 aa16.42■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa16.42■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 FAM198BQ6UWH4 519 aa16.42■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 SERPINA9Q86WD7 417 aa16.42■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa16.42■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 PHC3Q8NDX5 983 aa16.42■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 HEXDCQ8WVB3 486 aa16.42■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 C19orf43Q9BQ61 176 aa16.42■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 KLHL25Q9H0H3 589 aa16.42■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 XKR8Q9H6D3 395 aa16.42■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 MLXIPLQ9NP71 852 aa16.42■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 TTLL8A6PVC2 850 aa16.41■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 TJP3O95049 919 aa16.41■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 CAPN1P07384 714 aa16.41■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 RAB40ALP0C0E4 278 aa16.41■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 GP1BBP13224 206 aa16.41■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 TPH1P17752 444 aa16.41■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 CYP2A7P20853 494 aa16.41■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 RWDD2BP57060 319 aa16.41■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 PTCHD3Q3KNS1 767 aa16.41■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 GPR33Q49SQ1 333 aa16.41■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 KCTD11Q693B1 232 aa16.41■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 PIANPQ8IYJ0 282 aa16.41■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 SYTL1Q8IYJ3 562 aa16.41■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 CLDN19Q8N6F1 224 aa16.41■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa16.41■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 NLNQ9BYT8 704 aa16.41■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 VPS37BQ9H9H4 285 aa16.41■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 TCFL5Q9UL49 500 aa16.41■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 ICE1Q9Y2F5 2266 aa16.41■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 CCDC88CQ9P219 2028 aa16.4■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 BLACEA4D250 179 aa16.4■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 H7C0S8 307 aa16.4■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 TMEM63AO94886 807 aa16.4■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 METTL18O95568 372 aa16.4■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 MSL3P1P0C860 447 aa16.4■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 ITGA1P56199 1179 aa16.4■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 PRKG2Q13237 762 aa16.4■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 POU6F1Q14863 301 aa16.4■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 DBN1Q16643 649 aa16.4■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 TAS2R42Q7RTR8 314 aa16.4■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 AMIGO1Q86WK6 493 aa16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.4 ms