RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480058.5

PRPF4B-205, Transcript of pre-mRNA processing factor 4B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRPF4B, Length 6,775 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4B-205ENST00000480058 DUSP26Q9BV47 211 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 MGAT4BQ9UQ53 548 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 TMEM5Q9Y2B1 443 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 A8MUI8 341 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 FFAR3O14843 346 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 GPR42O15529 346 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 RCBTB2O95199 551 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 OR5F1O95221 314 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 HDCP19113 662 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP6.06□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 CENPAP49450 140 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 CXCR4P61073 352 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 CRADDP78560 199 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 TLDC1Q6P9B6 456 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 GPR65Q8IYL9 337 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 MTMR14Q8NCE2 650 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 TTLL2Q9BWV7 592 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 DPAGT1Q9H3H5 408 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 ZNF358Q9NW07 568 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 MGAT4AQ9UM21 535 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 A8MT66 165 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 H3BM21 787 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 GNB5O14775 395 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 NME6O75414 186 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 TACSTD2P09758 323 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 TNNI3P19429 210 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 RPL4P36578 427 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 ADAM8P78325 824 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 MPPE1Q53F39 396 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 VN1R5Q7Z5H4 357 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 MFSD2AQ8NA29 543 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 FAM136AQ96C01 138 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 MED8Q96G25 268 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 MRI1Q9BV20 369 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 FBXW11Q9UKB1 542 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 ASB4Q9Y574 426 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 H3BSA7 217 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 H3BUI4 141 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 IRAK2O43187 625 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 CDK14O94921 469 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 PGLSO95336 258 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 EBLN1P0CF75 366 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 CD247P20963 164 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 DCDC1P59894 354 aa6.05□□□□□ -1.44
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PRPF4B-205ENST00000480058 BNIP3Q12983 259 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 KCNC3Q14003 757 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 IL18Q14116 193 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 ZBTB6Q15916 424 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 GPR158Q5T848 1215 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 LRP10Q7Z4F1 713 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 UBQLNLQ8IYU4 475 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 CENPSQ8N2Z9 138 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 MS4A15Q8N5U1 240 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 OR10G2Q8NGC3 310 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 AZIN2Q96A70 460 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 MGME1Q9BQP7 344 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 ACSL4O60488 711 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 AP2A2O94973 939 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 GADD45GO95257 159 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 POP4O95707 220 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 PRNPP04156 253 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 RLN1P04808 185 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 PHC1P78364 1004 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 CHIT1Q13231 466 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 SERINC3Q13530 473 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 CAMK1Q14012 370 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 CTC1Q2NKJ3 1217 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 TCEAL5Q5H9L2 206 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 MBLAC2Q68D91 279 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 TMEM17Q86X19 198 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 GATAD2AQ86YP4 633 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 RTP4Q96DX8 246 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 BRD9Q9H8M2 597 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 RASSF1Q9NS23 344 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 ASB3Q9Y575 518 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 MAB21L2Q9Y586 359 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 ERCC6L2Q5T890 1561 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 SOBPA7XYQ1 873 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 PIP5K1BO14986 540 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 AXIN1O15169 862 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 C22orf31O95567 290 aa6.05□□□□□ -1.44
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