RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474272.1

TMEM50B-208, Transcript of transmembrane protein 50B, human

TSL 3

Gene TMEM50B, Length 518 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM50B-208	ENST00000474272	CTAGE9	A4FU28	777 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	HEPACAM2	A8MVW5	462 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	ANKRD66	B4E2M5	251 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272		H0YIN7	160 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	CAPN9	O14815	690 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	SSX4	O60224	188 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	PRAMEF11	O60813	436 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	CTAGE8	P0CG41	777 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	DNASE1	P24855	282 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	CAPZA2	P47755	286 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	FMO5	P49326	533 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	MMP15	P51511	669 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	ALCAM	Q13740	583 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	CTAGE4	Q8IX94	777 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	TC2N	Q8N9U0	490 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	TDRD5	Q8NAT2	981 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	SMPDL3B	Q92485	455 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	LINGO1	Q96FE5	620 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	OXNAD1	Q96HP4	312 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	LINC00615	Q96LM1	132 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	NEK1	Q96PY6	1258 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	LITAF	Q99732	161 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	NEURL2	Q9BR09	285 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	RBM4	Q9BWF3	364 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	HHATL	Q9HCP6	504 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	PRSS51	A0A1B0GVH4	220 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	TCRBV21S2A2	A0A5A6	115 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	3.34	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	TBX10	O75333	385 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	C22orf31	O95567	290 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	PRSS1	P07477	247 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	GJA1	P17302	382 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	CPT2	P23786	658 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	GABRA5	P31644	462 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	MC5R	P33032	325 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	AHR	P35869	848 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	CCR3	P51677	355 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	HNRNPK	P61978	463 aa	Known RBP eCLIP	3.34	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	CDK3	Q00526	305 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	SNAPC1	Q16533	368 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	LETM2	Q2VYF4	491 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	CBWD6	Q4V339	395 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	GCNT6	Q5T4J0	391 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	FAM171B	Q6P995	826 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	FIGLA	Q6QHK4	219 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	PLEKHM3	Q6ZWE6	761 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	CAMKMT	Q7Z624	323 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	TEKT4	Q8WW24	435 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	RADIL	Q96JH8	1075 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	FAM81B	Q96LP2	452 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	MS4A10	Q96PG2	267 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	OR6C1	Q96RD1	312 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	GPR88	Q9GZN0	384 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	DPAGT1	Q9H3H5	408 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	TBC1D17	Q9HA65	648 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	OLAH	Q9NV23	265 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	OSER1	Q9NX31	292 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	HAO2	Q9NYQ3	351 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	GIMAP2	Q9UG22	337 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	POU2F3	Q9UKI9	436 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	YIPF1	Q9Y548	306 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TMEM50B-208	ENST00000474272	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.88
TMEM50B-208	ENST00000474272	TNFSF12-TNFSF13	A0A0A6YY99	330 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TMEM50B-208	ENST00000474272	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
TMEM50B-208	ENST00000474272		A0A1W2PPM1	405 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TMEM50B-208	ENST00000474272		A0A1W2PS18	150 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TMEM50B-208	ENST00000474272	ASPDH	A6ND91	283 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TMEM50B-208	ENST00000474272	ANKUB1	A6NFN9	424 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TMEM50B-208	ENST00000474272	URAD	A6NGE7	173 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TMEM50B-208	ENST00000474272	DVL1	O14640	695 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TMEM50B-208	ENST00000474272	XRCC3	O43542	346 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TMEM50B-208	ENST00000474272	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
TMEM50B-208	ENST00000474272	OR10H2	O60403	315 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TMEM50B-208	ENST00000474272	TADA2A	O75478	443 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TMEM50B-208	ENST00000474272	SLCO2B1	O94956	709 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TMEM50B-208	ENST00000474272	BMP10	O95393	424 aa		3.33	□□□□□ -1.88

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