RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 CEP295Q9C0D2 2601 aa16.42■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 TAF4O00268 1085 aa16.42■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 ITGA2BP08514 1039 aa16.42■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 ANKRD34CP0C6C1 535 aa16.42■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 MPSTP25325 297 aa16.42■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 HSPA14Q0VDF9 509 aa16.42■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 CTBP1Q13363 440 aa16.42■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 BRD3Q15059 726 aa16.42■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 PLCL1Q15111 1095 aa16.42■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 TMED2Q15363 201 aa16.42■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 TBC1D25Q3MII6 688 aa16.42■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF789Q5FWF6 425 aa16.42■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 NAPRTQ6XQN6 538 aa16.42■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 UNC5AQ6ZN44 842 aa16.42■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 OTOAQ7RTW8 1153 aa16.42■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 DENND6AQ8IWF6 608 aa16.42■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 CNTN4Q8IWV2 1026 aa16.42■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 MMGT1Q8N4V1 131 aa16.42■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 PHC3Q8NDX5 983 aa16.42■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 RSC1A1Q92681 617 aa16.42■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 FGF11Q92914 225 aa16.42■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 ART4Q93070 314 aa16.42■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 CERS2Q96G23 380 aa16.42■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 C9orf72Q96LT7 481 aa16.42■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 PLAC1Q9HBJ0 212 aa16.42■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 SEMA5BQ9P283 1151 aa16.42■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 POLG2Q9UHN1 485 aa16.42■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 CHMP2BQ9UQN3 213 aa16.42■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 ASF1AQ9Y294 204 aa16.42■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa16.42■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 COMMD10Q9Y6G5 202 aa16.42■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa16.42■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 ACACBO00763 2458 aa16.42■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 OR5K3A6NET4 321 aa16.41■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 CDRT15L2A8MXV6 281 aa16.41■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 TNFSF15O95150 251 aa16.41■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 JMJD7P0C870 316 aa16.41■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 ERVK-10P10266 1014 aa16.41■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 CHRM3P20309 590 aa16.41■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP16.41■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC1A2P43004 574 aa16.41■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 KIAA0408Q6ZU52 694 aa16.41■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 GALNT7Q86SF2 657 aa16.41■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 CLEC14AQ86T13 490 aa16.41■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 UNC5BQ8IZJ1 945 aa16.41■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 RCBTB1Q8NDN9 531 aa16.41■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 SEC14L1Q92503 715 aa16.41■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 CD180Q99467 661 aa16.41■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 PHACTR1Q9C0D0 580 aa16.41■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 ZMYND15Q9H091 742 aa16.41■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 THSD1Q9NS62 852 aa16.41■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 HRASLS2Q9NWW9 162 aa16.41■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa16.41■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 B4E171 279 aa16.4■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 NVLO15381 856 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 HAUS5O94927 633 aa16.4■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 ATP5DP30049 168 aa16.4■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 TSPAN7P41732 249 aa16.4■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 GBX1Q14549 363 aa16.4■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa16.4■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 C8orf74Q6P047 294 aa16.4■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 UNC5DQ6UXZ4 953 aa16.4■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 PRSS42Q7Z5A4 293 aa16.4■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 OOSP2Q86WS3 158 aa16.4■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 VRK3Q8IV63 474 aa16.4■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 FBXO36Q8NEA4 188 aa16.4■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 OR4E2Q8NGC2 313 aa16.4■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 OR5K2Q8NHB8 316 aa16.4■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 GSDMBQ8TAX9 411 aa16.4■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 LCN9Q8WX39 176 aa16.4■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 KCNJ9Q92806 393 aa16.4■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 TGM7Q96PF1 710 aa16.4■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 LRRC1Q9BTT6 524 aa16.4■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 CCDC68Q9H2F9 335 aa16.4■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 MOCS1Q9NZB8 636 aa16.4■□□□□ 0.22
RABGEF1-204ENST00000442563 PMS2P1A4D2B8 440 aa16.39■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 CTAGE15A4D2H0 777 aa16.39■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 MATN2O00339 956 aa16.39■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 KDM1AO60341 852 aa16.39■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 NIPSNAP2O75323 286 aa16.39■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 RPN2P04844 631 aa16.39■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 CTAGE8P0CG41 777 aa16.39■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 HGFP14210 728 aa16.39■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 PLTPP55058 493 aa16.39■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 GFERP55789 205 aa16.39■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 ST3GAL2Q16842 350 aa16.39■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 SNAP47Q5SQN1 464 aa16.39■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF549Q6P9A3 640 aa16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.2 ms