RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441222.7

USP46-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP46, Length 7,954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-201ENST00000441222 CDH13P55290 713 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 MAXP61244 160 aa6.58□□□□□ -1.36
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USP46-201ENST00000441222 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 HERC3Q15034 1050 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 IL23RQ5VWK5 629 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 SATL1Q86VE3 508 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 ZNF709Q8N972 641 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 THAP6Q8TBB0 222 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa6.58□□□□□ -1.36
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USP46-201ENST00000441222 ELMO3Q96BJ8 720 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 PLD4Q96BZ4 506 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 NXNL1Q96CM4 212 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 LMLNQ96KR4 655 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 SLC35G5Q96KT7 338 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 KCTD7Q96MP8 289 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 ABCB9Q9NP78 766 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 PLGP00747 810 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
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USP46-201ENST00000441222 GSTM3P21266 225 aa6.58□□□□□ -1.36
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USP46-201ENST00000441222 ECT2LQ008S8 904 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 ADAM15Q13444 863 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 SEMA5AQ13591 1074 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 TUBA3EQ6PEY2 450 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 IFNL1Q8IU54 200 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 KLHL36Q8N4N3 616 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 IL12RB2Q99665 862 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 CIB1Q99828 191 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 CDT1Q9H211 546 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 SPATA7Q9P0W8 599 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 ABCG2Q9UNQ0 655 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 IFT52Q9Y366 437 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 MAU2Q9Y6X3 613 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 VWDEQ8N2E2 1590 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 ESR1P03372 595 aa6.58□□□□□ -1.36
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USP46-201ENST00000441222 GSTT2P0CG29 244 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 FOSL2P15408 326 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 SP100P23497 879 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 AQP1P29972 269 aa6.58□□□□□ -1.36
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USP46-201ENST00000441222 CNTN2Q02246 1040 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 CXCL9Q07325 125 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 MAP2K5Q13163 448 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 SLC13A2Q13183 592 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 SNTA1Q13424 505 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 VMACQ2NL98 169 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 CDKL4Q5MAI5 379 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 ASB18Q6ZVZ8 466 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 NRSN1Q8IZ57 195 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 COPS4Q9BT78 406 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 RMI1Q9H9A7 625 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 ARL8BQ9NVJ2 186 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 TELO2Q9Y4R8 837 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 PTPRJQ12913 1337 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 SYN3O14994 580 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 OR1F1O43749 312 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 ARHGAP8P85298 464 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 NOGQ13253 232 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 IQCCQ4KMZ1 466 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 SLC9A4Q6AI14 798 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 NIPAL1Q6NVV3 410 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 CLNKQ7Z7G1 428 aa6.58□□□□□ -1.36
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USP46-201ENST00000441222 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
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USP46-201ENST00000441222 FAM83DQ9H4H8 585 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 SMURF1Q9HCE7 757 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 PTTG2Q9NZH5 202 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 FETUBQ9UGM5 382 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 ICE1Q9Y2F5 2266 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 DAPL1A0PJW8 107 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 RAP2AP10114 183 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 MMP8P22894 467 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 GRIA1P42261 906 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 GLUD2P49448 558 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 CCR8P51685 355 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 CLCN4P51793 760 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 CRISP3P54108 245 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa6.58□□□□□ -1.36
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