RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM125Q96AQ2 219 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 C3orf30Q96M34 536 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 TAAR1Q96RJ0 339 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 MCMBPQ9BTE3 642 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 UCK2Q9BZX2 261 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 TNKS2Q9H2K2 1166 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 ACAD9Q9H845 621 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 ERVK13-1Q9NX77 482 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 BBIP1A8MTZ0 92 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 LEUTXA8MZ59 168 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 PLK4O00444 970 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 DGAT1O75907 488 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 MED26O95402 600 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 MT-ND2P03891 347 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 PGK2P07205 417 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 UMPSP11172 480 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 KCNA5P22460 613 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 GPR50Q13585 617 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 NFYCQ13952 458 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM83EQ2M2I3 478 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 RAB43Q86YS6 212 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 APOL2Q9BQE5 337 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 GON7Q9BXV9 100 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 LRRC4Q9HBW1 653 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 ACOT9Q9Y305 439 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC12A8A0AV02 714 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 MEIOCA2RUB1 952 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 OR6C70A6NIJ9 312 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 PDPK1O15530 556 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 HS6ST1O60243 411 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 SNX4O95219 450 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 LCKP06239 509 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 CYBAP13498 195 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM11P17152 192 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 ALAS2P22557 587 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 PRKACGP22612 351 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 HRH2P25021 359 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 ACVR2AP27037 513 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 CTGFP29279 349 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 TNFSF9P41273 254 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 HCAR3P49019 387 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 BCAT1P54687 386 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 IL1RL1Q01638 556 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 INCA1Q0VD86 236 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 CDK5R2Q13319 367 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 DSC3Q14574 896 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 MFSD10Q14728 455 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 STARD3Q14849 445 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 PARP15Q460N3 678 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF484Q5JVG2 852 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 METTL11BQ5VVY1 283 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC6A19Q695T7 634 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF470Q6ECI4 717 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 JADE1Q6IE81 842 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 VN1R5Q7Z5H4 357 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 RNF135Q8IUD6 432 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 SEPT1Q8WYJ6 367 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 PYCR2Q96C36 320 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 PHF21BQ96EK2 531 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 NSMCE2Q96MF7 247 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 TBCBQ99426 244 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 UQCC2Q9BRT2 126 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 NFKBIZQ9BYH8 718 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 LHX5Q9H2C1 402 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 ANKHQ9HCJ1 492 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 TM9SF3Q9HD45 589 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 NUP50Q9UKX7 468 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 VANGL2Q9ULK5 521 aa8.26□□□□□ -1.09
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RABGEF1-203ENST00000439720 OR5K3A6NET4 321 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 H3BMM5 538 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 TSPAN4O14817 238 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 MED7O43513 233 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 MICAL2O94851 1124 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 PGK1P00558 417 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 FTH1P02794 183 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC15A1P46059 708 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM132BQ14DG7 1078 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 C5orf22Q49AR2 442 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 CERCAMQ5T4B2 595 aa8.26□□□□□ -1.09
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