RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 RAB34Q9BZG1 259 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 IMPG2Q9BZV3 1241 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 PSD3Q9NYI0 1048 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 RASAL2Q9UJF2 1139 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 KCND3Q9UK17 655 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 PRDM4Q9UKN5 801 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 CSMD1Q96PZ7 3565 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 KIF26BQ2KJY2 2108 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 MTORP42345 2549 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 ANKUB1A6NFN9 424 aa6.21□□□□□ -1.42
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PTPRK-211ENST00000429595 E9PLN8 166 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 MAP2K7O14733 419 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 MDM4O15151 490 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 CASC3O15234 703 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 URI1O94763 535 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
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PTPRK-211ENST00000429595 GYPCP04921 128 aa6.21□□□□□ -1.42
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PTPRK-211ENST00000429595 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
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PTPRK-211ENST00000429595 PRCPP42785 496 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 CLDN2P57739 230 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 ZBED6P86452 979 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 LRRC63Q05C16 580 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 C1orf61Q13536 156 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 PTK2BQ14289 1009 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 LLGL1Q15334 1064 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
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PTPRK-211ENST00000429595 VWA2Q5GFL6 755 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 C9orf64Q5T6V5 341 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 OR6B2Q6IFH4 312 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 TTI2Q6NXR4 508 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 WDR93Q6P2C0 686 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 C1orf186Q6ZWK4 172 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 NRSN1Q8IZ57 195 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 STK40Q8N2I9 435 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 CPXM2Q8N436 756 aa6.21□□□□□ -1.42
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PTPRK-211ENST00000429595 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 NELFBQ8WX92 580 aa6.21□□□□□ -1.42
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PTPRK-211ENST00000429595 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
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PTPRK-211ENST00000429595 VKORC1Q9BQB6 163 aa6.21□□□□□ -1.42
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PTPRK-211ENST00000429595 SLC13A1Q9BZW2 595 aa6.21□□□□□ -1.42
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PTPRK-211ENST00000429595 COPG2Q9UBF2 871 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 POLHQ9Y253 713 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
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PTPRK-211ENST00000429595 SDK2Q58EX2 2172 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
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PTPRK-211ENST00000429595 A6NCN8 305 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 K7ENM7 598 aa6.2□□□□□ -1.42
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PTPRK-211ENST00000429595 LRRTM2O43300 516 aa6.2□□□□□ -1.42
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PTPRK-211ENST00000429595 CBX6O95503 412 aa6.2□□□□□ -1.42
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PTPRK-211ENST00000429595 ARHGEF7Q14155 803 aa6.2□□□□□ -1.42
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PTPRK-211ENST00000429595 MTX3Q5HYI7 312 aa6.2□□□□□ -1.42
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PTPRK-211ENST00000429595 C11orf87Q6NUJ2 197 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 NEK5Q6P3R8 708 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 RAD9BQ6WBX8 426 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 UNC13DQ70J99 1090 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 MYCT1Q8N699 235 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 ARL10Q8N8L6 244 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 KDM1BQ8NB78 822 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa6.2□□□□□ -1.42
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