RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 NOGQ13253 232 aa18.02■□□□□ 0.48
RALGPS1-208ENST00000424082 SERINC3Q13530 473 aa18.02■□□□□ 0.48
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF235Q14590 738 aa18.02■□□□□ 0.48
RALGPS1-208ENST00000424082 ACOX1Q15067 660 aa18.02■□□□□ 0.48
RALGPS1-208ENST00000424082 MAPK11Q15759 364 aa18.02■□□□□ 0.48
RALGPS1-208ENST00000424082 PRR23BQ6ZRT6 265 aa18.02■□□□□ 0.48
RALGPS1-208ENST00000424082 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa18.02■□□□□ 0.48
RALGPS1-208ENST00000424082 SVOPLQ8N434 492 aa18.02■□□□□ 0.48
RALGPS1-208ENST00000424082 FBXO30Q8TB52 745 aa18.02■□□□□ 0.48
RALGPS1-208ENST00000424082 GPR152Q8TDT2 470 aa18.02■□□□□ 0.48
RALGPS1-208ENST00000424082 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
RALGPS1-208ENST00000424082 PEX13Q92968 403 aa18.02■□□□□ 0.48
RALGPS1-208ENST00000424082 BTBD2Q9BX70 525 aa18.02■□□□□ 0.48
RALGPS1-208ENST00000424082 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa18.02■□□□□ 0.48
RALGPS1-208ENST00000424082 SPO11Q9Y5K1 396 aa18.02■□□□□ 0.48
RALGPS1-208ENST00000424082 KATNA1O75449 491 aa18.02■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 G6PDP11413 515 aa18.02■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 FSHRP23945 695 aa18.02■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 OR1E1P30953 314 aa18.02■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 VBP1P61758 197 aa18.02■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP18.02■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 PTPRNQ16849 979 aa18.02■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 NECAB2Q7Z6G3 386 aa18.02■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 OR4K2Q8NGD2 314 aa18.02■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa18.02■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 C17orf50Q8WW18 174 aa18.02■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 FIG4Q92562 907 aa18.02■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 YIPF6Q96EC8 236 aa18.02■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 CAPNS2Q96L46 248 aa18.02■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 NSMCE3Q96MG7 304 aa18.02■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 ACTL8Q9H568 366 aa18.02■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 KLHL3Q9UH77 587 aa18.02■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 UTS2RQ9UKP6 389 aa18.02■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa18.02■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa18.02■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa18.01■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 E2F3O00716 465 aa18.01■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 STX16O14662 325 aa18.01■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 HS6ST1O60243 411 aa18.01■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 OR1I1O60431 355 aa18.01■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 TSPAN12O95859 305 aa18.01■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 ACVR2AP27037 513 aa18.01■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 HTR6P50406 440 aa18.01■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 SPESP1Q6UW49 350 aa18.01■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 ARMC8Q8IUR7 673 aa18.01■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM126BQ8IXS8 530 aa18.01■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 OR56A4Q8NGH8 313 aa18.01■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF583Q96ND8 569 aa18.01■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 ADAM2Q99965 735 aa18.01■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa18.01■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 TPK1Q9H3S4 243 aa18.01■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 A8MU76 341 aa18.01■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 GNGT2O14610 69 aa18.01■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 XPNPEP2O43895 674 aa18.01■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 NIPSNAP2O75323 286 aa18.01■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 NDUFS3O75489 264 aa18.01■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC159P0C7I6 412 aa18.01■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 ERVPABLB-1P60509 514 aa18.01■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 CDK5R2Q13319 367 aa18.01■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 LETMD1Q6P1Q0 360 aa18.01■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 FKBP9P1Q75LS8 142 aa18.01■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 MON1AQ86VX9 555 aa18.01■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 ABI1Q8IZP0 508 aa18.01■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 CNIH3Q8TBE1 160 aa18.01■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 FRS2Q8WU20 508 aa18.01■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa18.01■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 RORBQ92753 470 aa18.01■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 GORASP2Q9H8Y8 452 aa18.01■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM45AQ9NWC5 275 aa18.01■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 ERVK-18Q9QC07 812 aa18.01■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF229Q9UJW7 825 aa18.01■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 NOD1Q9Y239 953 aa18.01■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa18.01■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 TTC34A8MYJ7 566 aa18■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 KLK8O60259 260 aa18■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 NDST3O95803 873 aa18■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 CD40LGP29965 261 aa18■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 GRK4P32298 578 aa18■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 MAP2K4P45985 399 aa18■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 CDC20Q12834 499 aa18■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 NEK10Q6ZWH5 1172 aa18■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 AADATQ8N5Z0 425 aa18■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 MCOLN3Q8TDD5 553 aa18■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF566Q969W8 418 aa18■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC47A1Q96FL8 570 aa18■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC115Q96NT0 180 aa18■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
RALGPS1-208ENST00000424082 CD274Q9NZQ7 290 aa18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms