RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415409.5

HDAC8-211, Transcript of histone deacetylase 8, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC8, Length 913 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8-211ENST00000415409 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 IKZF3Q9UKT9 509 aa6.51□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 MKL2Q9ULH7 1088 aa6.51□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 SCML1Q9UN30 329 aa6.51□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 COQ6Q9Y2Z9 468 aa6.51□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 FIS1Q9Y3D6 152 aa6.51□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa6.51□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 CAPN7Q9Y6W3 813 aa6.51□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 TRANK1O15050 2925 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 IGLON5A6NGN9 336 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 OR2AG2A6NM03 316 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 TMEM233B4DJY2 109 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 E9PBE3 544 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 AZIN1O14977 448 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 SLC22A2O15244 555 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 MBTPS2O43462 519 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 VEGFDO43915 354 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 KLHL41O60662 606 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 VPS4BO75351 444 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 GPC4O75487 556 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 CBX6O95503 412 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 ESRRBO95718 433 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 GUCA1CO95843 209 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 EGFP01133 1207 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 ENO1P06733 434 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 ANXA5P08758 320 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 ACADMP11310 421 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 HOXB2P14652 356 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 GM2AP17900 193 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 TSPAN8P19075 237 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 AOC1P19801 751 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 PTPN4P29074 926 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 EPHA3P29320 983 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 PRDX6P30041 224 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 DRD3P35462 400 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 MAGEA9P43362 315 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 PIK3CGP48736 1102 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 PRLHRP49683 370 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 HK3P52790 923 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 INHBCP55103 352 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 CDH13P55290 713 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 AP1S2P56377 157 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 RPS21P63220 83 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 CDKL1Q00532 357 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 BTKQ06187 659 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 CDC16Q13042 620 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 SGCGQ13326 291 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 TUBB3Q13509 450 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 GBX1Q14549 363 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 TLR1Q15399 786 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 PPP1R3AQ16821 1122 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 SPRED3Q2MJR0 410 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 BCL7AQ4VC05 210 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 C4orf17Q53FE4 359 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 OXLD1Q5BKU9 147 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 TMEM196Q5HYL7 178 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 EOGTQ5NDL2 527 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 AGBL4Q5VU57 503 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 KANK2Q63ZY3 851 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 SBSNQ6UWP8 590 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 TCAIMQ8N3R3 496 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 AADATQ8N5Z0 425 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 IL17RCQ8NAC3 791 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 PDPRQ8NCN5 879 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 CEP70Q8NHQ1 597 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 MAPK15Q8TD08 544 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 MCOLN3Q8TDD5 553 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 ACTRT2Q8TDY3 377 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 ASB11Q8WXH4 323 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 GLMNQ92990 594 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 ATP6V1E2Q96A05 226 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 TMEM159Q96B96 161 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 CMTM5Q96DZ9 223 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 HIC2Q96JB3 615 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 FOPNLQ96NB1 174 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 OR52B2Q96RD2 323 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 CCT7Q99832 543 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 CCDC106Q9BWC9 280 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 SLC12A9Q9BXP2 914 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 OR2AG1Q9H205 316 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 LRMDAQ9H2I8 198 aa6.5□□□□□ -1.37
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