RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411398.1

RNU6-1052P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1052, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1052P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TAF4O00268 1085 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1052P-201ENST00000411398 APOL1O14791 398 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1052P-201ENST00000411398 DNPH1O43598 174 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SCO2O43819 266 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1052P-201ENST00000411398 GLRA3O75311 464 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CBR3O75828 277 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ACTL6AO96019 429 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1052P-201ENST00000411398 MT-ND1P03886 318 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CYC1P08574 325 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1052P-201ENST00000411398 KRT19P08727 400 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1052P-201ENST00000411398 HOXB5P09067 269 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PCP11498 1178 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1052P-201ENST00000411398 LYL1P12980 280 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1052P-201ENST00000411398 LMO2P25791 158 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1052P-201ENST00000411398 KLRK1P26718 216 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SERPINA4P29622 427 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1052P-201ENST00000411398 OAS2P29728 719 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PDHA2P29803 388 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1052P-201ENST00000411398 AKT1P31749 480 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RIDAP52758 137 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1052P-201ENST00000411398 KRTAP12-1P59990 96 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NAAAQ02083 359 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1052P-201ENST00000411398 BLMHQ13867 455 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ZNF146Q15072 292 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RPS6KA2Q15349 733 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RAB30Q15771 203 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1052P-201ENST00000411398 MPPED2Q15777 294 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1052P-201ENST00000411398 LY6EQ16553 131 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TAZQ16635 292 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1052P-201ENST00000411398 C2orf68Q2NKX9 166 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RAB6CQ53S08 254 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1052P-201ENST00000411398 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1052P-201ENST00000411398 OTPQ5XKR4 325 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PPP4R4Q6NUP7 873 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1052P-201ENST00000411398 BRD3OSQ6XYD6 125 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CCDC149Q6ZUS6 474 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1052P-201ENST00000411398 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SAXO1Q8IYX7 474 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1052P-201ENST00000411398 KIRREL3Q8IZU9 778 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1052P-201ENST00000411398 DNAJC22Q8N4W6 341 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ZBTB2Q8N680 514 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1052P-201ENST00000411398 OLIG1Q8TAK6 271 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1052P-201ENST00000411398 FAM71BQ8TC56 605 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1052P-201ENST00000411398 AFAP1L1Q8TED9 768 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1052P-201ENST00000411398 IMMP1LQ96LU5 166 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SEMA3CQ99985 751 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1052P-201ENST00000411398 OVOL2Q9BRP0 275 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1052P-201ENST00000411398 USP44Q9H0E7 712 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1052P-201ENST00000411398 BRD8Q9H0E9 1235 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SHARPINQ9H0F6 387 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RAB6CQ9H0N0 254 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1052P-201ENST00000411398 C10orf88Q9H8K7 445 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ACKR4Q9NPB9 350 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1052P-201ENST00000411398 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1052P-201ENST00000411398 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PTTG2Q9NZH5 202 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1052P-201ENST00000411398 Q9UF83 564 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1052P-201ENST00000411398 FAM96BQ9Y3D0 163 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1052P-201ENST00000411398 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1052P-201ENST00000411398 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ARID2Q68CP9 1835 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1052P-201ENST00000411398 USP24Q9UPU5 2620 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1052P-201ENST00000411398 GPR179Q6PRD1 2367 aa-0.1□□□□□ -2.42
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-1052P-201ENST00000411398 MTMR11A4FU01 709 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-1052P-201ENST00000411398 MFSD2BA6NFX1 497 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-1052P-201ENST00000411398 EPOPA6NHQ4 379 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-1052P-201ENST00000411398 A8MZ25 164 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-1052P-201ENST00000411398 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-1052P-201ENST00000411398 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ZNF195O14628 629 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TXNL1O43396 289 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NBNO60934 754 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-1052P-201ENST00000411398 DAB1O75553 588 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CDK2AP2O75956 126 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RENP00797 406 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-1052P-201ENST00000411398 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PRKAR1AP10644 381 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PSG2P11465 335 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ACP5P13686 325 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CKMT2P17540 419 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ACHEP22303 614 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-1052P-201ENST00000411398 LHCGRP22888 699 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-1052P-201ENST00000411398 JAK1P23458 1154 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CHRNA3P32297 505 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SHMT1P34896 483 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-1052P-201ENST00000411398 KHKP50053 298 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-1052P-201ENST00000411398 MMP15P51511 669 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CLCN4P51793 760 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CRISP1P54107 249 aa-0.1□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms