RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371746.7

LHX3-201, Transcript of LIM homeobox 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LHX3, Length 2,403 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3-201ENST00000371746 PYCR2Q96C36 320 aa23.24■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 P2RY13Q9BPV8 354 aa23.24■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 GDE1Q9NZC3 331 aa23.24■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 NDUFAF1Q9Y375 327 aa23.24■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 EYSQ5T1H1 3165 aa23.24■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 TBC1D3BA6NDS4 549 aa23.23■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 WNT9AO14904 365 aa23.23■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 LSM1O15116 133 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 TSPAN6O43657 245 aa23.23■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 PAPLNO95428 1278 aa23.23■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 SGO1Q5FBB7 561 aa23.23■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 FBXL19Q6PCT2 694 aa23.23■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 VITQ6UXI7 678 aa23.23■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 TERB1Q8NA31 727 aa23.23■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 HCAR2Q8TDS4 363 aa23.23■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 BRINP2Q9C0B6 783 aa23.23■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 KLQ9UEF7 1012 aa23.23■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 LINC01565O15544 149 aa23.23■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 EPORP19235 508 aa23.23■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 ATP6V1C1P21283 382 aa23.23■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 PSMD8P48556 350 aa23.23■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 RCAN2Q14206 197 aa23.23■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 SLC44A4Q53GD3 710 aa23.23■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa23.23■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 HACD2Q6Y1H2 254 aa23.23■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa23.23■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 OR8D1Q8WZ84 308 aa23.23■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 SPDL1Q96EA4 605 aa23.23■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa23.22■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 SLC22A3O75751 556 aa23.22■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 C8GP07360 202 aa23.22■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 LPCAT4Q643R3 524 aa23.22■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 ROPN1LQ96C74 230 aa23.22■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 ASB9Q96DX5 294 aa23.22■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 TRIM8Q9BZR9 551 aa23.22■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 RAD18Q9NS91 495 aa23.22■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 TMEM181Q9P2C4 612 aa23.22■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa23.22■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 K7ESM1 405 aa23.22■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 FXYD1O00168 92 aa23.22■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 ITGB7P26010 798 aa23.22■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 IL12AP29459 219 aa23.22■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 AP5B1Q2VPB7 878 aa23.22■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 IZUMO2Q6UXV1 221 aa23.22■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 GPR149Q86SP6 731 aa23.22■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 TRIM74Q86UV6 250 aa23.22■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 NUDT8Q8WV74 236 aa23.22■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 FAM129BQ96TA1 746 aa23.22■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 PLXNA2O75051 1894 aa23.22■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 ASPDHA6ND91 283 aa23.21■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 FTH1P02794 183 aa23.21■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 HIST1H2ADP20671 130 aa23.21■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 PREPP48147 710 aa23.21■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 HMGCS1Q01581 520 aa23.21■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 PROKR1Q8TCW9 393 aa23.21■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 ASZ1Q8WWH4 475 aa23.21■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 FOXJ1Q92949 421 aa23.21■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 TIFAQ96CG3 184 aa23.21■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa23.21■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 HIST1H2AJQ99878 128 aa23.21■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 H2AFJQ9BTM1 129 aa23.21■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 TRIM54Q9BYV2 358 aa23.21■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 TMEM245Q9H330 911 aa23.21■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 ZFP14Q9HCL3 533 aa23.21■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 CCL27Q9Y4X3 112 aa23.21■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 AP2A2O94973 939 aa23.21■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 G6PDP11413 515 aa23.21■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 ACADSP16219 412 aa23.21■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 KCNK10P57789 538 aa23.21■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 PTCHD3Q3KNS1 767 aa23.21■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 TIGD2Q4W5G0 525 aa23.21■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 SPATA24Q86W54 205 aa23.21■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 DTD2Q96FN9 168 aa23.21■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 COQ10AQ96MF6 247 aa23.21■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 NTMT1Q9BV86 223 aa23.21■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 SLC32A1Q9H598 525 aa23.21■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 CD300AQ9UGN4 299 aa23.21■■□□□ 1.31
LHX3-201ENST00000371746 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
LHX3-201ENST00000371746 GFYI3L273 518 aa23.2■■□□□ 1.3
LHX3-201ENST00000371746 DNAJA2O60884 412 aa23.2■■□□□ 1.3
LHX3-201ENST00000371746 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
LHX3-201ENST00000371746 MPC1LP0DKB6 136 aa23.2■■□□□ 1.3
LHX3-201ENST00000371746 PEX2P28328 305 aa23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms