RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369862.1

AMIGO1-201, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene AMIGO1, Length 2,229 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-201ENST00000369862 CD247P20963 164 aa23.47■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 ARSFP54793 590 aa23.47■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 SFRP1Q8N474 314 aa23.47■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 FNDC5Q8NAU1 212 aa23.47■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 PDPRQ8NCN5 879 aa23.47■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 MUS81Q96NY9 551 aa23.47■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 BOCQ9BWV1 1114 aa23.47■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 SCN8AQ9UQD0 1980 aa23.46■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 PRMT2P55345 433 aa23.46■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 MOGQ16653 247 aa23.46■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 TRIM60Q495X7 471 aa23.46■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa23.46■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa23.46■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC2A7Q6PXP3 512 aa23.46■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa23.46■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM217AQ8IXS0 508 aa23.46■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 UPK1AO00322 258 aa23.45■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 PRAMEF1O95521 474 aa23.45■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 URODP06132 367 aa23.45■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF12P17014 697 aa23.45■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 ERVPABLB-1P60509 514 aa23.45■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 NFATC3Q12968 1075 aa23.45■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 CNKSR3Q6P9H4 555 aa23.45■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 SBSNQ6UWP8 590 aa23.45■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 SERPINA9Q86WD7 417 aa23.45■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 CDYL2Q8N8U2 506 aa23.45■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 PIF1Q9H611 641 aa23.45■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 OGDHLQ9ULD0 1010 aa23.45■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 RAP2AP10114 183 aa23.45■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 CCNA2P20248 432 aa23.45■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 C21orf59P57076 290 aa23.45■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 CYP4F8P98187 520 aa23.45■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 TUBA3CQ13748 450 aa23.45■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 DAG1Q14118 895 aa23.45■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 BROXQ5VW32 411 aa23.45■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 LETMD1Q6P1Q0 360 aa23.45■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 DLEU7Q6UYE1 221 aa23.45■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 KLHL23Q8NBE8 558 aa23.45■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa23.45■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 ACDQ96AP0 544 aa23.45■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF382Q96SR6 550 aa23.45■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 HEBP1Q9NRV9 189 aa23.45■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 NUDT4Q9NZJ9 180 aa23.45■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 SEC14L2O76054 403 aa23.44■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 ALPLP05186 524 aa23.44■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 ELK4P28324 431 aa23.44■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 XKR5Q6UX68 686 aa23.44■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 DTWD1Q8N5C7 304 aa23.44■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 TANKQ92844 425 aa23.44■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 PLEKHA8Q96JA3 519 aa23.44■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 CIPCQ9C0C6 399 aa23.44■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 FANCEQ9HB96 536 aa23.44■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa23.44■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 PRSS21Q9Y6M0 314 aa23.44■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 ARNTLO00327 626 aa23.44■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 TRBC1P01850 177 aa23.44■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 ITGB6P18564 788 aa23.44■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 MATN1P21941 496 aa23.44■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 UGT1A1P22309 533 aa23.44■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 UGT1A4P22310 534 aa23.44■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 UGT1A3P35503 534 aa23.44■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 UGT1A5P35504 534 aa23.44■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 BNIP3Q12983 259 aa23.44■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 CERS6Q6ZMG9 384 aa23.44■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 Q6ZSR9 355 aa23.44■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 GAREM2Q75VX8 874 aa23.44■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 DDHD1Q8NEL9 900 aa23.44■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 TMBIM1Q969X1 311 aa23.44■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 COX4I2Q96KJ9 171 aa23.44■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 ING2Q9H160 280 aa23.44■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 PALMDQ9NP74 551 aa23.44■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa23.44■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 ST14Q9Y5Y6 855 aa23.44■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa23.43■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 TEX28O15482 410 aa23.43■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 CLDN7O95471 211 aa23.43■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 THRBP10828 461 aa23.43■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 DEFB103AP81534 67 aa23.43■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 ARHGEF6Q15052 776 aa23.43■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 CDKN3Q16667 212 aa23.43■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 ITIH5Q86UX2 942 aa23.43■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 ITFG1Q8TB96 612 aa23.43■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 NRBF2Q96F24 287 aa23.43■■□□□ 1.34
AMIGO1-201ENST00000369862 IL26Q9NPH9 171 aa23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms