RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368916.1

GABPB2-201, Transcript of GA binding protein transcription factor subunit beta 2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene GABPB2, Length 1,680 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB2-201ENST00000368916 NRIP1P48552 1158 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 CLK3P49761 638 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 SCNN1GP51170 649 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 JAG1P78504 1218 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 CDC42EP1Q00587 391 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 GALK2Q01415 458 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 GPAT3Q53EU6 434 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 XKR7Q5GH72 579 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 PITRM1Q5JRX3 1037 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 HECTD2Q5U5R9 776 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 LETMD1Q6P1Q0 360 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 DPH6Q7L8W6 267 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 ZNF438Q7Z4V0 828 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 GPR149Q86SP6 731 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 PIGZQ86VD9 579 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 NPAS3Q8IXF0 933 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 DEPDC4Q8N2C3 294 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 OR56A4Q8NGH8 313 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 OR10T2Q8NGX3 314 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 PHF21BQ96EK2 531 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 C12orf42Q96LP6 360 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 C1orf74Q96LT6 269 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 COL21A1Q96P44 957 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 VPS35Q96QK1 796 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 SIGLEC11Q96RL6 698 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 PITX2Q99697 317 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 GDF15Q99988 308 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 FSD1LQ9BXM9 530 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 CDT1Q9H211 546 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 MFSD1Q9H3U5 465 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 ASAH2Q9NR71 780 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 ADGRE2Q9UHX3 823 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 FKBPLQ9UIM3 349 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 RPS6KA6Q9UK32 745 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 HES2Q9Y543 173 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 MEIOCA2RUB1 952 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 FAM220BPB1ANY3 271 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 CCRL2O00421 344 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 TSPAN1O60635 241 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 KERAO60938 352 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 ERN1O75460 977 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 CCNDBP1O95273 360 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 C1RP00736 705 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 C1QBP02746 253 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 PGK2P07205 417 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 FPR1P21462 350 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 WARSP23381 471 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 CD68P34810 354 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 SLC1A2P43004 574 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 SEPHS1P49903 392 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 CLCNKBP51801 687 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 CACNB3P54284 484 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 NCS1P62166 190 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 RUNX1T1Q06455 604 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 PCDH1Q08174 1060 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 FAPQ12884 760 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 ABRQ12979 859 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 ASAH1Q13510 395 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 AAK1Q2M2I8 961 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 TBRG1Q3YBR2 411 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 PARP15Q460N3 678 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 C4orf48Q5BLP8 95 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 RABL3Q5HYI8 236 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 COLEC12Q5KU26 742 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 CATSPEREQ5SY80 951 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 DCAF15Q66K64 600 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 KDM4DQ6B0I6 523 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 CES5AQ6NT32 575 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 MRNIPQ6NTE8 343 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 ZNF549Q6P9A3 640 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 SPESP1Q6UW49 350 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 CYHR1Q6ZMK1 362 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 ZNF367Q7RTV3 350 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 RNF130Q86XS8 419 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 FAM126BQ8IXS8 530 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 VWA5B2Q8N398 1253 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 STX19Q8N4C7 294 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 DTWD1Q8N5C7 304 aa7.32□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 GDPD1Q8N9F7 314 aa7.32□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms