RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368078.7

CASQ1-201, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASQ1, Length 1,897 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-201ENST00000368078 TM7SF3Q9NS93 570 aa15.03■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 KLC4Q9NSK0 619 aa15.03■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 WWOXQ9NZC7 414 aa15.03■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 GIMAP2Q9UG22 337 aa15.03■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 BTRCQ9Y297 605 aa15.03■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 COL6A3P12111 3177 aa15.02■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 QSOX1O00391 747 aa15.02■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 ATP5HO75947 161 aa15.02■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 MATN4O95460 622 aa15.02■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 C8GP07360 202 aa15.02■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 PPP2CBP62714 309 aa15.02■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 PPP2CAP67775 309 aa15.02■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 SGCGQ13326 291 aa15.02■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 BCL7AQ4VC05 210 aa15.02■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM259Q4ZIN3 620 aa15.02■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 KANK2Q63ZY3 851 aa15.02■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 C11orf96Q7Z7L8 435 aa15.02■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 TWIST2Q8WVJ9 160 aa15.02■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 CCDC28BQ9BUN5 200 aa15.02■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 IPPKQ9H8X2 491 aa15.02■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 PRDM6Q9NQX0 595 aa15.02■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 C2orf42Q9NWW7 574 aa15.02■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 SLC23A2Q9UGH3 650 aa15.02■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 PRDM4Q9UKN5 801 aa15.02■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 CA14Q9ULX7 337 aa15.02■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
CASQ1-201ENST00000368078 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa15.01□□□□□ -0.01
CASQ1-201ENST00000368078 PIP5K1BO14986 540 aa15.01□□□□□ -0.01
CASQ1-201ENST00000368078 SLC31A1O15431 190 aa15.01□□□□□ -0.01
CASQ1-201ENST00000368078 ESRRBO95718 433 aa15.01□□□□□ -0.01
CASQ1-201ENST00000368078 FUCA1P04066 466 aa15.01□□□□□ -0.01
CASQ1-201ENST00000368078 ANXA5P08758 320 aa15.01□□□□□ -0.01
CASQ1-201ENST00000368078 LINC00032P0C843 101 aa15.01□□□□□ -0.01
CASQ1-201ENST00000368078 GLULP15104 373 aa15.01□□□□□ -0.01
CASQ1-201ENST00000368078 GTF2H3Q13889 308 aa15.01□□□□□ -0.01
CASQ1-201ENST00000368078 NFE2L1Q14494 772 aa15.01□□□□□ -0.01
CASQ1-201ENST00000368078 AGERQ15109 404 aa15.01□□□□□ -0.01
CASQ1-201ENST00000368078 LEXMQ3ZCV2 418 aa15.01□□□□□ -0.01
CASQ1-201ENST00000368078 METTL21CQ5VZV1 264 aa15.01□□□□□ -0.01
CASQ1-201ENST00000368078 LETMD1Q6P1Q0 360 aa15.01□□□□□ -0.01
CASQ1-201ENST00000368078 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
CASQ1-201ENST00000368078 NEK10Q6ZWH5 1172 aa15.01□□□□□ -0.01
CASQ1-201ENST00000368078 PYCR2Q96C36 320 aa15.01□□□□□ -0.01
CASQ1-201ENST00000368078 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa15.01□□□□□ -0.01
CASQ1-201ENST00000368078 LOC100653049A0A140TA62 436 aa15.01□□□□□ -0.01
CASQ1-201ENST00000368078 ARHGEF33A8MVX0 844 aa15.01□□□□□ -0.01
CASQ1-201ENST00000368078 VEGFDO43915 354 aa15.01□□□□□ -0.01
CASQ1-201ENST00000368078 KRT34O76011 436 aa15.01□□□□□ -0.01
CASQ1-201ENST00000368078 MLYCDO95822 493 aa15.01□□□□□ -0.01
CASQ1-201ENST00000368078 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
CASQ1-201ENST00000368078 ACADMP11310 421 aa15.01□□□□□ -0.01
CASQ1-201ENST00000368078 GABRG2P18507 467 aa15.01□□□□□ -0.01
CASQ1-201ENST00000368078 HIST1H2ADP20671 130 aa15.01□□□□□ -0.01
CASQ1-201ENST00000368078 ACSL1P33121 698 aa15.01□□□□□ -0.01
CASQ1-201ENST00000368078 TRIM23P36406 574 aa15.01□□□□□ -0.01
CASQ1-201ENST00000368078 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
CASQ1-201ENST00000368078 INHBCP55103 352 aa15.01□□□□□ -0.01
CASQ1-201ENST00000368078 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
CASQ1-201ENST00000368078 EOGTQ5NDL2 527 aa15.01□□□□□ -0.01
CASQ1-201ENST00000368078 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa15.01□□□□□ -0.01
CASQ1-201ENST00000368078 RASGRP3Q8IV61 690 aa15.01□□□□□ -0.01
CASQ1-201ENST00000368078 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa15.01□□□□□ -0.01
CASQ1-201ENST00000368078 CDYL2Q8N8U2 506 aa15.01□□□□□ -0.01
CASQ1-201ENST00000368078 OR4F6Q8NGB9 312 aa15.01□□□□□ -0.01
CASQ1-201ENST00000368078 CEP70Q8NHQ1 597 aa15.01□□□□□ -0.01
CASQ1-201ENST00000368078 ATP6V1E2Q96A05 226 aa15.01□□□□□ -0.01
CASQ1-201ENST00000368078 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa15.01□□□□□ -0.01
CASQ1-201ENST00000368078 HIST1H2AJQ99878 128 aa15.01□□□□□ -0.01
CASQ1-201ENST00000368078 H2AFJQ9BTM1 129 aa15.01□□□□□ -0.01
CASQ1-201ENST00000368078 TEX101Q9BY14 249 aa15.01□□□□□ -0.01
CASQ1-201ENST00000368078 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
CASQ1-201ENST00000368078 ATG10Q9H0Y0 220 aa15.01□□□□□ -0.01
CASQ1-201ENST00000368078 AKTIPQ9H8T0 292 aa15.01□□□□□ -0.01
CASQ1-201ENST00000368078 FBRSQ9HAH7 460 aa15.01□□□□□ -0.01
CASQ1-201ENST00000368078 ARHGEF3Q9NR81 526 aa15.01□□□□□ -0.01
CASQ1-201ENST00000368078 EBF1Q9UH73 591 aa15.01□□□□□ -0.01
CASQ1-201ENST00000368078 MMP17Q9ULZ9 603 aa15.01□□□□□ -0.01
CASQ1-201ENST00000368078 GPR34Q9UPC5 381 aa15.01□□□□□ -0.01
CASQ1-201ENST00000368078 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
CASQ1-201ENST00000368078 CRCPO75575 148 aa15□□□□□ -0.01
CASQ1-201ENST00000368078 STK16O75716 305 aa15□□□□□ -0.01
CASQ1-201ENST00000368078 NQO1P15559 274 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
CASQ1-201ENST00000368078 CALB2P22676 271 aa15□□□□□ -0.01
CASQ1-201ENST00000368078 BDKRB1P46663 353 aa15□□□□□ -0.01
CASQ1-201ENST00000368078 KLF10Q13118 480 aa15□□□□□ -0.01
CASQ1-201ENST00000368078 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP15□□□□□ -0.01
CASQ1-201ENST00000368078 HORMAD1Q86X24 394 aa15□□□□□ -0.01
CASQ1-201ENST00000368078 DDIASQ8IXT1 998 aa15□□□□□ -0.01
CASQ1-201ENST00000368078 C10orf67Q8IYJ2 551 aa15□□□□□ -0.01
CASQ1-201ENST00000368078 SLC22A15Q8IZD6 547 aa15□□□□□ -0.01
CASQ1-201ENST00000368078 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
CASQ1-201ENST00000368078 MCOLN3Q8TDD5 553 aa15□□□□□ -0.01
CASQ1-201ENST00000368078 HMGB4Q8WW32 186 aa15□□□□□ -0.01
CASQ1-201ENST00000368078 C19orf60Q96EN9 201 aa15□□□□□ -0.01
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF382Q96SR6 550 aa15□□□□□ -0.01
CASQ1-201ENST00000368078 TUBB6Q9BUF5 446 aa15□□□□□ -0.01
CASQ1-201ENST00000368078 TRIM54Q9BYV2 358 aa15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms