RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367576.5

LTV1-201, Transcript of LTV1 ribosome biogenesis factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTV1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1-201ENST00000367576 ALG11Q2TAA5 492 aa17.38■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 NEK10Q6ZWH5 1172 aa17.38■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 HID1Q8IV36 788 aa17.38■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 AGR3Q8TD06 166 aa17.38■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 RMI1Q9H9A7 625 aa17.38■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 ASB1Q9Y576 335 aa17.38■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 RASGRP1O95267 797 aa17.37■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 KITP10721 976 aa17.37■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 RCN2Q14257 317 aa17.37■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 CCSMST1Q4G0I0 132 aa17.37■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 UNC50Q53HI1 259 aa17.37■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 ZNF542PQ5EBM4 170 aa17.37■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 ZNF678Q5SXM1 525 aa17.37■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 FAM219BQ5XKK7 198 aa17.37■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 SLC36A4Q6YBV0 504 aa17.37■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 CADM4Q8NFZ8 388 aa17.37■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 WWP1Q9H0M0 922 aa17.37■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 OR52A5Q9H2C5 316 aa17.37■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 ARL15Q9NXU5 204 aa17.37■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 EML5Q05BV3 1969 aa17.37■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 TMEM114B3SHH9 223 aa17.37■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 NDUFAB1O14561 156 aa17.37■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 SUPT7LO94864 414 aa17.37■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 MATN4O95460 622 aa17.37■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 FAM107AO95990 144 aa17.37■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 TDGF1P13385 188 aa17.37■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 IMPDH1P20839 514 aa17.37■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 CYP2A7P20853 494 aa17.37■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 NUDT1P36639 197 aa17.37■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 SRP54P61011 504 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 HERVK_113P63132 956 aa17.37■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 SP140Q13342 867 aa17.37■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 MAMSTRQ6ZN01 415 aa17.37■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 L3HYPDHQ96EM0 354 aa17.37■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 RMDN2Q96LZ7 410 aa17.37■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 SORT1Q99523 831 aa17.37■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 TIMM29Q9BSF4 260 aa17.37■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 SLC12A9Q9BXP2 914 aa17.37■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 ERVK-6Q9BXR3 956 aa17.37■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 PCED1AQ9H1Q7 454 aa17.37■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 PARVBQ9HBI1 364 aa17.37■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 THAP1Q9NVV9 213 aa17.37■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 WWOXQ9NZC7 414 aa17.37■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 ST14Q9Y5Y6 855 aa17.37■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 CCDC189A1A4V9 331 aa17.36■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 GFYI3L273 518 aa17.36■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 KLK8O60259 260 aa17.36■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 WNT1P04628 370 aa17.36■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 MPSTP25325 297 aa17.36■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 RPIAP49247 311 aa17.36■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 CLCNKAP51800 687 aa17.36■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 CDH13P55290 713 aa17.36■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 SETDB1Q15047 1291 aa17.36■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 PDZD3Q86UT5 571 aa17.36■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 RGL4Q8IZJ4 473 aa17.36■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 PPP4R1Q8TF05 950 aa17.36■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 KLHDC7BQ96G42 594 aa17.36■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 FOPNLQ96NB1 174 aa17.36■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 GSTO2Q9H4Y5 243 aa17.36■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 NPHS2Q9NP85 383 aa17.36■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 CATP04040 527 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 SLC35G4P0C7Q5 338 aa17.35■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 AK4P27144 223 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 HSPA7P48741 367 aa17.35■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 METRNLQ641Q3 311 aa17.35■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 C1orf210Q8IVY1 113 aa17.35■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 LSMEM2Q8N112 164 aa17.35■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 PDPRQ8NCN5 879 aa17.35■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 PHC3Q8NDX5 983 aa17.35■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 CCL4L1Q8NHW4 92 aa17.35■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 MCOLN3Q8TDD5 553 aa17.35■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 C7orf26Q96N11 449 aa17.35■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 TMEM79Q9BSE2 394 aa17.35■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 TRIM54Q9BYV2 358 aa17.35■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa17.35■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 DRC3Q9H069 523 aa17.35■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 TMEM168Q9H0V1 697 aa17.35■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 PNPOQ9NVS9 261 aa17.35■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 WDR37Q9Y2I8 494 aa17.35■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa17.35■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 PDZK1P1A8MUH7 402 aa17.35■□□□□ 0.37
LTV1-201ENST00000367576 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms