RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358813.4

CCL20-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 800 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-201ENST00000358813 CLCN3P51790 818 aa5.5□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 RALGDSQ12967 914 aa5.5□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 TUBB2AQ13885 445 aa5.5□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 GIT2Q14161 759 aa5.5□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 LPIN1Q14693 890 aa5.5□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 TYSND1Q2T9J0 566 aa5.5□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 TIGD2Q4W5G0 525 aa5.5□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 NHSL2Q5HYW2 709 aa5.5□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 C6orf141Q5SZD1 244 aa5.5□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 KIAA0895LQ68EN5 471 aa5.5□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 LAIR1Q6GTX8 287 aa5.5□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 ARHGEF19Q8IW93 802 aa5.5□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 TUSC5Q8IXB3 177 aa5.5□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 LMNTD2Q8IXW0 634 aa5.5□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 LRRC43Q8N309 656 aa5.5□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 TMEM105Q8N8V8 129 aa5.5□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 CAMKVQ8NCB2 501 aa5.5□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 FIBINQ8TAL6 211 aa5.5□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 TEKT4Q8WW24 435 aa5.5□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 LPGAT1Q92604 370 aa5.5□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 KRT35Q92764 455 aa5.5□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 ARSGQ96EG1 525 aa5.5□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 P2RY11Q96G91 374 aa5.5□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 CTAGE1Q96RT6 745 aa5.5□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 MGME1Q9BQP7 344 aa5.5□□□□□ -1.53
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CCL20-201ENST00000358813 TUBB2BQ9BVA1 445 aa5.5□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 FAM129AQ9BZQ8 928 aa5.5□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 KRT23Q9C075 422 aa5.5□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 MMP27Q9H306 513 aa5.5□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 COPG2Q9UBF2 871 aa5.5□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 SLC8A2Q9UPR5 921 aa5.5□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 XIRP2A4UGR9 3374 aa5.5□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 CHD9Q3L8U1 2897 aa5.49□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa5.49□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 LNP1A1A4G5 178 aa5.49□□□□□ -1.53
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CCL20-201ENST00000358813 C2CD4DB7Z1M9 353 aa5.49□□□□□ -1.53
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CCL20-201ENST00000358813 ZNF263O14978 683 aa5.49□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 OGG1O15527 345 aa5.49□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 SLC25A17O43808 307 aa5.49□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 B3GALNT1O75752 331 aa5.49□□□□□ -1.53
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CCL20-201ENST00000358813 ELFN1P0C7U0 828 aa5.49□□□□□ -1.53
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CCL20-201ENST00000358813 DRD4P21917 467 aa5.49□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 NR4A1P22736 598 aa5.49□□□□□ -1.53
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CCL20-201ENST00000358813 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa5.49□□□□□ -1.53
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CCL20-201ENST00000358813 ISM2Q6H9L7 571 aa5.49□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 LCTLQ6UWM7 567 aa5.49□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 TAOK1Q7L7X3 1001 aa5.49□□□□□ -1.53
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CCL20-201ENST00000358813 LURAP1LQ8IV03 231 aa5.49□□□□□ -1.53
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CCL20-201ENST00000358813 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa5.49□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 TET1Q8NFU7 2136 aa5.49□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 ZFPM2Q8WW38 1151 aa5.49□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 SEPT1Q8WYJ6 367 aa5.49□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 SUSD6Q92537 303 aa5.49□□□□□ -1.53
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CCL20-201ENST00000358813 Q96MF0 132 aa5.49□□□□□ -1.53
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CCL20-201ENST00000358813 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 CACNG4Q9UBN1 327 aa5.49□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 PADI3Q9ULW8 664 aa5.49□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 MAFFQ9ULX9 164 aa5.49□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 SQORQ9Y6N5 450 aa5.49□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 NLRC5Q86WI3 1866 aa5.49□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 CHD7Q9P2D1 2997 aa5.49□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 ZNF318Q5VUA4 2279 aa5.48□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 A4D1N5 150 aa5.48□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 KLRF2D3W0D1 207 aa5.48□□□□□ -1.53
CCL20-201ENST00000358813 CCDC188H7C350 402 aa5.48□□□□□ -1.53
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