RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 GOLGA8OA6NCC3 632 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 CFAP73A6NFT4 308 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 IGLON5A6NGN9 336 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 OR2AG2A6NM03 316 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 GOLGA8NF8WBI6 632 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 GRID2O43424 1007 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 GPC4O75487 556 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 CRCPO75575 148 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 CHEK2O96017 543 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 ACADMP11310 421 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 GM2AP17900 193 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 CYP2A7P20853 494 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 DRD3P35462 400 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 CCR10P46092 362 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 RPS21P63220 83 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 SP140Q13342 867 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 SYTL3Q4VX76 610 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 AGBL4Q5VU57 503 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 NXNQ6DKJ4 435 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 PNCKQ6P2M8 343 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 KBTBD6Q86V97 674 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 PGBD3Q8N328 593 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 AADATQ8N5Z0 425 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 TRPC4APQ8TEL6 797 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 NAT14Q8WUY8 206 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 ASB11Q8WXH4 323 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM3CQ92520 227 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 ATP6V1E2Q96A05 226 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 KLHL29Q96CT2 875 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 ERLEC1Q96DZ1 483 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 SIPA1Q96FS4 1042 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 FOPNLQ96NB1 174 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 CCT7Q99832 543 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC12A9Q9BXP2 914 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 NUF2Q9BZD4 464 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 NMUR2Q9GZQ4 415 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 GPR34Q9UPC5 381 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 STK38LQ9Y2H1 464 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 F5P12259 2224 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 ANTXRLA6NF34 631 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 AZIN1O14977 448 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 SLCO2B1O94956 709 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 FSBPO95073 299 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 GUCA1CO95843 209 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 EZRP15311 586 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 CALB2P22676 271 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 PRLHRP49683 370 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 HNMTP50135 292 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 HK3P52790 923 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 COPAP53621 1224 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 PKNOX1P55347 436 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 CDKL1Q00532 357 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 TDGQ13569 410 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 GBX1Q14549 363 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 MAP7D1Q3KQU3 841 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 NEK5Q6P3R8 708 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 SBSNQ6UWP8 590 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 USP30Q70CQ3 517 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 TCAIMQ8N3R3 496 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 OR14C36Q8NHC7 312 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 OR2AG1Q9H205 316 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 ARL15Q9NXU5 204 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 DOCK8Q8NF50 2099 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 ANKRD36A6QL64 1941 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 TBC1D3EA0A087X179 549 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A1W2PQF6 199 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 KLHL33A6NCF5 533 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 TBC1D3LB9A6J9 549 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 GFYI3L273 518 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 VPS4BO75351 444 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 ESRRBO95718 433 aa9.9□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms